180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4155 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_48340  hypothetical protein  76.19 
 
 
679 aa  876    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00973423  normal  0.112211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4155  hypothetical protein  100 
 
 
672 aa  1297    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0306653  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6856  fusaric acid resistance protein  43.28 
 
 
700 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1808  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.63 
 
 
742 aa  203  7e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  32.11 
 
 
676 aa  182  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  30.87 
 
 
676 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  31.05 
 
 
676 aa  177  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  31.49 
 
 
673 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  31.49 
 
 
673 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  31.49 
 
 
673 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  31.61 
 
 
679 aa  171  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  31.05 
 
 
679 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  26.58 
 
 
744 aa  158  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  28.46 
 
 
736 aa  156  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  28.08 
 
 
664 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.06 
 
 
699 aa  154  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  28.03 
 
 
733 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  28.03 
 
 
733 aa  153  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.03 
 
 
733 aa  153  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  28.03 
 
 
733 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  28.03 
 
 
733 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.03 
 
 
733 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  28.03 
 
 
733 aa  153  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  28.03 
 
 
733 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  27.52 
 
 
734 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  27.52 
 
 
734 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  27.52 
 
 
734 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  27.56 
 
 
733 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  27.54 
 
 
733 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2636  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.96 
 
 
741 aa  141  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  26.9 
 
 
734 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.95 
 
 
653 aa  140  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  28.89 
 
 
726 aa  139  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  26.9 
 
 
733 aa  137  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  25.54 
 
 
726 aa  132  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  28.4 
 
 
676 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  25.81 
 
 
730 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.07 
 
 
722 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1250  hypothetical protein  27.82 
 
 
690 aa  126  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  26.89 
 
 
725 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  26.89 
 
 
725 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  26.64 
 
 
727 aa  125  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  27.57 
 
 
731 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  27.21 
 
 
732 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  27.63 
 
 
699 aa  124  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  27.13 
 
 
725 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  25.99 
 
 
731 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  26.14 
 
 
725 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1401  fusaric acid resistance protein region  28.87 
 
 
714 aa  123  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0484  fusaric acid resistance protein region  26.71 
 
 
679 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.122808  normal  0.212474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  25.59 
 
 
731 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  28.9 
 
 
662 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  26.39 
 
 
697 aa  120  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  27.13 
 
 
729 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0264  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.36 
 
 
662 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  29.18 
 
 
724 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  28.65 
 
 
662 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  27.07 
 
 
728 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  27.81 
 
 
662 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.46 
 
 
653 aa  115  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.14 
 
 
697 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2051  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.92 
 
 
752 aa  114  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3825  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.1 
 
 
649 aa  114  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4042  fusaric acid resistance protein region  26.05 
 
 
727 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4324  fusaric acid resistance protein region  26.05 
 
 
727 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  27.22 
 
 
704 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  26.33 
 
 
725 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1682  fusaric acid resistance protein  26.33 
 
 
727 aa  112  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158795  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3197  fusaric acid resistance protein region  26.05 
 
 
727 aa  112  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2060  fusaric acid resistance protein region  26.02 
 
 
635 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.065197  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  27.5 
 
 
662 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  27.57 
 
 
691 aa  108  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4279  putative fusaric acid resistance protein  26.36 
 
 
728 aa  108  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3739  fusaric acid resistance protein region  25.88 
 
 
726 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.7262  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4286  fusaric acid resistance protein region  26.88 
 
 
727 aa  108  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.566792 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0273  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.12 
 
 
662 aa  108  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.489457  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.34 
 
 
655 aa  108  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4213  fusaric acid resistance protein region  25.88 
 
 
726 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260755 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.73 
 
 
641 aa  107  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3667  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.9 
 
 
651 aa  107  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  25.42 
 
 
691 aa  107  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2360  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.02 
 
 
639 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  28.83 
 
 
724 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  26 
 
 
702 aa  105  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0466  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.15 
 
 
655 aa  104  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.15 
 
 
655 aa  104  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0466  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.15 
 
 
655 aa  104  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.15 
 
 
655 aa  104  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3723  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.15 
 
 
655 aa  104  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.15 
 
 
655 aa  104  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  25.27 
 
 
687 aa  104  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  22.82 
 
 
670 aa  104  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  25.33 
 
 
711 aa  103  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  25.7 
 
 
718 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0737125 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03100  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  24.39 
 
 
655 aa  102  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03051  hypothetical protein  24.39 
 
 
655 aa  102  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0485  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.06 
 
 
651 aa  99.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1175  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.06 
 
 
651 aa  99.8  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193331 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0421  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.06 
 
 
651 aa  99.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1551  fusaric acid resistance domain protein  24.05 
 
 
679 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>