220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2360 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2360  Fusaric acid resistance protein conserved region  100 
 
 		 639 aa  1273    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  83.33 
 
 		 641 aa  1027    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2060  fusaric acid resistance protein region  49.5 
 
 		 635 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.065197  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1306  fusaric acid resistance protein region  31.35 
 
 		 644 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.389506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5715  fusaric acid resistance protein region  29.79 
 
 		 661 aa  192  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277565 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5952  membrane protein  29.85 
 
 		 623 aa  179  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  27.79 
 
 		 673 aa  140  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  27.79 
 
 		 673 aa  140  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  27.79 
 
 		 673 aa  140  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  26.39 
 
 		 676 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0233  membrane protein-like  28.29 
 
 		 653 aa  127  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  25.47 
 
 		 676 aa  125  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2071  hypothetical protein  30.69 
 
 		 493 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.555824 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.22 
 
 		 699 aa  121  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  25.61 
 
 		 662 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  25.08 
 
 		 691 aa  120  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  25 
 
 		 744 aa  118  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  26.34 
 
 		 662 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  25.38 
 
 		 662 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  23.75 
 
 		 691 aa  111  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  40.12 
 
 		 676 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1401  fusaric acid resistance protein region  24.36 
 
 		 714 aa  107  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.02 
 
 		 653 aa  106  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2636  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.44 
 
 		 741 aa  106  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  26.08 
 
 		 679 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  23.7 
 
 		 727 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  27.24 
 
 		 704 aa  103  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0484  fusaric acid resistance protein region  26.71 
 
 		 679 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.122808  normal  0.212474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4155  hypothetical protein  26.16 
 
 		 672 aa  101  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0306653  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6856  fusaric acid resistance protein  25.85 
 
 		 700 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.41 
 
 		 653 aa  100  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  23.66 
 
 		 736 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  25.59 
 
 		 659 aa  99  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  24.73 
 
 		 687 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  23.14 
 
 		 726 aa  97.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  24.88 
 
 		 625 aa  95.9  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  25.09 
 
 		 702 aa  95.1  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.74 
 
 		 672 aa  94  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  27.63 
 
 		 679 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.65 
 
 		 679 aa  92  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.78 
 
 		 697 aa  91.3  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  25.95 
 
 		 733 aa  89.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1250  hypothetical protein  24.49 
 
 		 690 aa  90.1  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  25.68 
 
 		 698 aa  89  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  26.07 
 
 		 733 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  26.07 
 
 		 733 aa  88.6  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  23.43 
 
 		 664 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  26.07 
 
 		 733 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  26.07 
 
 		 733 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  26.07 
 
 		 733 aa  89  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  26.07 
 
 		 733 aa  88.6  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  26.07 
 
 		 733 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  23.9 
 
 		 726 aa  87.8  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5223  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.34 
 
 		 678 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0716017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  25.11 
 
 		 695 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  23.09 
 
 		 733 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3618  hypothetical protein  23.27 
 
 		 688 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.94953  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  32.5 
 
 		 697 aa  84.7  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.72 
 
 		 680 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1682  fusaric acid resistance protein  23.88 
 
 		 727 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  24.3 
 
 		 681 aa  84.3  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  22.9 
 
 		 664 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  24.89 
 
 		 695 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.54 
 
 		 692 aa  83.6  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  24.1 
 
 		 729 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  27.37 
 
 		 682 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  23.88 
 
 		 733 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  24.68 
 
 		 718 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48340  hypothetical protein  25.33 
 
 		 679 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00973423  normal  0.112211 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  26.6 
 
 		 662 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  23.88 
 
 		 733 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1808  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.2 
 
 		 742 aa  81.6  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1647  fusaric acid resistance domain-containing protein  32.8 
 
 		 743 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  23.19 
 
 		 734 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0595  fusaric acid resistance domain-containing protein  33.91 
 
 		 745 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2328  fusaric acid resistance domain-containing protein  33.91 
 
 		 745 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0873  fusaric acid resistance domain-containing protein  33.91 
 
 		 745 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1110  putative fusaric acid resistance protein  33.91 
 
 		 745 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.853894  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1024  putative fusaric acid resistance protein  33.91 
 
 		 745 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1840  fusaric acid resistance domain-containing protein  33.91 
 
 		 745 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  25.22 
 
 		 713 aa  80.1  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.51 
 
 		 670 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4042  fusaric acid resistance protein region  23 
 
 		 727 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599052  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  35.1 
 
 		 724 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4324  fusaric acid resistance protein region  23 
 
 		 727 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4098  efflux transporter  25.38 
 
 		 693 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870113  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  22.76 
 
 		 734 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3739  fusaric acid resistance protein region  23.63 
 
 		 726 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.7262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3378  fusaric acid resistance protein region  23.03 
 
 		 695 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  34.62 
 
 		 724 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  22.8 
 
 		 734 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  22.8 
 
 		 734 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.6 
 
 		 680 aa  77.8  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4234  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.27 
 
 		 690 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  24.89 
 
 		 731 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4213  fusaric acid resistance protein region  22.71 
 
 		 726 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260755 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  23.08 
 
 		 730 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  24.78 
 
 		 695 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4422  fusaric acid resistance protein region  23.33 
 
 		 690 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4282  fusaric acid resistance protein region  23.27 
 
 		 711 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>