More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4226 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4226  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  100 
 
 		 257 aa  524  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0369826  normal  0.231992 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2989  ABC transporter ATP-binding protein  58.2 
 
 		 271 aa  301  5.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.866149 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00884  ABC transporter-like protein  56.97 
 
 		 276 aa  296  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1022  ABC transporter related  56.5 
 
 		 255 aa  291  7e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216915  normal  0.173863 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0698  ABC transporter related  57.79 
 
 		 280 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2865  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  56.68 
 
 		 248 aa  281  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4364  ABC transporter-like  56.97 
 
 		 246 aa  278  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.644241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2998  ABC transporter related  58.44 
 
 		 274 aa  278  4e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2698  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  56.5 
 
 		 245 aa  278  7e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.358687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4608  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  57.09 
 
 		 261 aa  278  7e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27919  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3490  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (urea/amide)  54.55 
 
 		 251 aa  277  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0951  ABC transporter related  55.74 
 
 		 283 aa  277  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3208  ABC transporter related  56.56 
 
 		 291 aa  276  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260719  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4888  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.38 
 
 		 286 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1435  ABC transporter related  54.73 
 
 		 278 aa  276  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.627828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1446  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  56.85 
 
 		 265 aa  276  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000680503 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1424  ABC transporter-related protein  55.02 
 
 		 268 aa  275  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2617  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  56.28 
 
 		 264 aa  275  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0395155 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2257  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  56.33 
 
 		 506 aa  275  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.968196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3934  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  54.47 
 
 		 288 aa  275  6e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4429  ABC transporter  56.56 
 
 		 286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0191  ABC transporter related  56.79 
 
 		 280 aa  274  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4009  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  56.15 
 
 		 292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64300  putative ATP-binding component of ABC transporter  57.38 
 
 		 285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3497  ABC transporter-related protein  56.15 
 
 		 292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0603668  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4844  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.38 
 
 		 285 aa  272  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4722  ABC transporter related  57.38 
 
 		 285 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.194668  hitchhiker  0.00869396 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4152  ABC transporter related  55.06 
 
 		 286 aa  271  8.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7015  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.47 
 
 		 253 aa  271  8.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.61355  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5582  urea ABC transporter ATP-binding protein UrtD  56.56 
 
 		 285 aa  270  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3378  ABC transporter related  55.33 
 
 		 291 aa  270  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4901  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  56.97 
 
 		 285 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0221262 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1000  ABC transporter related  55.33 
 
 		 292 aa  270  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0587  ABC transporter-like  55.74 
 
 		 289 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1396  ABC transporter related  54.51 
 
 		 293 aa  269  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.299838  normal  0.589236 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4636  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  56.97 
 
 		 285 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.880683  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4187  ABC transporter related  55.33 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0229  histidine kinase  51.97 
 
 		 253 aa  265  4e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1991  ABC transporter related  54.62 
 
 		 265 aa  265  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.662576  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1100  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  55.56 
 
 		 276 aa  265  4e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.873778  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2158  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  54.03 
 
 		 278 aa  265  5.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2497  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  53.63 
 
 		 273 aa  263  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0109341  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3507  ABC transporter related  53.75 
 
 		 254 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0491012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0700  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.82 
 
 		 294 aa  263  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1087  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  54.51 
 
 		 296 aa  262  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0127  ABC transporter related  54.73 
 
 		 257 aa  261  4.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1243 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3315  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  52.61 
 
 		 251 aa  261  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1942  ABC transporter related  53.66 
 
 		 247 aa  261  8e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4188  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  52.17 
 
 		 254 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3060  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  52.82 
 
 		 251 aa  259  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.963696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1797  ABC transporter related  52.96 
 
 		 254 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131538  normal  0.177117 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3699  ABC transporter related  52.96 
 
 		 252 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0298  ABC branched chain amino acid transporter, ATPase subunit  53.25 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0430613  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1337  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.87 
 
 		 278 aa  257  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.932166 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2791  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.87 
 
 		 278 aa  257  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2870  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  52.87 
 
 		 278 aa  257  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0170195  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4020  ABC transporter related  53.06 
 
 		 246 aa  256  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.768317  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0996  ABC transporter related  52.03 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2310  ABC transporter related  54.73 
 
 		 290 aa  256  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0567  ABC transporter related  50.81 
 
 		 247 aa  255  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1772  ABC transporter related  49.59 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2743  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  51.01 
 
 		 263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2254  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  52.24 
 
 		 287 aa  251  6e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1594  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  51.22 
 
 		 247 aa  250  1e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3142  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  50.81 
 
 		 247 aa  249  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0223  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  51.22 
 
 		 247 aa  249  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4907  ABC transporter related  51.81 
 
 		 266 aa  248  8e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.42 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00618326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3861  ABC transporter related  48.43 
 
 		 251 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0951  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  51.84 
 
 		 288 aa  246  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1255  ABC transporter related  48.82 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1446  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  48.43 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.685432  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3590  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.41 
 
 		 247 aa  246  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2972  response regulator receiver domain-containing protein  48.4 
 
 		 248 aa  246  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.85607  normal  0.195493 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3686  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.84 
 
 		 287 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.14227 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1258  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 		 250 aa  244  6.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.974612  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29711  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  50.2 
 
 		 250 aa  244  8e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0979  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  50.2 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2247  ATPase  52.03 
 
 		 251 aa  242  3e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4633  ABC transporter related  51.01 
 
 		 247 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.713199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5671  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  51.01 
 
 		 247 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3735  ABC transporter related  51.01 
 
 		 247 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4011  ABC transporter, ATPase subunit  50.61 
 
 		 285 aa  241  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0356544  normal  0.416608 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0907  ABC transporter related  50.61 
 
 		 285 aa  241  9e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0657  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.04 
 
 		 251 aa  241  9e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2562  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.43 
 
 		 287 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143827  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3106  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.43 
 
 		 287 aa  241  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00263887  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0877  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  50.61 
 
 		 285 aa  241  9e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0428  ABC transporter related  50.61 
 
 		 285 aa  241  9e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0729  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.43 
 
 		 287 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2179  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, ATP binding protein, putative  51.43 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3130  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.43 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2051  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.43 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.752246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3070  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.43 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4075  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1199  ABC transporter related  51 
 
 		 265 aa  238  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0109496  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3115  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  50.2 
 
 		 248 aa  238  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.848406  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3569  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  48.59 
 
 		 262 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.376374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2485  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  49.8 
 
 		 285 aa  237  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19161  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  48.78 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.651174  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>