213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6177 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6657  fusaric acid resistance protein region  99.43 
 
 
707 aa  1399    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  66.44 
 
 
718 aa  939    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7722  fusaric acid resistance protein  93.8 
 
 
710 aa  1275    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6148  fusaric acid resistance protein region  91.13 
 
 
710 aa  1216    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.623711 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  68.88 
 
 
700 aa  963    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5813  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 
707 aa  1407    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142587  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6015  fusaric acid resistance protein region  93.83 
 
 
713 aa  1269    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6177  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 
707 aa  1407    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717344  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  69.05 
 
 
700 aa  964    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5771  fusaric acid resistance protein region  92.63 
 
 
719 aa  1250    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  47.61 
 
 
695 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  47.53 
 
 
695 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  47.46 
 
 
695 aa  591  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  47.4 
 
 
695 aa  591  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3618  hypothetical protein  46.77 
 
 
688 aa  571  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.94953  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  44.74 
 
 
687 aa  571  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3378  fusaric acid resistance protein region  46.1 
 
 
695 aa  561  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926577  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  44.38 
 
 
691 aa  528  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  44.54 
 
 
659 aa  522  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  45.58 
 
 
687 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  40.23 
 
 
682 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  38.4 
 
 
680 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  37.93 
 
 
679 aa  382  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  35.32 
 
 
698 aa  365  1e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  35.32 
 
 
697 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  39.66 
 
 
679 aa  357  5.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  37.09 
 
 
680 aa  352  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  36.1 
 
 
670 aa  347  5e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  34.27 
 
 
681 aa  332  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  35.95 
 
 
672 aa  327  4.0000000000000003e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4098  efflux transporter  35.92 
 
 
693 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870113  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.32 
 
 
688 aa  325  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2406  fusaric acid resistance protein region  37.45 
 
 
690 aa  325  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  35.63 
 
 
692 aa  313  9e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  33.06 
 
 
702 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  32.61 
 
 
713 aa  280  5e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.54 
 
 
697 aa  280  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  31.55 
 
 
704 aa  268  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0110  fusaric acid resistance protein, putative  29.78 
 
 
749 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3170  fusaric acid resistance protein region  29.73 
 
 
716 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.841968 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  32.94 
 
 
653 aa  242  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  50.4 
 
 
625 aa  241  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  29.52 
 
 
699 aa  183  9.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  27.55 
 
 
679 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  27.73 
 
 
726 aa  153  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  24.32 
 
 
670 aa  146  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  26.34 
 
 
724 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  26.63 
 
 
724 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.02 
 
 
722 aa  137  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  26.31 
 
 
691 aa  136  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3501  fusaric acid resistance protein region  32.98 
 
 
639 aa  136  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  27.26 
 
 
734 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  27.26 
 
 
734 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  27.26 
 
 
734 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  27.32 
 
 
734 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  27.25 
 
 
733 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  27.17 
 
 
733 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  26.16 
 
 
727 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  27.12 
 
 
733 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  26.24 
 
 
744 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.55 
 
 
699 aa  131  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  26.57 
 
 
736 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  40.37 
 
 
664 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  27.49 
 
 
733 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  27.01 
 
 
733 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  27.01 
 
 
733 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  27.01 
 
 
733 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  27.01 
 
 
733 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  27.01 
 
 
733 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.05 
 
 
739 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  27.01 
 
 
733 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  27.01 
 
 
733 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  25.46 
 
 
711 aa  127  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  38.51 
 
 
664 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  25.73 
 
 
731 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1611  fusaric acid resistance domain-containing protein  26.32 
 
 
679 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.461133  normal  0.751418 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1551  fusaric acid resistance domain protein  26.32 
 
 
679 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1902  fusaric acid resistance domain-containing protein  26.32 
 
 
679 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.48277  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.06 
 
 
655 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1733  fusaric acid resistance domain protein  26.32 
 
 
679 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105287  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.93 
 
 
655 aa  119  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0466  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.61 
 
 
655 aa  117  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.61 
 
 
655 aa  117  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0466  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.61 
 
 
655 aa  117  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1538  fusaric acid resistance domain protein  26.32 
 
 
679 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0513426  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3723  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.61 
 
 
655 aa  117  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03100  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  23.43 
 
 
655 aa  117  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.06 
 
 
653 aa  117  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03051  hypothetical protein  23.43 
 
 
655 aa  117  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.61 
 
 
655 aa  117  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  25.21 
 
 
725 aa  116  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3739  fusaric acid resistance protein region  26.88 
 
 
726 aa  114  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.7262  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  29.66 
 
 
726 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  23.93 
 
 
731 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6856  fusaric acid resistance protein  26.92 
 
 
700 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  23.72 
 
 
731 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  33.18 
 
 
730 aa  112  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  25.8 
 
 
732 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  25.28 
 
 
725 aa  111  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  25.33 
 
 
725 aa  111  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>