150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1140 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1140  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
605 aa  1178    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1345  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 
332 aa  96.7  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1641  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.52 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.55 
 
 
1676 aa  77  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 
573 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 
833 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.86 
 
 
758 aa  71.2  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  21.54 
 
 
573 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.52 
 
 
1694 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  25.82 
 
 
594 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  22.74 
 
 
568 aa  65.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 
1276 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.14 
 
 
586 aa  64.7  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 
927 aa  63.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  22.1 
 
 
730 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.47 
 
 
707 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 
592 aa  63.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  25.54 
 
 
593 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 
409 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.29 
 
 
594 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 
592 aa  61.6  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 
543 aa  61.2  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  24.06 
 
 
837 aa  60.5  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 
750 aa  59.3  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  20.46 
 
 
1067 aa  59.3  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 
562 aa  59.3  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 
409 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.87 
 
 
2240 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  21.83 
 
 
402 aa  58.5  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 
409 aa  58.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.72 
 
 
566 aa  58.9  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 
375 aa  57.4  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  23.18 
 
 
711 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 
4079 aa  56.6  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2201  Tfp pilus assembly protein PilF-like  23.94 
 
 
542 aa  56.2  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  25.36 
 
 
936 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.09 
 
 
466 aa  55.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  23.61 
 
 
1013 aa  54.7  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  22.92 
 
 
436 aa  54.7  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.92 
 
 
265 aa  54.3  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  22.84 
 
 
565 aa  53.9  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 
258 aa  53.9  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
617 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  22.76 
 
 
366 aa  53.5  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 
344 aa  53.5  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  30.61 
 
 
583 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 
265 aa  53.5  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 
245 aa  52.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  26.38 
 
 
750 aa  52  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  29.75 
 
 
593 aa  52  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 
602 aa  52.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  22.13 
 
 
543 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  24.3 
 
 
314 aa  52  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40924  predicted protein  28.11 
 
 
375 aa  51.6  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.458934  normal  0.213634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  20.16 
 
 
832 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  24.51 
 
 
369 aa  51.2  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2672  TPR domain-containing protein  31.4 
 
 
446 aa  50.8  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.306988  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.77 
 
 
220 aa  51.2  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  26.16 
 
 
564 aa  50.8  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0275  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 
587 aa  50.4  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  21.41 
 
 
668 aa  50.4  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 
466 aa  50.8  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0420  TPR-domain containing protein  22.95 
 
 
791 aa  50.4  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0428  TPR domain-containing protein  26.8 
 
 
246 aa  50.4  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.562836  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.04 
 
 
1979 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
279 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.47 
 
 
878 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  22.37 
 
 
804 aa  50.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  22.41 
 
 
579 aa  50.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 
572 aa  50.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  22.47 
 
 
573 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 
589 aa  49.3  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 
3035 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 
1297 aa  49.7  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 
425 aa  49.7  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  22.9 
 
 
619 aa  48.9  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 
446 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  21.64 
 
 
356 aa  48.5  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 
607 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.12 
 
 
222 aa  48.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1609  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 
194 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.994867  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  23.82 
 
 
745 aa  48.1  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  21.64 
 
 
2145 aa  47.8  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1281  TPR repeat-containing protein  21.97 
 
 
816 aa  47.8  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 
687 aa  47.8  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  25.58 
 
 
425 aa  47.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 
634 aa  47.8  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  20 
 
 
1737 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  21.53 
 
 
428 aa  47.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
566 aa  47.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.02 
 
 
784 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  21.64 
 
 
467 aa  47.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 
512 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
617 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.99 
 
 
610 aa  47  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  21.81 
 
 
4489 aa  47.4  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  23.33 
 
 
1238 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.56 
 
 
572 aa  47  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  26.73 
 
 
669 aa  46.6  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.1 
 
 
619 aa  47  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>