More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2257 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2257  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  100 
 
 
506 aa  1024    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.968196  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4364  ABC transporter-like  79.59 
 
 
246 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.644241  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2865  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  80.33 
 
 
248 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0127  ABC transporter related  70.98 
 
 
257 aa  365  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1243 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2247  ATPase  60.25 
 
 
251 aa  288  2e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29711  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  57.96 
 
 
250 aa  279  7e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2617  putative ATP-binding subunit of urea ABC transport system  55.69 
 
 
249 aa  276  6e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0781803  normal  0.377264 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2998  ABC transporter related  58.37 
 
 
274 aa  276  7e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0191  ABC transporter related  56.73 
 
 
280 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4226  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  56.33 
 
 
257 aa  275  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0369826  normal  0.231992 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19161  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  56.5 
 
 
250 aa  273  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.651174  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1045  ATPase  56.5 
 
 
250 aa  273  6e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2310  ABC transporter related  56.97 
 
 
290 aa  272  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2989  ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 
271 aa  270  5e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.866149 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1100  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  56.22 
 
 
276 aa  269  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.873778  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4187  ABC transporter related  57.02 
 
 
250 aa  268  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00884  ABC transporter-like protein  56.61 
 
 
276 aa  266  4e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0979  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  54.77 
 
 
254 aa  266  5e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3115  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  55.6 
 
 
248 aa  266  7e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.848406  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0951  ABC transporter related  55.95 
 
 
283 aa  266  8.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3490  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (urea/amide)  55.97 
 
 
251 aa  265  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1446  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  53.53 
 
 
251 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.685432  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4429  ABC transporter  57.55 
 
 
286 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3315  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  57.02 
 
 
251 aa  262  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4888  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 
286 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3060  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  57.02 
 
 
251 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.963696  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1435  ABC transporter related  56.85 
 
 
278 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.627828  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1594  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  52.7 
 
 
247 aa  261  3e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3861  ABC transporter related  52.28 
 
 
251 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0587  ABC transporter-like  55.92 
 
 
289 aa  259  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4901  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  55.92 
 
 
285 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0221262 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1772  ABC transporter related  51.87 
 
 
247 aa  258  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3497  ABC transporter-related protein  56.33 
 
 
292 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0603668  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1255  ABC transporter related  52.7 
 
 
251 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0567  ABC transporter related  51.45 
 
 
247 aa  257  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4009  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  55.1 
 
 
292 aa  256  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0223  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  52.08 
 
 
247 aa  256  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1022  ABC transporter related  54.13 
 
 
255 aa  256  8e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216915  normal  0.173863 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4844  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.51 
 
 
285 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1820  ABC transporter related protein  51.01 
 
 
252 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.257202  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1396  ABC transporter related  55.1 
 
 
293 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.299838  normal  0.589236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4722  ABC transporter related  55.51 
 
 
285 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.194668  hitchhiker  0.00869396 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3590  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.08 
 
 
247 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08851  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  53.69 
 
 
249 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2202  ABC transporter  51.02 
 
 
245 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0320051  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4152  ABC transporter related  53.66 
 
 
286 aa  254  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0657  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.28 
 
 
251 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4636  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  55.51 
 
 
285 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.880683  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08831  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  54.07 
 
 
249 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0229  histidine kinase  52.48 
 
 
253 aa  253  5.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0698  ABC transporter related  56.33 
 
 
280 aa  253  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4075  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.24 
 
 
253 aa  253  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3687  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  51.87 
 
 
262 aa  253  7e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3378  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  51.87 
 
 
262 aa  253  7e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1000  ABC transporter related  54.29 
 
 
292 aa  252  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2415  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.2 
 
 
245 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5509  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  51.87 
 
 
261 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0826  ATPase  53.28 
 
 
249 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.968088  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3699  ABC transporter related  55.14 
 
 
252 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3569  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  51.87 
 
 
262 aa  251  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.376374  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0596  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  51.04 
 
 
256 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393475  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.45 
 
 
247 aa  251  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00618326  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3864  ABC transporter related  51.87 
 
 
252 aa  250  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3934  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  55.37 
 
 
288 aa  250  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2972  response regulator receiver domain-containing protein  51.67 
 
 
248 aa  249  8e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.85607  normal  0.195493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7015  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.87 
 
 
253 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.61355  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1446  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  54.51 
 
 
265 aa  247  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000680503 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0700  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52 
 
 
294 aa  247  4e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3208  ABC transporter related  53.88 
 
 
291 aa  247  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260719  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3378  ABC transporter related  53.88 
 
 
291 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3507  ABC transporter related  53.06 
 
 
254 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0491012  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5582  urea ABC transporter ATP-binding protein UrtD  55.1 
 
 
285 aa  246  9e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5671  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  51.44 
 
 
247 aa  246  9e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3735  ABC transporter related  51.44 
 
 
247 aa  246  9e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4633  ABC transporter related  51.44 
 
 
247 aa  246  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.713199  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1797  ABC transporter related  53.06 
 
 
254 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131538  normal  0.177117 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4907  ABC transporter related  50.82 
 
 
266 aa  245  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1671  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  53.11 
 
 
248 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.513247  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3237  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  53.5 
 
 
259 aa  244  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0314824  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3142  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  49.17 
 
 
247 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64300  putative ATP-binding component of ABC transporter  54.29 
 
 
285 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2698  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  52.28 
 
 
245 aa  243  6e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.358687  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1087  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  54.51 
 
 
296 aa  243  7e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4188  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  52.24 
 
 
254 aa  242  9e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2617  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  49.59 
 
 
264 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0395155 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1991  ABC transporter related  52.48 
 
 
265 aa  241  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.662576  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2743  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  51.65 
 
 
263 aa  240  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4020  ABC transporter related  49.38 
 
 
246 aa  240  5.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.768317  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2791  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.07 
 
 
278 aa  239  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1337  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.07 
 
 
278 aa  239  9e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.932166 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1424  ABC transporter-related protein  52.48 
 
 
268 aa  239  9e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2158  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  52.48 
 
 
278 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2870  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  52.07 
 
 
278 aa  239  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0170195  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4608  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  51.03 
 
 
261 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27919  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0991  ABC transporter related  51.87 
 
 
323 aa  238  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2497  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  52.07 
 
 
273 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0109341  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0951  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  52.42 
 
 
288 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1258  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.19 
 
 
250 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.974612  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1199  ABC transporter related  50.4 
 
 
265 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0109496  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1956  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.12 
 
 
247 aa  233  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>