216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1992 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  64.02 
 
 		 697 aa  854    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  68.73 
 
 		 704 aa  929    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 		 702 aa  1412    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  40.71 
 
 		 653 aa  416  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.84 
 
 		 680 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.22 
 
 		 672 aa  311  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  36.82 
 
 		 692 aa  306  6e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  35.45 
 
 		 688 aa  294  4e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  34.27 
 
 		 691 aa  293  6e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  33.28 
 
 		 681 aa  286  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  30.93 
 
 		 698 aa  279  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  30.93 
 
 		 697 aa  278  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.67 
 
 		 680 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  33.03 
 
 		 700 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6015  fusaric acid resistance protein region  33.17 
 
 		 713 aa  269  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  34.68 
 
 		 718 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  32.67 
 
 		 700 aa  269  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5771  fusaric acid resistance protein region  33.06 
 
 		 719 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.97 
 
 		 679 aa  265  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6657  fusaric acid resistance protein region  32.77 
 
 		 707 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7722  fusaric acid resistance protein  32.58 
 
 		 710 aa  263  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5813  fusaric acid resistance protein region  32.72 
 
 		 707 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6177  fusaric acid resistance protein region  32.72 
 
 		 707 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6148  fusaric acid resistance protein region  32.68 
 
 		 710 aa  262  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.623711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.69 
 
 		 670 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2406  fusaric acid resistance protein region  34.3 
 
 		 690 aa  257  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3170  fusaric acid resistance protein region  29.99 
 
 		 716 aa  257  5e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.841968 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  33.18 
 
 		 679 aa  257  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  30.85 
 
 		 659 aa  256  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  31.42 
 
 		 625 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0110  fusaric acid resistance protein, putative  30.23 
 
 		 749 aa  240  8e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  32.99 
 
 		 687 aa  236  7e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  31.68 
 
 		 682 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  28.85 
 
 		 695 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  29.01 
 
 		 695 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  28.64 
 
 		 695 aa  228  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  28.64 
 
 		 695 aa  228  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3501  fusaric acid resistance protein region  33.7 
 
 		 639 aa  216  9e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3618  hypothetical protein  29.82 
 
 		 688 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.94953  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  28.43 
 
 		 687 aa  211  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3378  fusaric acid resistance protein region  29.23 
 
 		 695 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  28.25 
 
 		 713 aa  203  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4098  efflux transporter  28.22 
 
 		 693 aa  194  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870113  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  30.94 
 
 		 673 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  30.94 
 
 		 673 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  30.94 
 
 		 673 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  25.66 
 
 		 727 aa  163  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  29.93 
 
 		 676 aa  160  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  28.1 
 
 		 729 aa  160  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  27.96 
 
 		 728 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4042  fusaric acid resistance protein region  27.14 
 
 		 727 aa  150  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4324  fusaric acid resistance protein region  27.14 
 
 		 727 aa  150  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  26.45 
 
 		 730 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3739  fusaric acid resistance protein region  27.2 
 
 		 726 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.7262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  24.6 
 
 		 676 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4213  fusaric acid resistance protein region  26.73 
 
 		 726 aa  148  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260755 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  27.49 
 
 		 725 aa  148  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  28.4 
 
 		 732 aa  144  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3197  fusaric acid resistance protein region  26.82 
 
 		 727 aa  143  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  27.67 
 
 		 731 aa  143  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  26.93 
 
 		 724 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  26.72 
 
 		 724 aa  142  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  23.79 
 
 		 670 aa  139  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  25.39 
 
 		 699 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  25.75 
 
 		 662 aa  138  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  26.22 
 
 		 731 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  25.12 
 
 		 662 aa  137  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  26.22 
 
 		 731 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1682  fusaric acid resistance protein  26.44 
 
 		 727 aa  135  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  27.47 
 
 		 725 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.96 
 
 		 653 aa  134  6.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  25.75 
 
 		 662 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  27.67 
 
 		 725 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  28.19 
 
 		 733 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  28.19 
 
 		 733 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  28.19 
 
 		 733 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  28.19 
 
 		 733 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  28.19 
 
 		 733 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4286  fusaric acid resistance protein region  26.84 
 
 		 727 aa  132  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.566792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  27.67 
 
 		 725 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  28.19 
 
 		 733 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.19 
 
 		 733 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  27.67 
 
 		 725 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  26.16 
 
 		 733 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  26.42 
 
 		 726 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  27.98 
 
 		 733 aa  129  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  27.18 
 
 		 734 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  27.79 
 
 		 733 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  26.61 
 
 		 734 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  26.61 
 
 		 734 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  26.61 
 
 		 734 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  24.8 
 
 		 691 aa  125  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4279  putative fusaric acid resistance protein  26 
 
 		 728 aa  124  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.05 
 
 		 722 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.9 
 
 		 699 aa  119  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  27.8 
 
 		 733 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0396  aromatic acid (fusaric acid) exporter, (ArAE)family  25.32 
 
 		 727 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  28.29 
 
 		 744 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  24.2 
 
 		 711 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0118  fusaric acid resistance protein region  25.28 
 
 		 690 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.429698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>