More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1100 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1100  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  100 
 
 
276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.873778  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00884  ABC transporter-like protein  63.47 
 
 
276 aa  352  4e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2989  ABC transporter ATP-binding protein  65.41 
 
 
271 aa  350  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.866149 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2310  ABC transporter related  65.41 
 
 
290 aa  346  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2998  ABC transporter related  66.27 
 
 
274 aa  343  1e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0951  ABC transporter related  64.73 
 
 
283 aa  331  7.000000000000001e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0700  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  62.5 
 
 
294 aa  323  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0191  ABC transporter related  62.55 
 
 
280 aa  321  9.999999999999999e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1435  ABC transporter related  60.47 
 
 
278 aa  319  3e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.627828  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4009  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  61.48 
 
 
292 aa  313  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1000  ABC transporter related  60.96 
 
 
292 aa  311  6.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3934  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  60.96 
 
 
288 aa  310  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4901  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  61.13 
 
 
285 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0221262 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4636  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  61.54 
 
 
285 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.880683  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4722  ABC transporter related  61.13 
 
 
285 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.194668  hitchhiker  0.00869396 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4844  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  61.13 
 
 
285 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3378  ABC transporter related  60.56 
 
 
291 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1396  ABC transporter related  59.6 
 
 
293 aa  304  9.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.299838  normal  0.589236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4888  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.89 
 
 
286 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3497  ABC transporter-related protein  60.31 
 
 
292 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0603668  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4429  ABC transporter  61.48 
 
 
286 aa  301  9e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3208  ABC transporter related  59.36 
 
 
291 aa  299  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260719  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0698  ABC transporter related  61.13 
 
 
280 aa  299  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1087  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  60.08 
 
 
296 aa  297  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5582  urea ABC transporter ATP-binding protein UrtD  59.6 
 
 
285 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0587  ABC transporter-like  58.85 
 
 
289 aa  296  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2698  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  62.08 
 
 
245 aa  295  6e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.358687  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1022  ABC transporter related  62.24 
 
 
255 aa  295  7e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216915  normal  0.173863 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64300  putative ATP-binding component of ABC transporter  59.2 
 
 
285 aa  295  8e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2158  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  59.75 
 
 
278 aa  287  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3315  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  58.47 
 
 
251 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3060  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  58.06 
 
 
251 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.963696  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0951  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  57.65 
 
 
288 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1424  ABC transporter-related protein  57.68 
 
 
268 aa  285  8e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3686  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  57.65 
 
 
287 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.14227 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2497  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  58.09 
 
 
273 aa  280  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0109341  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3490  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (urea/amide)  57.32 
 
 
251 aa  278  6e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1991  ABC transporter related  57.68 
 
 
265 aa  278  8e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.662576  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2743  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  56.02 
 
 
263 aa  278  9e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1446  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  58.68 
 
 
265 aa  278  9e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000680503 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0229  histidine kinase  58.26 
 
 
253 aa  276  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4187  ABC transporter related  58.92 
 
 
250 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2254  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  57.09 
 
 
287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155048  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4152  ABC transporter related  57.85 
 
 
286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1337  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.02 
 
 
278 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.932166 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2870  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  56.02 
 
 
278 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0170195  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3507  ABC transporter related  58.3 
 
 
254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0491012  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2791  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.02 
 
 
278 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1797  ABC transporter related  58.3 
 
 
254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131538  normal  0.177117 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1501  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.12 
 
 
287 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.693839  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4020  ABC transporter related  56.38 
 
 
246 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.768317  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7015  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.02 
 
 
253 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.61355  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3699  ABC transporter related  57.61 
 
 
252 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4188  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  56.79 
 
 
254 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2562  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.33 
 
 
287 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143827  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2617  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  54.98 
 
 
264 aa  269  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0395155 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3106  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.33 
 
 
287 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00263887  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2257  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  56.22 
 
 
506 aa  269  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.968196  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0729  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.33 
 
 
287 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2051  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.33 
 
 
282 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.752246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3070  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.33 
 
 
282 aa  268  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2179  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, ATP binding protein, putative  54.33 
 
 
282 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3130  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.33 
 
 
282 aa  268  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4608  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  55.97 
 
 
261 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27919  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2485  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  54.72 
 
 
285 aa  266  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2038  ABC transporter ATP-binding protein  55.81 
 
 
287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.6748  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0877  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  54.12 
 
 
285 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0991  ABC transporter related  51.88 
 
 
323 aa  265  4e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0428  ABC transporter related  54.12 
 
 
285 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0907  ABC transporter related  54.12 
 
 
285 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4226  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  55.56 
 
 
257 aa  265  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0369826  normal  0.231992 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4011  ABC transporter, ATPase subunit  54.12 
 
 
285 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0356544  normal  0.416608 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0795  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  53.73 
 
 
285 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0784  ABC transporter related  53.73 
 
 
285 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0996  ABC transporter related  55.56 
 
 
247 aa  261  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1942  ABC transporter related  55.97 
 
 
247 aa  260  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0955  ABC transporter-related protein  56.59 
 
 
282 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.65307  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0298  ABC branched chain amino acid transporter, ATPase subunit  55.56 
 
 
247 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0430613  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29711  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  54.32 
 
 
250 aa  259  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0989  ABC transporter related  57.36 
 
 
282 aa  258  9e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2865  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  54.13 
 
 
248 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4364  ABC transporter-like  54.07 
 
 
246 aa  256  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.644241  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1594  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  52.28 
 
 
247 aa  255  5e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4075  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.19 
 
 
253 aa  254  9e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1772  ABC transporter related  51.87 
 
 
247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0979  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  52.28 
 
 
254 aa  253  3e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3115  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  53.72 
 
 
248 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.848406  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1867  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  56.98 
 
 
283 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.449649  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2190  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  56.98 
 
 
283 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.122938 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3590  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.67 
 
 
247 aa  250  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2247  ATPase  53.69 
 
 
251 aa  249  3e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0127  ABC transporter related  53.69 
 
 
257 aa  249  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1243 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1199  ABC transporter related  52.76 
 
 
265 aa  248  6e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0109496  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0223  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  50.83 
 
 
247 aa  248  9e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1255  ABC transporter related  50.6 
 
 
251 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5671  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  50.21 
 
 
247 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0567  ABC transporter related  48.96 
 
 
247 aa  246  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3735  ABC transporter related  50.21 
 
 
247 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4633  ABC transporter related  50.21 
 
 
247 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.713199  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1671  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  55.28 
 
 
248 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.513247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>