208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0171 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  70.16 
 
 		 695 aa  972    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3618  hypothetical protein  73.15 
 
 		 688 aa  979    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.94953  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3378  fusaric acid resistance protein region  73.99 
 
 		 695 aa  1006    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 		 687 aa  1382    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  70.73 
 
 		 695 aa  959    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  70.59 
 
 		 695 aa  978    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  70.16 
 
 		 695 aa  971    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  47.1 
 
 		 700 aa  590  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  46.21 
 
 		 718 aa  580  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  46.6 
 
 		 700 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7722  fusaric acid resistance protein  45.82 
 
 		 710 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6015  fusaric acid resistance protein region  44.88 
 
 		 713 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6148  fusaric acid resistance protein region  45.47 
 
 		 710 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.623711 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5813  fusaric acid resistance protein region  45.3 
 
 		 707 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142587  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5771  fusaric acid resistance protein region  46.32 
 
 		 719 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6177  fusaric acid resistance protein region  45.3 
 
 		 707 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6657  fusaric acid resistance protein region  45.3 
 
 		 707 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  39.49 
 
 		 659 aa  433  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  39.04 
 
 		 691 aa  416  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  40.33 
 
 		 687 aa  405  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  35.7 
 
 		 625 aa  369  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  36.42 
 
 		 682 aa  364  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.04 
 
 		 679 aa  325  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  32.33 
 
 		 670 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.43 
 
 		 680 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4098  efflux transporter  35.79 
 
 		 693 aa  303  7.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870113  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  33.8 
 
 		 698 aa  287  4e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  32.92 
 
 		 692 aa  287  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  32 
 
 		 672 aa  287  5e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  32.18 
 
 		 697 aa  285  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2406  fusaric acid resistance protein region  32.35 
 
 		 690 aa  280  7e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  33.28 
 
 		 679 aa  279  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  32.15 
 
 		 681 aa  274  4.0000000000000004e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.4 
 
 		 688 aa  267  5.999999999999999e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.46 
 
 		 680 aa  264  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.55 
 
 		 697 aa  239  9e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  29.2 
 
 		 713 aa  223  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0110  fusaric acid resistance protein, putative  29.64 
 
 		 749 aa  211  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  28.25 
 
 		 702 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  27.66 
 
 		 704 aa  205  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3170  fusaric acid resistance protein region  27.3 
 
 		 716 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.841968 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.17 
 
 		 653 aa  189  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  28.16 
 
 		 664 aa  157  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  27.31 
 
 		 664 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  26.39 
 
 		 676 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  24.21 
 
 		 670 aa  137  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  25.72 
 
 		 699 aa  136  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  27.01 
 
 		 662 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3501  fusaric acid resistance protein region  31.07 
 
 		 639 aa  130  9.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  26.76 
 
 		 662 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  25.36 
 
 		 726 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  26.36 
 
 		 662 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  26.38 
 
 		 726 aa  129  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  25.05 
 
 		 730 aa  127  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  26.53 
 
 		 676 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  25.09 
 
 		 734 aa  125  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  25.09 
 
 		 734 aa  125  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  25.09 
 
 		 734 aa  125  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.58 
 
 		 722 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  25.49 
 
 		 711 aa  121  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  23.38 
 
 		 691 aa  122  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  26.74 
 
 		 673 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  26.74 
 
 		 673 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  26.74 
 
 		 673 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  24.62 
 
 		 724 aa  120  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  24.86 
 
 		 725 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  24.86 
 
 		 725 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.05 
 
 		 739 aa  118  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3627  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.1 
 
 		 655 aa  117  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.35242  normal  0.2133 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.1 
 
 		 655 aa  117  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.374606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.1 
 
 		 655 aa  117  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.269228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3555  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.1 
 
 		 655 aa  117  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  24.86 
 
 		 725 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  25.19 
 
 		 728 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  24.4 
 
 		 734 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  24.86 
 
 		 733 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  24.51 
 
 		 727 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  25.4 
 
 		 676 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0466  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.53 
 
 		 655 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  23.76 
 
 		 729 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  26.42 
 
 		 736 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3662  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.1 
 
 		 655 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  24.45 
 
 		 733 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0466  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.53 
 
 		 655 aa  115  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.53 
 
 		 655 aa  115  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3723  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.53 
 
 		 655 aa  115  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  24.41 
 
 		 724 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.53 
 
 		 655 aa  115  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.36 
 
 		 655 aa  115  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  25.26 
 
 		 744 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  24.68 
 
 		 725 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1802  fusaric acid resistance protein region  24.39 
 
 		 677 aa  114  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  24.79 
 
 		 733 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.53 
 
 		 655 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1551  fusaric acid resistance domain protein  25.28 
 
 		 679 aa  114  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03100  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  23.36 
 
 		 655 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  25.1 
 
 		 733 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03051  hypothetical protein  23.36 
 
 		 655 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  24.58 
 
 		 733 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  25.4 
 
 		 676 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>