213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0176 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 		 695 aa  1401    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3618  hypothetical protein  70.25 
 
 		 688 aa  956    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.94953  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3378  fusaric acid resistance protein region  70.11 
 
 		 695 aa  963    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  70.16 
 
 		 687 aa  972    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  94.82 
 
 		 695 aa  1318    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  97.12 
 
 		 695 aa  1365    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  99.57 
 
 		 695 aa  1396    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  47.91 
 
 		 700 aa  601  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  47.59 
 
 		 700 aa  593  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7722  fusaric acid resistance protein  47.06 
 
 		 710 aa  569  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6148  fusaric acid resistance protein region  47.35 
 
 		 710 aa  567  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.623711 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  49.06 
 
 		 718 aa  568  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6657  fusaric acid resistance protein region  47.9 
 
 		 707 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5813  fusaric acid resistance protein region  48.05 
 
 		 707 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6177  fusaric acid resistance protein region  48.05 
 
 		 707 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6015  fusaric acid resistance protein region  46.25 
 
 		 713 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5771  fusaric acid resistance protein region  48.15 
 
 		 719 aa  554  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  39.26 
 
 		 659 aa  439  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  41.1 
 
 		 687 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  37.48 
 
 		 691 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  38.36 
 
 		 682 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  34.64 
 
 		 625 aa  348  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.58 
 
 		 679 aa  330  7e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4098  efflux transporter  36.95 
 
 		 693 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870113  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  33.65 
 
 		 698 aa  311  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.19 
 
 		 670 aa  306  7e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.33 
 
 		 672 aa  306  7e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.88 
 
 		 680 aa  302  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  32.41 
 
 		 697 aa  300  6e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  32.38 
 
 		 681 aa  281  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  35.44 
 
 		 679 aa  280  8e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.8 
 
 		 680 aa  279  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2406  fusaric acid resistance protein region  34.67 
 
 		 690 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  32.09 
 
 		 688 aa  269  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.53 
 
 		 692 aa  267  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  29.29 
 
 		 713 aa  239  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  28.53 
 
 		 702 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3501  fusaric acid resistance protein region  32.39 
 
 		 639 aa  221  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.96 
 
 		 697 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  29.19 
 
 		 704 aa  216  9e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3170  fusaric acid resistance protein region  27.79 
 
 		 716 aa  203  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.841968 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.69 
 
 		 653 aa  192  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  27.27 
 
 		 676 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  26.52 
 
 		 662 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  27.08 
 
 		 662 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  25.45 
 
 		 670 aa  137  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  25.79 
 
 		 662 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  27.26 
 
 		 679 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0110  fusaric acid resistance protein, putative  32.34 
 
 		 749 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  42.38 
 
 		 664 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  25 
 
 		 726 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  41.06 
 
 		 664 aa  127  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  26.72 
 
 		 679 aa  126  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  25.34 
 
 		 699 aa  125  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  24.62 
 
 		 691 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  26.5 
 
 		 726 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  26.95 
 
 		 676 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  27.73 
 
 		 673 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  27.73 
 
 		 673 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  27.73 
 
 		 673 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.367852 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03100  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  22.57 
 
 		 655 aa  115  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3723  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  22.57 
 
 		 655 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03051  hypothetical protein  22.57 
 
 		 655 aa  115  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  22.57 
 
 		 655 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0466  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  22.57 
 
 		 655 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.165029 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0466  Fusaric acid resistance protein conserved region  22.57 
 
 		 655 aa  114  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  22.57 
 
 		 655 aa  114  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  22.39 
 
 		 655 aa  114  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.36 
 
 		 699 aa  114  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  22.57 
 
 		 655 aa  114  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  25.21 
 
 		 744 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  25.36 
 
 		 736 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3555  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  21.38 
 
 		 655 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  21.38 
 
 		 655 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.269228 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  21.38 
 
 		 655 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.374606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3627  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  21.38 
 
 		 655 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.35242  normal  0.2133 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3662  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  21.38 
 
 		 655 aa  111  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  25.61 
 
 		 724 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6856  fusaric acid resistance protein  25.33 
 
 		 700 aa  110  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3677  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  22.8 
 
 		 655 aa  109  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  25.39 
 
 		 724 aa  109  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1551  fusaric acid resistance domain protein  23.18 
 
 		 679 aa  107  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  26.15 
 
 		 728 aa  106  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.1 
 
 		 722 aa  107  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.97 
 
 		 739 aa  107  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  25.29 
 
 		 725 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1902  fusaric acid resistance domain-containing protein  23.18 
 
 		 679 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.48277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1611  fusaric acid resistance domain-containing protein  23.18 
 
 		 679 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.461133  normal  0.751418 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0264  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.06 
 
 		 662 aa  106  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1733  fusaric acid resistance domain protein  23.18 
 
 		 679 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105287  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  25.29 
 
 		 725 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3197  fusaric acid resistance protein region  28.43 
 
 		 727 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  39.88 
 
 		 662 aa  105  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1837  fusaric acid resistance domain protein  24.91 
 
 		 670 aa  105  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235624  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0485  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  21.87 
 
 		 651 aa  104  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0421  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  21.87 
 
 		 651 aa  104  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1175  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  21.87 
 
 		 651 aa  104  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193331 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1553  fusaric acid resistance domain-containing protein  25.21 
 
 		 670 aa  104  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.266646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  24.91 
 
 		 727 aa  103  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  25.52 
 
 		 730 aa  103  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>