More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_29711 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_29711  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  100 
 
 
250 aa  507  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2247  ATPase  81.45 
 
 
251 aa  411  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19161  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  75.4 
 
 
250 aa  374  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.651174  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1045  ATPase  75 
 
 
250 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0826  ATPase  70.49 
 
 
249 aa  344  7e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.968088  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08831  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  70.08 
 
 
249 aa  340  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08851  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  69.26 
 
 
249 aa  338  5.9999999999999996e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2617  putative ATP-binding subunit of urea ABC transport system  62.1 
 
 
249 aa  321  8e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0781803  normal  0.377264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2865  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  60.25 
 
 
248 aa  301  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4364  ABC transporter-like  57.55 
 
 
246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.644241  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0127  ABC transporter related  56.15 
 
 
257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1243 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2257  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  57.96 
 
 
506 aa  280  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.968196  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2998  ABC transporter related  56.91 
 
 
274 aa  270  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0951  ABC transporter related  55.06 
 
 
283 aa  265  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7015  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.92 
 
 
253 aa  265  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.61355  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4429  ABC transporter  57.2 
 
 
286 aa  265  7e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1435  ABC transporter related  56.97 
 
 
278 aa  264  8.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.627828  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1022  ABC transporter related  54.96 
 
 
255 aa  263  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216915  normal  0.173863 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0587  ABC transporter-like  56.15 
 
 
289 aa  263  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4901  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  56.2 
 
 
285 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0221262 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2698  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  53.94 
 
 
245 aa  263  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.358687  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2617  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  53.66 
 
 
264 aa  262  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0395155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0700  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.44 
 
 
294 aa  262  4e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4608  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  53.25 
 
 
261 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27919  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4844  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.2 
 
 
285 aa  261  6e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4888  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.97 
 
 
286 aa  261  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4722  ABC transporter related  56.2 
 
 
285 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.194668  hitchhiker  0.00869396 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4020  ABC transporter related  54.69 
 
 
246 aa  260  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.768317  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1446  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  55.92 
 
 
265 aa  260  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000680503 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2310  ABC transporter related  54.47 
 
 
290 aa  260  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1000  ABC transporter related  54.55 
 
 
292 aa  259  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4636  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  55.37 
 
 
285 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.880683  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3490  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (urea/amide)  54.47 
 
 
251 aa  259  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1797  ABC transporter related  55.28 
 
 
254 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131538  normal  0.177117 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1100  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  54.32 
 
 
276 aa  259  3e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.873778  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1424  ABC transporter-related protein  55.1 
 
 
268 aa  258  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3507  ABC transporter related  54.88 
 
 
254 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0491012  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2989  ABC transporter ATP-binding protein  54.51 
 
 
271 aa  257  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.866149 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0698  ABC transporter related  55.37 
 
 
280 aa  257  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4152  ABC transporter related  54.07 
 
 
286 aa  257  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00884  ABC transporter-like protein  54.55 
 
 
276 aa  256  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4187  ABC transporter related  54.96 
 
 
250 aa  256  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64300  putative ATP-binding component of ABC transporter  54.96 
 
 
285 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4009  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  54.13 
 
 
292 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1396  ABC transporter related  53.72 
 
 
293 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.299838  normal  0.589236 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4188  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  53.25 
 
 
254 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5582  urea ABC transporter ATP-binding protein UrtD  54.55 
 
 
285 aa  255  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3315  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  54.51 
 
 
251 aa  255  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0191  ABC transporter related  55.47 
 
 
280 aa  254  7e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2743  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  52.44 
 
 
263 aa  253  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3060  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  54.51 
 
 
251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.963696  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3699  ABC transporter related  54.07 
 
 
252 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3497  ABC transporter-related protein  54.13 
 
 
292 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0603668  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3934  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  55.1 
 
 
288 aa  251  7e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0223  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  48.97 
 
 
247 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2497  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  53.06 
 
 
273 aa  250  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0109341  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3208  ABC transporter related  54.96 
 
 
291 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260719  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1991  ABC transporter related  52.24 
 
 
265 aa  249  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.662576  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2158  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  53.06 
 
 
278 aa  249  3e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3378  ABC transporter related  53.72 
 
 
291 aa  249  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3237  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  54.25 
 
 
259 aa  249  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0314824  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0996  ABC transporter related  51.84 
 
 
247 aa  248  8e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2791  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.28 
 
 
278 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2870  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  53.28 
 
 
278 aa  247  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0170195  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1337  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.28 
 
 
278 aa  248  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.932166 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0229  histidine kinase  50.21 
 
 
253 aa  246  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1671  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  51.63 
 
 
248 aa  245  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.513247  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1594  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  49.79 
 
 
247 aa  245  4e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0298  ABC branched chain amino acid transporter, ATPase subunit  51.84 
 
 
247 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0430613  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1942  ABC transporter related  51.43 
 
 
247 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4226  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  50.2 
 
 
257 aa  244  6.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0369826  normal  0.231992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0657  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.5 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1820  ABC transporter related protein  45.82 
 
 
252 aa  243  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.257202  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2202  ABC transporter  49.18 
 
 
245 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0320051  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4907  ABC transporter related  52.07 
 
 
266 aa  241  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0567  ABC transporter related  47.74 
 
 
247 aa  241  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.15 
 
 
247 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00618326  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1087  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  53.28 
 
 
296 aa  239  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1255  ABC transporter related  47.5 
 
 
251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1446  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  47.5 
 
 
251 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.685432  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2415  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.77 
 
 
245 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3142  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  47.33 
 
 
247 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3861  ABC transporter related  47.08 
 
 
251 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5671  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  47.74 
 
 
247 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3735  ABC transporter related  47.74 
 
 
247 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4633  ABC transporter related  47.74 
 
 
247 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.713199  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3115  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  49.38 
 
 
248 aa  235  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.848406  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3864  ABC transporter related  49.58 
 
 
252 aa  235  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2775  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  46.34 
 
 
254 aa  234  8e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2038  ABC transporter ATP-binding protein  53.82 
 
 
287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.6748  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3070  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.42 
 
 
282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4075  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.77 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2179  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, ATP binding protein, putative  52.42 
 
 
282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3130  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.42 
 
 
282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3106  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.42 
 
 
287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00263887  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0729  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.42 
 
 
287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2051  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.42 
 
 
282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.752246  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2562  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.42 
 
 
287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143827  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1772  ABC transporter related  47.35 
 
 
247 aa  233  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5509  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  47.5 
 
 
261 aa  232  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>