184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1401 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1401  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 
714 aa  1433    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1250  hypothetical protein  35.89 
 
 
690 aa  326  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5223  Fusaric acid resistance protein conserved region  36.31 
 
 
678 aa  317  5e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0716017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5298  Fusaric acid resistance protein conserved region  35.59 
 
 
678 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.812245  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4756  fusaric acid resistance protein region  35.71 
 
 
678 aa  312  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361861  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0484  fusaric acid resistance protein region  34.67 
 
 
679 aa  283  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.122808  normal  0.212474 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  29.1 
 
 
673 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  29.1 
 
 
673 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  29.1 
 
 
673 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  27.62 
 
 
676 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  28.9 
 
 
676 aa  157  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  27.64 
 
 
731 aa  157  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  29.06 
 
 
664 aa  157  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  28.57 
 
 
676 aa  157  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6856  fusaric acid resistance protein  25.72 
 
 
700 aa  153  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  25.07 
 
 
730 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  28.51 
 
 
713 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  24.6 
 
 
726 aa  147  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  27.09 
 
 
726 aa  147  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  28.74 
 
 
664 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1808  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.63 
 
 
742 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  27.36 
 
 
725 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  27.9 
 
 
725 aa  135  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  27.13 
 
 
725 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  25.75 
 
 
725 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  25.75 
 
 
725 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  27.09 
 
 
744 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  30.48 
 
 
679 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  24.92 
 
 
733 aa  129  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  25.44 
 
 
733 aa  125  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  26.08 
 
 
676 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.59 
 
 
653 aa  125  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  27.38 
 
 
724 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  28.39 
 
 
697 aa  123  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  27.04 
 
 
711 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  27.03 
 
 
736 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  30.14 
 
 
662 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  39.43 
 
 
732 aa  122  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  39.18 
 
 
731 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.83 
 
 
722 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  41.22 
 
 
731 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  26.74 
 
 
724 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  24.79 
 
 
733 aa  118  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  24.79 
 
 
733 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  24.79 
 
 
733 aa  118  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  24.79 
 
 
733 aa  118  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  24.81 
 
 
733 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  24.79 
 
 
733 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  24.79 
 
 
733 aa  118  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  27.05 
 
 
662 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4155  hypothetical protein  28.48 
 
 
672 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0306653  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.26 
 
 
699 aa  117  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  24.81 
 
 
733 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4279  putative fusaric acid resistance protein  26.9 
 
 
728 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  26.56 
 
 
662 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  25 
 
 
734 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  26.6 
 
 
727 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  26.91 
 
 
662 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1306  fusaric acid resistance protein region  26.12 
 
 
644 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.389506  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  23.72 
 
 
733 aa  109  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  39.22 
 
 
728 aa  108  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  38.56 
 
 
729 aa  108  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  25.64 
 
 
695 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1682  fusaric acid resistance protein  26.26 
 
 
727 aa  107  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158795  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  27.65 
 
 
698 aa  106  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  25.09 
 
 
691 aa  107  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5715  fusaric acid resistance protein region  25.93 
 
 
661 aa  106  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0277565 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4286  fusaric acid resistance protein region  26.43 
 
 
727 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.566792 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  23.84 
 
 
670 aa  106  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.53 
 
 
672 aa  105  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  26.52 
 
 
695 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0396  aromatic acid (fusaric acid) exporter, (ArAE)family  37.65 
 
 
727 aa  105  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48340  hypothetical protein  27.26 
 
 
679 aa  104  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00973423  normal  0.112211 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2360  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.21 
 
 
639 aa  104  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5713  fusaric acid resistance protein region  26.62 
 
 
750 aa  103  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  0.787817 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.67 
 
 
739 aa  103  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  39.37 
 
 
679 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  36.67 
 
 
670 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  25.48 
 
 
687 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.91 
 
 
688 aa  101  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  23.99 
 
 
704 aa  100  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  25.48 
 
 
695 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.27 
 
 
641 aa  99.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  25.9 
 
 
695 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5952  membrane protein  24.23 
 
 
623 aa  99.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  29.29 
 
 
734 aa  98.6  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  26.69 
 
 
691 aa  98.2  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  26.8 
 
 
659 aa  98.2  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  23.67 
 
 
702 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.64 
 
 
692 aa  96.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1540  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.16 
 
 
683 aa  97.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  26.42 
 
 
679 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  30.53 
 
 
734 aa  95.1  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  30.53 
 
 
734 aa  95.1  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4042  fusaric acid resistance protein region  34.01 
 
 
727 aa  94.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4324  fusaric acid resistance protein region  34.01 
 
 
727 aa  94.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3197  fusaric acid resistance protein region  34.01 
 
 
727 aa  94.7  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.25 
 
 
680 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1647  fusaric acid resistance domain-containing protein  31.02 
 
 
743 aa  92.8  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6015  fusaric acid resistance protein region  26.29 
 
 
713 aa  91.7  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>