More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3205 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3205  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 238 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2666  ABC transporter related  87.76 
 
 		 240 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297517  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3017  ABC transporter related  84.39 
 
 		 239 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.207365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3319  ABC transporter related  74.15 
 
 		 248 aa  353  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4289  ABC transporter related  60.5 
 
 		 239 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00311988 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0806  ABC transporter related  55.08 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5756  ABC transporter related  54.24 
 
 		 236 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.638783  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1563  ABC transporter related protein  48.73 
 
 		 259 aa  237  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2310  ABC transporter related  44.63 
 
 		 290 aa  202  5e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1797  ABC transporter related  43.03 
 
 		 254 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131538  normal  0.177117 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1503  ABC transporter related  43.32 
 
 		 246 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.560839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5671  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  44.13 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3735  ABC transporter related  44.13 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4633  ABC transporter related  44.13 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.713199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1956  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.98 
 
 		 247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4907  ABC transporter related  42.56 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3507  ABC transporter related  42.62 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0491012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4449  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.34 
 
 		 242 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.112692 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  45.42 
 
 		 252 aa  198  7e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4188  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  41.8 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2989  ABC transporter ATP-binding protein  44.13 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.866149 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2998  ABC transporter related  40.64 
 
 		 274 aa  196  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0567  ABC transporter related  42 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  43.15 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.55 
 
 		 247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00618326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2497  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  45.49 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0109341  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  43.15 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2415  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 245 aa  195  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3699  ABC transporter related  41.39 
 
 		 252 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2158  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  45.08 
 
 		 278 aa  194  9e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4888  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.67 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2202  ABC transporter  42.74 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0320051  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4844  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.67 
 
 		 285 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7015  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.74 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.61355  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4722  ABC transporter related  43.67 
 
 		 285 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.194668  hitchhiker  0.00869396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0698  ABC transporter related  42.86 
 
 		 280 aa  193  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1286  ABC transporter related  42.11 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0223  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  41.67 
 
 		 247 aa  192  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0951  ABC transporter related  43.72 
 
 		 283 aa  192  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2004  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  44.86 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3501  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  42.5 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.638418  normal  0.331611 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4429  ABC transporter  43.27 
 
 		 286 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4009  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  43.03 
 
 		 292 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4901  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  43.27 
 
 		 285 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0221262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5582  urea ABC transporter ATP-binding protein UrtD  44.49 
 
 		 285 aa  191  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4226  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  42.68 
 
 		 257 aa  191  8e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0369826  normal  0.231992 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1253  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.8 
 
 		 244 aa  191  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64300  putative ATP-binding component of ABC transporter  44.08 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1991  ABC transporter related  44.67 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.662576  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1000  ABC transporter related  42.62 
 
 		 292 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4636  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  43.27 
 
 		 285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.880683  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1396  ABC transporter related  42.21 
 
 		 293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.299838  normal  0.589236 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1100  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  43.9 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.873778  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0587  ABC transporter-like  42.45 
 
 		 289 aa  188  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2972  response regulator receiver domain-containing protein  40.66 
 
 		 248 aa  189  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.85607  normal  0.195493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1047  ABC transporter related  43.09 
 
 		 244 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1424  ABC transporter-related protein  43.85 
 
 		 268 aa  187  9e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00884  ABC transporter-like protein  41.98 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3590  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0700  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.77 
 
 		 294 aa  186  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3142  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  38.87 
 
 		 247 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0191  ABC transporter related  40.41 
 
 		 280 aa  186  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  45.78 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2743  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  42.62 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4152  ABC transporter related  42.62 
 
 		 286 aa  185  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2698  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  40.91 
 
 		 245 aa  185  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.358687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1022  ABC transporter related  42.21 
 
 		 255 aa  185  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216915  normal  0.173863 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3497  ABC transporter-related protein  41.8 
 
 		 292 aa  184  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0603668  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2865  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  40.66 
 
 		 248 aa  184  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4075  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.25 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4364  ABC transporter-like  41.32 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.644241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2257  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  41.56 
 
 		 506 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.968196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1772  ABC transporter related  38.17 
 
 		 247 aa  182  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1258  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 250 aa  182  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.974612  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29711  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  40.57 
 
 		 250 aa  182  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1045  ATPase  40.24 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0352  ABC transporter related  40.43 
 
 		 243 aa  182  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1671  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  43.44 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.513247  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19161  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  40.24 
 
 		 250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.651174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1594  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  39.42 
 
 		 247 aa  181  7e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0944  ABC transporter related  41.87 
 
 		 244 aa  181  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3208  ABC transporter related  43.03 
 
 		 291 aa  181  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  39.84 
 
 		 253 aa  181  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2775  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  42.56 
 
 		 254 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0657  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.25 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  39.45 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  40.4 
 
 		 255 aa  179  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0127  ABC transporter related  39.42 
 
 		 257 aa  179  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4608  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  42.21 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27919  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  38.67 
 
 		 264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3864  ABC transporter related  41.91 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.39 
 
 		 250 aa  179  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  39.6 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.8 
 
 		 250 aa  178  5.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 257 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1435  ABC transporter related  41.98 
 
 		 278 aa  178  7e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.627828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0951  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  41.3 
 
 		 288 aa  178  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2247  ATPase  40.74 
 
 		 251 aa  178  8e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3424  ABC transporter related  39.43 
 
 		 255 aa  177  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2617  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  42.39 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0395155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>