240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1796 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  67.67 
 
 		 682 aa  815    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 		 625 aa  1255    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  46.59 
 
 		 659 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  38.51 
 
 		 700 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4098  efflux transporter  43.27 
 
 		 693 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870113  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  43.79 
 
 		 687 aa  409  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7722  fusaric acid resistance protein  37.64 
 
 		 710 aa  395  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  38.66 
 
 		 691 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6148  fusaric acid resistance protein region  38.3 
 
 		 710 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.623711 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  37.72 
 
 		 700 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  35.7 
 
 		 687 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3618  hypothetical protein  35.09 
 
 		 688 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.94953  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  35.28 
 
 		 695 aa  363  6e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3378  fusaric acid resistance protein region  34.73 
 
 		 695 aa  359  6e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  35.13 
 
 		 695 aa  359  7e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  34.65 
 
 		 695 aa  359  9e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  34.81 
 
 		 695 aa  359  9e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  38.01 
 
 		 679 aa  345  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.73 
 
 		 670 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  37.07 
 
 		 688 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  38.44 
 
 		 680 aa  300  5e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.69 
 
 		 680 aa  299  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  37.03 
 
 		 679 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  33.98 
 
 		 698 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.23 
 
 		 692 aa  276  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  33.72 
 
 		 681 aa  266  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.25 
 
 		 672 aa  265  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  35.08 
 
 		 653 aa  260  5.0000000000000005e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  30.8 
 
 		 704 aa  258  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.66 
 
 		 697 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  31.57 
 
 		 702 aa  251  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  51.65 
 
 		 718 aa  242  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3501  fusaric acid resistance protein region  35.29 
 
 		 639 aa  230  7e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6657  fusaric acid resistance protein region  50.4 
 
 		 707 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6015  fusaric acid resistance protein region  50 
 
 		 713 aa  227  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5771  fusaric acid resistance protein region  50 
 
 		 719 aa  228  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5813  fusaric acid resistance protein region  50.4 
 
 		 707 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6177  fusaric acid resistance protein region  50.4 
 
 		 707 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  32.2 
 
 		 713 aa  222  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  45.83 
 
 		 697 aa  199  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2406  fusaric acid resistance protein region  53.41 
 
 		 690 aa  172  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  28.91 
 
 		 673 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  28.91 
 
 		 673 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  28.91 
 
 		 673 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  26.67 
 
 		 691 aa  157  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0110  fusaric acid resistance protein, putative  36.32 
 
 		 749 aa  144  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  28.1 
 
 		 726 aa  143  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3170  fusaric acid resistance protein region  33.47 
 
 		 716 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.841968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  29.43 
 
 		 679 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  27.27 
 
 		 676 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  27.47 
 
 		 676 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  25.89 
 
 		 664 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  27.27 
 
 		 676 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  26.41 
 
 		 676 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  24.28 
 
 		 731 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.55 
 
 		 653 aa  127  6e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  24.12 
 
 		 731 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  29.32 
 
 		 744 aa  125  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  25.4 
 
 		 732 aa  124  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  25.2 
 
 		 731 aa  123  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  26.31 
 
 		 664 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  25.86 
 
 		 727 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  27.08 
 
 		 662 aa  122  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  26.97 
 
 		 662 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  40.12 
 
 		 734 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.81 
 
 		 739 aa  120  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  39.51 
 
 		 733 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  39.51 
 
 		 733 aa  120  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  27.26 
 
 		 662 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  26.7 
 
 		 662 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  38.89 
 
 		 734 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  38.89 
 
 		 734 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  38.89 
 
 		 734 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  23.74 
 
 		 670 aa  117  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.24 
 
 		 699 aa  117  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  25.63 
 
 		 724 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  32 
 
 		 736 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  24.37 
 
 		 711 aa  110  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4282  fusaric acid resistance protein region  24.47 
 
 		 711 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  22.56 
 
 		 730 aa  110  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.52 
 
 		 722 aa  110  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  38.41 
 
 		 733 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4234  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.31 
 
 		 690 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  23.98 
 
 		 699 aa  109  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4422  fusaric acid resistance protein region  24.31 
 
 		 690 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1647  fusaric acid resistance domain-containing protein  38.22 
 
 		 743 aa  108  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0118  fusaric acid resistance protein region  24.19 
 
 		 690 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.429698  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3197  fusaric acid resistance protein region  38.22 
 
 		 727 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4042  fusaric acid resistance protein region  38.22 
 
 		 727 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4324  fusaric acid resistance protein region  38.22 
 
 		 727 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1722  fusaric acid resistance domain-containing protein  25 
 
 		 670 aa  105  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0595  fusaric acid resistance domain-containing protein  37.58 
 
 		 745 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1856  fusaric acid resistance domain-containing protein  25 
 
 		 670 aa  105  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0794628  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2328  fusaric acid resistance domain-containing protein  37.58 
 
 		 745 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1984  fusaric acid resistance protein region  25 
 
 		 670 aa  105  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0152424  hitchhiker  0.000622676 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0873  fusaric acid resistance domain-containing protein  37.58 
 
 		 745 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1110  putative fusaric acid resistance protein  37.58 
 
 		 745 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.853894  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1024  putative fusaric acid resistance protein  37.58 
 
 		 745 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1840  fusaric acid resistance domain-containing protein  37.58 
 
 		 745 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  26.51 
 
 		 726 aa  105  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>