212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1858 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  100 
 
 
641 aa  1273    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2360  Fusaric acid resistance protein conserved region  83.33 
 
 
639 aa  1014    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2060  fusaric acid resistance protein region  48.09 
 
 
635 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.065197  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1306  fusaric acid resistance protein region  31.32 
 
 
644 aa  207  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.389506  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5952  membrane protein  30.65 
 
 
623 aa  191  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5715  fusaric acid resistance protein region  29.66 
 
 
661 aa  191  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0277565 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  29.06 
 
 
673 aa  143  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  29.06 
 
 
673 aa  143  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  29.06 
 
 
673 aa  143  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  27.92 
 
 
676 aa  138  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2071  hypothetical protein  33.21 
 
 
493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.555824 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0233  membrane protein-like  28.87 
 
 
653 aa  130  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  27.64 
 
 
662 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  27.12 
 
 
679 aa  120  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  25.62 
 
 
676 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  27.83 
 
 
662 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0484  fusaric acid resistance protein region  29.22 
 
 
679 aa  118  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.122808  normal  0.212474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  27.08 
 
 
662 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  25.85 
 
 
691 aa  117  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  26.7 
 
 
679 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  26 
 
 
662 aa  110  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  25.13 
 
 
736 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.92 
 
 
699 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.19 
 
 
653 aa  107  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  24.56 
 
 
702 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4155  hypothetical protein  26.73 
 
 
672 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0306653  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1401  fusaric acid resistance protein region  25.17 
 
 
714 aa  100  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  24.9 
 
 
726 aa  100  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  25.49 
 
 
733 aa  98.2  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6856  fusaric acid resistance protein  24.68 
 
 
700 aa  97.8  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.86 
 
 
697 aa  97.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5223  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.58 
 
 
678 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0716017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48340  hypothetical protein  25.88 
 
 
679 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00973423  normal  0.112211 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4756  fusaric acid resistance protein region  26.72 
 
 
678 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361861  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.59 
 
 
653 aa  95.5  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  24.75 
 
 
733 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  25.1 
 
 
733 aa  95.1  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  24.75 
 
 
733 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  24.75 
 
 
733 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  25.1 
 
 
733 aa  95.1  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  24.75 
 
 
733 aa  94.7  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  24.75 
 
 
733 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3618  hypothetical protein  24 
 
 
688 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.94953  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  24.84 
 
 
687 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  21.72 
 
 
691 aa  93.6  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5298  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.87 
 
 
678 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.812245  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  24.76 
 
 
726 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  27.21 
 
 
682 aa  92.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1808  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.44 
 
 
742 aa  92.8  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  24.33 
 
 
733 aa  92  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  24.52 
 
 
734 aa  91.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  25.55 
 
 
704 aa  91.7  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  26 
 
 
695 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.78 
 
 
722 aa  91.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  24.9 
 
 
713 aa  90.9  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  27.31 
 
 
679 aa  90.9  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  24.33 
 
 
733 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  24.86 
 
 
734 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  26.67 
 
 
695 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  22.93 
 
 
733 aa  88.6  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.05 
 
 
670 aa  89  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  25.56 
 
 
698 aa  88.2  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  25.69 
 
 
681 aa  88.6  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  24.91 
 
 
734 aa  88.6  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  24.91 
 
 
734 aa  88.6  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  34.76 
 
 
697 aa  87  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  25.1 
 
 
725 aa  85.1  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  23.82 
 
 
725 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  31.02 
 
 
744 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  24.71 
 
 
725 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4234  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.34 
 
 
690 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  23.98 
 
 
625 aa  83.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  23.62 
 
 
725 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4282  fusaric acid resistance protein region  24.17 
 
 
711 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3197  fusaric acid resistance protein region  23.35 
 
 
727 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  23.62 
 
 
725 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  22.55 
 
 
670 aa  82.4  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3378  fusaric acid resistance protein region  22.98 
 
 
695 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926577  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  33.9 
 
 
727 aa  82  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4422  fusaric acid resistance protein region  24.17 
 
 
690 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4042  fusaric acid resistance protein region  23.35 
 
 
727 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4324  fusaric acid resistance protein region  23.35 
 
 
727 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  24.41 
 
 
700 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0118  fusaric acid resistance protein region  24.34 
 
 
690 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.429698  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.16 
 
 
700 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  24.27 
 
 
730 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  25.32 
 
 
695 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  36.05 
 
 
679 aa  79  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  23.42 
 
 
731 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.67 
 
 
680 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  25.11 
 
 
695 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  32.28 
 
 
664 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  24.19 
 
 
718 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  31.65 
 
 
664 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2051  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.91 
 
 
752 aa  76.6  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  28.84 
 
 
724 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  31.6 
 
 
659 aa  76.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  28.08 
 
 
724 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1250  hypothetical protein  33.14 
 
 
690 aa  75.5  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.56 
 
 
739 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>