More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4449 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4449  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 242 aa  495  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.112692 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0352  ABC transporter related  51.93 
 
 		 243 aa  252  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2865  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  45 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2257  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  44.81 
 
 		 506 aa  214  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.968196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2247  ATPase  44.58 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3319  ABC transporter related  41.95 
 
 		 248 aa  207  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29711  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  41.53 
 
 		 250 aa  208  8e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4364  ABC transporter-like  41.98 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.644241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1594  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  42.57 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5756  ABC transporter related  44.02 
 
 		 236 aa  204  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.638783  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2743  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  44.26 
 
 		 263 aa  204  9e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1563  ABC transporter related protein  43.83 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0127  ABC transporter related  43.75 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1243 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08851  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  40.25 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4152  ABC transporter related  44.03 
 
 		 286 aa  202  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0806  ABC transporter related  41.95 
 
 		 241 aa  202  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0826  ATPase  39.83 
 
 		 249 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.968088  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2666  ABC transporter related  41.95 
 
 		 240 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297517  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1258  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.28 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.974612  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0657  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.62 
 
 		 251 aa  201  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08831  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  39.83 
 
 		 249 aa  200  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3237  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  45.61 
 
 		 259 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0314824  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3490  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (urea/amide)  42.62 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3205  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.34 
 
 		 238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3017  ABC transporter related  41.28 
 
 		 239 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.207365 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00884  ABC transporter-like protein  43.03 
 
 		 276 aa  198  7.999999999999999e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1820  ABC transporter related protein  40.73 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.257202  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4907  ABC transporter related  42.5 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2202  ABC transporter  40.82 
 
 		 245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0320051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7015  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.91 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.61355  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2617  putative ATP-binding subunit of urea ABC transport system  40.66 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0781803  normal  0.377264 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3507  ABC transporter related  41.63 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0491012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3699  ABC transporter related  41.56 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3142  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  42.26 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4226  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  43.32 
 
 		 257 aa  195  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0369826  normal  0.231992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1772  ABC transporter related  39.84 
 
 		 247 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4188  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  41.15 
 
 		 254 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3864  ABC transporter related  42.8 
 
 		 252 aa  194  9e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2617  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  44.21 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0395155 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1100  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  42.8 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.873778  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1671  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  43.93 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.513247  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2415  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.41 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1991  ABC transporter related  42.21 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.662576  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1797  ABC transporter related  40.82 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131538  normal  0.177117 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19161  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  38.84 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.651174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0191  ABC transporter related  42.62 
 
 		 280 aa  193  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4075  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.49 
 
 		 253 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1045  ATPase  38.84 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3590  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.39 
 
 		 247 aa  192  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4289  ABC transporter related  42.92 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00311988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1286  ABC transporter related  43.57 
 
 		 246 aa  192  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0951  ABC transporter related  42.11 
 
 		 283 aa  192  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0596  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  41.15 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393475  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2989  ABC transporter ATP-binding protein  42.68 
 
 		 271 aa  192  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.866149 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2809  ABC transporter related  41.22 
 
 		 625 aa  192  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194078  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0223  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  42.92 
 
 		 247 aa  192  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0979  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  41.56 
 
 		 254 aa  192  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3115  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  40.74 
 
 		 248 aa  191  8e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.848406  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4187  ABC transporter related  42.15 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1446  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  41.15 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.685432  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0229  histidine kinase  41.1 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0567  ABC transporter related  41.67 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0996  ABC transporter related  41.98 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1255  ABC transporter related  41.67 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  42.91 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1942  ABC transporter related  41.56 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0703  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  42.98 
 
 		 302 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2497  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  41.8 
 
 		 273 aa  189  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0109341  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4888  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 286 aa  188  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0298  ABC branched chain amino acid transporter, ATPase subunit  41.56 
 
 		 247 aa  188  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0430613  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2158  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  41.8 
 
 		 278 aa  188  5.999999999999999e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1503  ABC transporter related  42.74 
 
 		 246 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.560839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1022  ABC transporter related  42.04 
 
 		 255 aa  188  8e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216915  normal  0.173863 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2998  ABC transporter related  41.39 
 
 		 274 aa  187  9e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3315  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  40.68 
 
 		 251 aa  187  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3501  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  42.28 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.638418  normal  0.331611 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1396  ABC transporter related  42.15 
 
 		 293 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.299838  normal  0.589236 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3861  ABC transporter related  40.74 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4009  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  42.15 
 
 		 292 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4429  ABC transporter  42.39 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2791  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.15 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2870  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  41.15 
 
 		 278 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0170195  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1424  ABC transporter-related protein  41.8 
 
 		 268 aa  186  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1337  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.15 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.932166 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3060  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  40.68 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.963696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3818  ABC transporter-related protein  40.33 
 
 		 249 aa  186  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.356438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3569  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  39.51 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.376374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2972  response regulator receiver domain-containing protein  39 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.85607  normal  0.195493 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2310  ABC transporter related  42.98 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2593  ABC transporter-related protein  41.63 
 
 		 277 aa  186  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.479665  normal  0.611604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4636  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  42.39 
 
 		 285 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.880683  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4608  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  42.56 
 
 		 261 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27919  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3378  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  39.09 
 
 		 262 aa  185  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3687  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  39.09 
 
 		 262 aa  185  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  42.11 
 
 		 254 aa  185  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64300  putative ATP-binding component of ABC transporter  42.8 
 
 		 285 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1446  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  42.45 
 
 		 265 aa  185  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000680503 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4901  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  42.68 
 
 		 285 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0221262 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3208  ABC transporter related  43.39 
 
 		 291 aa  184  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5582  urea ABC transporter ATP-binding protein UrtD  42.8 
 
 		 285 aa  184  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>