215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6015 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  68.85 
 
 
700 aa  964    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7722  fusaric acid resistance protein  93.27 
 
 
710 aa  1267    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  67.32 
 
 
718 aa  947    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6148  fusaric acid resistance protein region  90.74 
 
 
710 aa  1213    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.623711 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  68.96 
 
 
700 aa  969    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5771  fusaric acid resistance protein region  97.91 
 
 
719 aa  1288    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6657  fusaric acid resistance protein region  93.27 
 
 
707 aa  1238    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5813  fusaric acid resistance protein region  93.55 
 
 
707 aa  1241    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142587  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6015  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 
713 aa  1417    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6177  fusaric acid resistance protein region  93.55 
 
 
707 aa  1241    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717344  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  46.81 
 
 
695 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  46.67 
 
 
695 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  46.67 
 
 
695 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  45.3 
 
 
687 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  46.32 
 
 
695 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3618  hypothetical protein  46.22 
 
 
688 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.94953  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3378  fusaric acid resistance protein region  46.02 
 
 
695 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926577  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  46.58 
 
 
659 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  44.02 
 
 
691 aa  526  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  44.76 
 
 
687 aa  503  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  41.52 
 
 
682 aa  428  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  37.61 
 
 
679 aa  386  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  38.96 
 
 
680 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  34.91 
 
 
698 aa  362  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  35.27 
 
 
697 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  38.96 
 
 
679 aa  355  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  35.7 
 
 
670 aa  346  7e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  36.57 
 
 
680 aa  343  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  33.8 
 
 
681 aa  332  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  35.37 
 
 
688 aa  331  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4098  efflux transporter  35.71 
 
 
693 aa  327  7e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870113  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  35.32 
 
 
672 aa  326  8.000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2406  fusaric acid resistance protein region  37.13 
 
 
690 aa  324  4e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.69 
 
 
692 aa  307  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  33.17 
 
 
702 aa  287  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  32.44 
 
 
713 aa  282  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.92 
 
 
697 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  31.39 
 
 
704 aa  263  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0110  fusaric acid resistance protein, putative  29.65 
 
 
749 aa  248  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3170  fusaric acid resistance protein region  29.25 
 
 
716 aa  243  7.999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.841968 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  50 
 
 
625 aa  241  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.05 
 
 
653 aa  239  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  29.05 
 
 
699 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  27.6 
 
 
679 aa  156  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  24.14 
 
 
670 aa  144  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  26.74 
 
 
724 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  27.33 
 
 
726 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  27.13 
 
 
734 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  27.45 
 
 
734 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  27.45 
 
 
734 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  27.45 
 
 
734 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  27.19 
 
 
724 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  27.54 
 
 
733 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  28.39 
 
 
733 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  26.27 
 
 
691 aa  137  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  26.86 
 
 
744 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  26.65 
 
 
727 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3501  fusaric acid resistance protein region  42.64 
 
 
639 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.46 
 
 
722 aa  134  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  27.2 
 
 
736 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  26.82 
 
 
733 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  25.75 
 
 
730 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  25.33 
 
 
711 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  41.61 
 
 
664 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  28.29 
 
 
733 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  27.11 
 
 
731 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.21 
 
 
699 aa  129  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.68 
 
 
739 aa  128  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  26.6 
 
 
733 aa  127  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  26.6 
 
 
733 aa  127  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  26.6 
 
 
733 aa  127  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  26.6 
 
 
733 aa  127  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  26.6 
 
 
733 aa  127  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  26.6 
 
 
733 aa  127  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  26.6 
 
 
733 aa  127  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  39.75 
 
 
664 aa  126  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  28.01 
 
 
732 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1611  fusaric acid resistance domain-containing protein  26.69 
 
 
679 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.461133  normal  0.751418 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1902  fusaric acid resistance domain-containing protein  26.69 
 
 
679 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.48277  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4042  fusaric acid resistance protein region  28.16 
 
 
727 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4324  fusaric acid resistance protein region  28.16 
 
 
727 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1551  fusaric acid resistance domain protein  26.69 
 
 
679 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.06 
 
 
653 aa  119  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  25.78 
 
 
725 aa  119  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3197  fusaric acid resistance protein region  27.97 
 
 
727 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1733  fusaric acid resistance domain protein  26.69 
 
 
679 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105287  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.3 
 
 
655 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  25.09 
 
 
725 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.26 
 
 
655 aa  117  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  25.09 
 
 
725 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1647  fusaric acid resistance domain-containing protein  26.35 
 
 
743 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  24.77 
 
 
725 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0466  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.12 
 
 
655 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0466  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.12 
 
 
655 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4213  fusaric acid resistance protein region  27.97 
 
 
726 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260755 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.12 
 
 
655 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.12 
 
 
655 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3723  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.12 
 
 
655 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1682  fusaric acid resistance protein  27.5 
 
 
727 aa  115  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158795  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  30.08 
 
 
726 aa  114  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>