More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5756 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5756  ABC transporter related  100 
 
 		 236 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.638783  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0806  ABC transporter related  67.22 
 
 		 241 aa  322  3e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2666  ABC transporter related  52.99 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297517  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3205  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.24 
 
 		 238 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3319  ABC transporter related  52.54 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3017  ABC transporter related  52.14 
 
 		 239 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.207365 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4289  ABC transporter related  50.85 
 
 		 239 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00311988 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1253  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.08 
 
 		 244 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1563  ABC transporter related protein  45.3 
 
 		 259 aa  216  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4449  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.02 
 
 		 242 aa  204  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.112692 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2865  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  43.98 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7015  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.08 
 
 		 253 aa  195  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.61355  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3501  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  43.21 
 
 		 257 aa  195  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.638418  normal  0.331611 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4907  ABC transporter related  44.81 
 
 		 266 aa  194  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4364  ABC transporter-like  43.21 
 
 		 246 aa  191  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.644241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0657  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.21 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0944  ABC transporter related  42.92 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29711  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  41.46 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1671  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  43.85 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.513247  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3699  ABC transporter related  40.98 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3507  ABC transporter related  42.29 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0491012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2775  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  40.08 
 
 		 254 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2247  ATPase  43.03 
 
 		 251 aa  188  7e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2257  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  41.74 
 
 		 506 aa  187  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.968196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1797  ABC transporter related  41.9 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131538  normal  0.177117 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1772  ABC transporter related  39.83 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2989  ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 		 271 aa  186  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.866149 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4188  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  39.92 
 
 		 254 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0127  ABC transporter related  42.32 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1243 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1503  ABC transporter related  42.56 
 
 		 246 aa  185  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.560839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3818  ABC transporter-related protein  41.95 
 
 		 249 aa  185  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.356438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1047  ABC transporter related  42.32 
 
 		 244 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1286  ABC transporter related  42.98 
 
 		 246 aa  184  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4226  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  42.91 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0369826  normal  0.231992 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4020  ABC transporter related  43.32 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.768317  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.66 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00618326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00884  ABC transporter-like protein  43.1 
 
 		 276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2314  ABC transporter related  41.06 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4009  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  45.92 
 
 		 292 aa  182  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3142  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  39.58 
 
 		 247 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3864  ABC transporter related  40.25 
 
 		 252 aa  182  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  41.7 
 
 		 254 aa  182  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  42.11 
 
 		 254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2972  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.85607  normal  0.195493 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1396  ABC transporter related  45.06 
 
 		 293 aa  182  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.299838  normal  0.589236 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0951  ABC transporter related  41.37 
 
 		 283 aa  181  9.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4075  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.25 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2004  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  39.67 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  39.59 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1000  ABC transporter related  45.11 
 
 		 292 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1446  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  40.91 
 
 		 251 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.685432  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1258  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.37 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.974612  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0223  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  39.36 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0229  histidine kinase  40.24 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1820  ABC transporter related protein  38.11 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.257202  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3237  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  42.92 
 
 		 259 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0314824  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 271 aa  178  7e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1594  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  38.59 
 
 		 247 aa  178  8e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  38.78 
 
 		 254 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5671  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  40.41 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2698  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  40.65 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.358687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3735  ABC transporter related  40.41 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4633  ABC transporter related  40.41 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.713199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0700  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.33 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0826  ATPase  41.4 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.968088  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3569  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  39.42 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.376374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0567  ABC transporter related  39 
 
 		 247 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3590  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 		 247 aa  176  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3861  ABC transporter related  40.08 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2310  ABC transporter related  43.53 
 
 		 290 aa  176  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1255  ABC transporter related  40.5 
 
 		 251 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  38.37 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4152  ABC transporter related  41.22 
 
 		 286 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3497  ABC transporter-related protein  44.49 
 
 		 292 aa  176  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0603668  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0996  ABC transporter related  42.11 
 
 		 247 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 254 aa  175  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2202  ABC transporter  40.25 
 
 		 245 aa  175  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0320051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1022  ABC transporter related  41.2 
 
 		 255 aa  175  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216915  normal  0.173863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3687  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  39 
 
 		 262 aa  175  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3378  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  39 
 
 		 262 aa  175  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4636  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  41.39 
 
 		 285 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.880683  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0352  ABC transporter related  38.3 
 
 		 243 aa  175  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0979  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  38.59 
 
 		 254 aa  174  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0298  ABC branched chain amino acid transporter, ATPase subunit  41.7 
 
 		 247 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0430613  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4901  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  42.21 
 
 		 285 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0221262 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  42.62 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08851  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  40.93 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2998  ABC transporter related  41.49 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0191  ABC transporter related  39.34 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1942  ABC transporter related  41.7 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  38.8 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5509  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  39.34 
 
 		 261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  41.56 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2718  ABC transporter related  41.38 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3115  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  39.42 
 
 		 248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.848406  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  39.92 
 
 		 268 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0991  ABC transporter related  41.42 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2415  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.25 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4722  ABC transporter related  41.39 
 
 		 285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.194668  hitchhiker  0.00869396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>