More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1424 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1424  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 268 aa  548  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2158  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  86.82 
 
 		 278 aa  462  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2497  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  85.27 
 
 		 273 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0109341  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2743  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  81.37 
 
 		 263 aa  444  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1991  ABC transporter related  80.75 
 
 		 265 aa  441  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.662576  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2870  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  74.1 
 
 		 278 aa  418  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0170195  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1337  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  74.1 
 
 		 278 aa  419  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.932166 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2791  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  74.1 
 
 		 278 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0698  ABC transporter related  79.75 
 
 		 280 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4888  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  78.1 
 
 		 286 aa  394  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4429  ABC transporter  78.93 
 
 		 286 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5582  urea ABC transporter ATP-binding protein UrtD  79.34 
 
 		 285 aa  394  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64300  putative ATP-binding component of ABC transporter  79.34 
 
 		 285 aa  394  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0587  ABC transporter-like  78.51 
 
 		 289 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4636  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  79.34 
 
 		 285 aa  387  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.880683  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4844  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  78.1 
 
 		 285 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4901  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  78.1 
 
 		 285 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0221262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4722  ABC transporter related  78.1 
 
 		 285 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.194668  hitchhiker  0.00869396 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1435  ABC transporter related  68.88 
 
 		 278 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.627828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3934  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  69.83 
 
 		 288 aa  333  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2989  ABC transporter ATP-binding protein  66.39 
 
 		 271 aa  327  1.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.866149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3378  ABC transporter related  67.77 
 
 		 291 aa  325  3e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00884  ABC transporter-like protein  63.9 
 
 		 276 aa  320  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0700  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  65.59 
 
 		 294 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1396  ABC transporter related  66.12 
 
 		 293 aa  318  5e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.299838  normal  0.589236 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4009  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  66.12 
 
 		 292 aa  317  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1000  ABC transporter related  66.53 
 
 		 292 aa  317  1e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3208  ABC transporter related  66.53 
 
 		 291 aa  315  3e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3497  ABC transporter-related protein  64.05 
 
 		 292 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0603668  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0191  ABC transporter related  58.67 
 
 		 280 aa  311  7.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2998  ABC transporter related  62.4 
 
 		 274 aa  310  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1022  ABC transporter related  63.22 
 
 		 255 aa  310  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216915  normal  0.173863 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1087  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  65.16 
 
 		 296 aa  307  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0951  ABC transporter related  63.49 
 
 		 283 aa  304  8.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2310  ABC transporter related  59 
 
 		 290 aa  304  9.000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2254  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  63.27 
 
 		 287 aa  299  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2698  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  61 
 
 		 245 aa  299  4e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.358687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3106  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.49 
 
 		 287 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00263887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2562  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.49 
 
 		 287 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143827  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0729  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.49 
 
 		 287 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2179  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, ATP binding protein, putative  64.49 
 
 		 282 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3130  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.49 
 
 		 282 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3070  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.49 
 
 		 282 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2051  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.49 
 
 		 282 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.752246  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3686  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  62.45 
 
 		 287 aa  295  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.14227 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0951  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  62.04 
 
 		 288 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0991  ABC transporter related  56.59 
 
 		 323 aa  293  3e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3315  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  58.66 
 
 		 251 aa  292  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3060  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  60.33 
 
 		 251 aa  290  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.963696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2485  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  62.04 
 
 		 285 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0877  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  62.45 
 
 		 285 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0428  ABC transporter related  62.45 
 
 		 285 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0907  ABC transporter related  62.45 
 
 		 285 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4011  ABC transporter, ATPase subunit  62.04 
 
 		 285 aa  288  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0356544  normal  0.416608 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1501  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.27 
 
 		 287 aa  288  7e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.693839  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4152  ABC transporter related  58.14 
 
 		 286 aa  288  8e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0784  ABC transporter related  61.63 
 
 		 285 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0795  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  61.63 
 
 		 285 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3490  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (urea/amide)  58.47 
 
 		 251 aa  285  7e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1100  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  57.68 
 
 		 276 aa  285  8e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.873778  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1446  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  56.02 
 
 		 265 aa  284  8e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000680503 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4187  ABC transporter related  59.09 
 
 		 250 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7015  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.68 
 
 		 253 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.61355  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2617  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  57.66 
 
 		 264 aa  279  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0395155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4188  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  56.45 
 
 		 254 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4608  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  57.14 
 
 		 261 aa  278  8e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27919  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3507  ABC transporter related  56.85 
 
 		 254 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0491012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3699  ABC transporter related  56.05 
 
 		 252 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2038  ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 287 aa  276  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.6748  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0229  histidine kinase  54.25 
 
 		 253 aa  276  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4226  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  55.02 
 
 		 257 aa  275  4e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0369826  normal  0.231992 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1797  ABC transporter related  56.45 
 
 		 254 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131538  normal  0.177117 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0955  ABC transporter-related protein  62.8 
 
 		 282 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.65307  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0989  ABC transporter related  62.8 
 
 		 282 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1199  ABC transporter related  59.44 
 
 		 265 aa  271  7e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0109496  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1867  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  61.85 
 
 		 283 aa  265  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.449649  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2190  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  61.85 
 
 		 283 aa  265  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.122938 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0996  ABC transporter related  55.97 
 
 		 247 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0298  ABC branched chain amino acid transporter, ATPase subunit  55.97 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0430613  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1942  ABC transporter related  55.56 
 
 		 247 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29711  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  55.1 
 
 		 250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4020  ABC transporter related  56.79 
 
 		 246 aa  258  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.768317  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3864  ABC transporter related  52.63 
 
 		 252 aa  256  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0567  ABC transporter related  51.22 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3861  ABC transporter related  51.63 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3115  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  53.06 
 
 		 248 aa  252  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.848406  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1255  ABC transporter related  51.21 
 
 		 251 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0979  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  49.8 
 
 		 254 aa  251  7e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1594  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  51.43 
 
 		 247 aa  250  1e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3569  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  51.59 
 
 		 262 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.376374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3687  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  51.19 
 
 		 262 aa  250  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3378  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  51.19 
 
 		 262 aa  250  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1820  ABC transporter related protein  47.35 
 
 		 252 aa  249  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.257202  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2247  ATPase  54.51 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1446  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  50.4 
 
 		 251 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.685432  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5509  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  51.85 
 
 		 261 aa  248  7e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.61 
 
 		 247 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00618326  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4075  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.24 
 
 		 253 aa  245  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4907  ABC transporter related  50.39 
 
 		 266 aa  245  4.9999999999999997e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3142  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  49.8 
 
 		 247 aa  245  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>