193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4639 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  56.13 
 
 
725 aa  778    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  55.56 
 
 
728 aa  731    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  56.74 
 
 
729 aa  764    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  55.98 
 
 
725 aa  778    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  56.24 
 
 
730 aa  786    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  66.15 
 
 
731 aa  917    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  98.48 
 
 
731 aa  1432    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  66.34 
 
 
725 aa  934    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  56.13 
 
 
725 aa  778    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  66.01 
 
 
731 aa  914    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 
732 aa  1466    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  56.68 
 
 
725 aa  783    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  48.29 
 
 
734 aa  634  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  48.71 
 
 
733 aa  634  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  48.49 
 
 
733 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  47.71 
 
 
744 aa  625  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  48.21 
 
 
736 aa  617  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  48.07 
 
 
734 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  47.93 
 
 
734 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  47.93 
 
 
734 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  48.2 
 
 
739 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  47.04 
 
 
733 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  47.04 
 
 
733 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  47.04 
 
 
733 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  47.04 
 
 
733 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  47.04 
 
 
733 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  47.04 
 
 
733 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  47.04 
 
 
733 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  48.64 
 
 
733 aa  599  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  46.9 
 
 
733 aa  595  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  39.38 
 
 
726 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  39.01 
 
 
722 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4213  fusaric acid resistance protein region  38.46 
 
 
726 aa  439  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260755 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3739  fusaric acid resistance protein region  38.32 
 
 
726 aa  438  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.7262  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4042  fusaric acid resistance protein region  38.66 
 
 
727 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4324  fusaric acid resistance protein region  38.66 
 
 
727 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1110  putative fusaric acid resistance protein  38.96 
 
 
745 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.853894  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1024  putative fusaric acid resistance protein  38.96 
 
 
745 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0595  fusaric acid resistance domain-containing protein  38.96 
 
 
745 aa  432  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2328  fusaric acid resistance domain-containing protein  38.96 
 
 
745 aa  432  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0873  fusaric acid resistance domain-containing protein  38.96 
 
 
745 aa  432  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1840  fusaric acid resistance domain-containing protein  38.96 
 
 
745 aa  432  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3197  fusaric acid resistance protein region  38.68 
 
 
727 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4286  fusaric acid resistance protein region  38.72 
 
 
727 aa  429  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.566792 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1682  fusaric acid resistance protein  38.4 
 
 
727 aa  426  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158795  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1647  fusaric acid resistance domain-containing protein  39.44 
 
 
743 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0396  aromatic acid (fusaric acid) exporter, (ArAE)family  37.55 
 
 
727 aa  398  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  34.67 
 
 
726 aa  371  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  31.76 
 
 
727 aa  319  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4279  putative fusaric acid resistance protein  31.84 
 
 
728 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1863  hypothetical protein  39.95 
 
 
411 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5713  fusaric acid resistance protein region  27.11 
 
 
750 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  0.787817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  30.24 
 
 
664 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  29.9 
 
 
676 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  29.15 
 
 
676 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  29.28 
 
 
673 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  29.28 
 
 
673 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  29.28 
 
 
673 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.33 
 
 
653 aa  160  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  29.49 
 
 
676 aa  158  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  28.27 
 
 
676 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.02 
 
 
688 aa  151  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  26.31 
 
 
713 aa  150  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  30.15 
 
 
662 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0484  fusaric acid resistance protein region  29.48 
 
 
679 aa  150  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.122808  normal  0.212474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  29.3 
 
 
662 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2636  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.21 
 
 
741 aa  145  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.52 
 
 
672 aa  144  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  28.4 
 
 
702 aa  144  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.82 
 
 
670 aa  144  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  50.34 
 
 
664 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  28.18 
 
 
704 aa  141  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  26.53 
 
 
691 aa  141  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  30.67 
 
 
699 aa  139  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.89 
 
 
697 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.99 
 
 
700 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5223  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.07 
 
 
678 aa  135  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0716017 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  29.15 
 
 
662 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  26.27 
 
 
700 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1250  hypothetical protein  26.84 
 
 
690 aa  132  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  27.77 
 
 
724 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  27 
 
 
699 aa  131  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  24.86 
 
 
698 aa  130  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  34.48 
 
 
724 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  26.04 
 
 
670 aa  128  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  25.21 
 
 
697 aa  127  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  30.93 
 
 
662 aa  127  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48340  hypothetical protein  30.07 
 
 
679 aa  125  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00973423  normal  0.112211 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1401  fusaric acid resistance protein region  39.43 
 
 
714 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7722  fusaric acid resistance protein  26.47 
 
 
710 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  27.12 
 
 
718 aa  118  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4155  hypothetical protein  27.05 
 
 
672 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0306653  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.81 
 
 
680 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  26.95 
 
 
711 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  45.11 
 
 
679 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  44.36 
 
 
679 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  24.81 
 
 
659 aa  114  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  26.31 
 
 
691 aa  113  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2406  fusaric acid resistance protein region  27.59 
 
 
690 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  26.97 
 
 
681 aa  111  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>