217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1330 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  66.14 
 
 
739 aa  963    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  76.91 
 
 
733 aa  1089    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  76.91 
 
 
733 aa  1088    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  50.36 
 
 
730 aa  687    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  93.05 
 
 
734 aa  1350    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  89.01 
 
 
733 aa  1227    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  92.64 
 
 
734 aa  1316    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  78.69 
 
 
733 aa  1103    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  65.52 
 
 
736 aa  954    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  92.1 
 
 
734 aa  1305    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  65.35 
 
 
744 aa  943    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 
733 aa  1475    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  50.14 
 
 
731 aa  663    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  48.49 
 
 
731 aa  650    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  92.1 
 
 
734 aa  1305    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  76.91 
 
 
733 aa  1089    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  76.91 
 
 
733 aa  1089    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  76.78 
 
 
733 aa  1088    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  76.91 
 
 
733 aa  1089    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  76.91 
 
 
733 aa  1089    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  98.5 
 
 
733 aa  1453    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  49.72 
 
 
731 aa  657    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  48.49 
 
 
732 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  47.65 
 
 
725 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  47.08 
 
 
725 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  47.08 
 
 
725 aa  631  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  47.08 
 
 
725 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  46.69 
 
 
725 aa  630  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  48.43 
 
 
729 aa  623  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  46.14 
 
 
722 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  48.2 
 
 
728 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  45.39 
 
 
726 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4213  fusaric acid resistance protein region  46.7 
 
 
726 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4042  fusaric acid resistance protein region  46.93 
 
 
727 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599052  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3739  fusaric acid resistance protein region  46.84 
 
 
726 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.7262  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4324  fusaric acid resistance protein region  46.93 
 
 
727 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3197  fusaric acid resistance protein region  46.56 
 
 
727 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1682  fusaric acid resistance protein  46.93 
 
 
727 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158795  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0595  fusaric acid resistance domain-containing protein  47.23 
 
 
745 aa  582  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2328  fusaric acid resistance domain-containing protein  47.23 
 
 
745 aa  581  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0873  fusaric acid resistance domain-containing protein  47.23 
 
 
745 aa  582  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1110  putative fusaric acid resistance protein  47.08 
 
 
745 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.853894  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1024  putative fusaric acid resistance protein  47.23 
 
 
745 aa  582  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1840  fusaric acid resistance domain-containing protein  47.23 
 
 
745 aa  582  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4286  fusaric acid resistance protein region  46.79 
 
 
727 aa  559  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.566792 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1647  fusaric acid resistance domain-containing protein  47.93 
 
 
743 aa  547  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0396  aromatic acid (fusaric acid) exporter, (ArAE)family  43.95 
 
 
727 aa  528  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  37.25 
 
 
726 aa  462  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4279  putative fusaric acid resistance protein  33.33 
 
 
728 aa  361  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  31.91 
 
 
727 aa  344  4e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1863  hypothetical protein  46.04 
 
 
411 aa  331  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5713  fusaric acid resistance protein region  30.2 
 
 
750 aa  252  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  0.787817 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6856  fusaric acid resistance protein  30.38 
 
 
700 aa  203  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  28.45 
 
 
676 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  31.27 
 
 
679 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  28.84 
 
 
664 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.21 
 
 
653 aa  180  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  27.97 
 
 
662 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  30.94 
 
 
676 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  28.64 
 
 
662 aa  172  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  31.52 
 
 
673 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  31.52 
 
 
673 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  31.52 
 
 
673 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  27.91 
 
 
662 aa  168  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.97 
 
 
688 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  25.13 
 
 
713 aa  165  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  24.68 
 
 
670 aa  162  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  29.47 
 
 
676 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.54 
 
 
700 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1808  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.83 
 
 
742 aa  152  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  28.68 
 
 
676 aa  150  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  29.81 
 
 
662 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.88 
 
 
679 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.83 
 
 
670 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  27.04 
 
 
691 aa  149  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  28.22 
 
 
700 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  28.24 
 
 
679 aa  147  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.61 
 
 
699 aa  146  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  24.64 
 
 
698 aa  147  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  24.34 
 
 
691 aa  146  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4155  hypothetical protein  27.89 
 
 
672 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0306653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  26.94 
 
 
711 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  26.02 
 
 
659 aa  144  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.37 
 
 
672 aa  144  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  38.71 
 
 
664 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.92 
 
 
697 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.29 
 
 
680 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2636  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.61 
 
 
741 aa  139  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48340  hypothetical protein  28.17 
 
 
679 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00973423  normal  0.112211 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.54 
 
 
653 aa  136  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  24.86 
 
 
697 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7722  fusaric acid resistance protein  27.56 
 
 
710 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6148  fusaric acid resistance protein region  27.88 
 
 
710 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.623711 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6015  fusaric acid resistance protein region  28.39 
 
 
713 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5771  fusaric acid resistance protein region  28.39 
 
 
719 aa  135  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  27.52 
 
 
702 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  28.27 
 
 
704 aa  135  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  24.81 
 
 
699 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1802  fusaric acid resistance protein region  26.88 
 
 
677 aa  134  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  39.59 
 
 
679 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>