More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3818 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3818  ABC transporter-related protein  100 
 
 
249 aa  500  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.356438  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0433  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  56.67 
 
 
244 aa  267  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.024543  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4263  ABC transporter related  54.24 
 
 
244 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000111529  hitchhiker  0.0000623883 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0148  ABC transporter related  55.42 
 
 
244 aa  258  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.704024  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3501  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  43.15 
 
 
257 aa  199  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.638418  normal  0.331611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1286  ABC transporter related  42.08 
 
 
246 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3237  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  43.85 
 
 
259 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0314824  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3017  ABC transporter related  43.75 
 
 
239 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.207365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4449  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.33 
 
 
242 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.112692 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  42.4 
 
 
252 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1503  ABC transporter related  41.25 
 
 
246 aa  186  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.560839  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5756  ABC transporter related  41.95 
 
 
236 aa  185  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.638783  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2998  ABC transporter related  40.49 
 
 
274 aa  185  7e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2666  ABC transporter related  43.62 
 
 
240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297517  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3864  ABC transporter related  41.67 
 
 
252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1671  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  46.25 
 
 
248 aa  182  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.513247  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1022  ABC transporter related  40.82 
 
 
255 aa  182  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216915  normal  0.173863 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  42.4 
 
 
256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6572  ABC transporter related  42.8 
 
 
255 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.0683418 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  42.8 
 
 
255 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  42.8 
 
 
255 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4020  ABC transporter related  40.33 
 
 
246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.768317  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0229  histidine kinase  37.6 
 
 
253 aa  179  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1045  ATPase  35.92 
 
 
250 aa  178  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  40.62 
 
 
256 aa  178  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  40.62 
 
 
256 aa  178  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2870  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  39.51 
 
 
278 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0170195  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2791  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.51 
 
 
278 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19161  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  35.92 
 
 
250 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.651174  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1337  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.51 
 
 
278 aa  177  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.932166 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2158  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  41.15 
 
 
278 aa  176  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3319  ABC transporter related  42.86 
 
 
248 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1991  ABC transporter related  40.74 
 
 
265 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.662576  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3727  ABC transporter related  38.68 
 
 
246 aa  176  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141093  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2989  ABC transporter ATP-binding protein  38.55 
 
 
271 aa  175  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.866149 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2310  ABC transporter related  40.49 
 
 
290 aa  175  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1563  ABC transporter related protein  40.59 
 
 
259 aa  175  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29711  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  38.25 
 
 
250 aa  175  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2257  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  39.67 
 
 
506 aa  174  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.968196  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1424  ABC transporter-related protein  39.92 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2775  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  38.4 
 
 
254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1594  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  37.8 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0191  ABC transporter related  39.11 
 
 
280 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  40.33 
 
 
255 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2247  ATPase  38.06 
 
 
251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2617  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  39.92 
 
 
264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0395155 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  38.78 
 
 
253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5582  urea ABC transporter ATP-binding protein UrtD  40.41 
 
 
285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0979  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  39 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64300  putative ATP-binding component of ABC transporter  40.41 
 
 
285 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3205  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.91 
 
 
238 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2865  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  40 
 
 
248 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2792  ABC transporter related protein  41.74 
 
 
248 aa  171  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2497  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  40.74 
 
 
273 aa  171  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0109341  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4075  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 
253 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1956  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.66 
 
 
247 aa  171  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3687  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  40.42 
 
 
262 aa  171  9e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3378  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  40.42 
 
 
262 aa  171  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3569  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  40.42 
 
 
262 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.376374  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1772  ABC transporter related  38 
 
 
247 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3208  ABC transporter related  40.82 
 
 
291 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260719  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4364  ABC transporter-like  38.17 
 
 
246 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.644241  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2972  response regulator receiver domain-containing protein  39.75 
 
 
248 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.85607  normal  0.195493 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2004  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  40.08 
 
 
258 aa  170  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0806  ABC transporter related  38.33 
 
 
241 aa  170  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2593  ABC transporter-related protein  40.17 
 
 
277 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.479665  normal  0.611604 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2563  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.51 
 
 
255 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0657  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.08 
 
 
251 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0596  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  38.25 
 
 
256 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393475  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0223  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  39.33 
 
 
247 aa  169  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0700  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40 
 
 
294 aa  169  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1000  ABC transporter related  37.96 
 
 
292 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3801  ABC transporter related  40.17 
 
 
277 aa  169  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4009  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  38.37 
 
 
292 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1396  ABC transporter related  38.21 
 
 
293 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.299838  normal  0.589236 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4608  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  39.09 
 
 
261 aa  169  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27919  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5509  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  40.42 
 
 
261 aa  168  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4478  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  38.78 
 
 
255 aa  168  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423389  hitchhiker  0.00964914 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00884  ABC transporter-like protein  38.31 
 
 
276 aa  168  8e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7015  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.63 
 
 
253 aa  168  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.61355  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.92 
 
 
247 aa  168  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00618326  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4844  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.31 
 
 
285 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1435  ABC transporter related  40.66 
 
 
278 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.627828  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0298  ABC branched chain amino acid transporter, ATPase subunit  40.16 
 
 
247 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0430613  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4011  ABC transporter, ATPase subunit  41.43 
 
 
285 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0356544  normal  0.416608 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  39.02 
 
 
252 aa  167  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4636  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  38.31 
 
 
285 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.880683  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3461  ABC transporter related  39.51 
 
 
259 aa  166  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2202  ABC transporter  36.25 
 
 
245 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0320051  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4901  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  38.37 
 
 
285 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0221262 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  41.45 
 
 
272 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1942  ABC transporter related  39.75 
 
 
247 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1253  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.74 
 
 
244 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4722  ABC transporter related  38.31 
 
 
285 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.194668  hitchhiker  0.00869396 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3060  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  37.8 
 
 
251 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.963696  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4907  ABC transporter related  41.25 
 
 
266 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3315  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  37.4 
 
 
251 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4429  ABC transporter  37.9 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4188  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  36.21 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3490  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (urea/amide)  37.65 
 
 
251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>