188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4213 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3197  fusaric acid resistance protein region  91.47 
 
 
727 aa  1313    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  56.85 
 
 
722 aa  762    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0595  fusaric acid resistance domain-containing protein  71.58 
 
 
745 aa  998    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2328  fusaric acid resistance domain-containing protein  71.45 
 
 
745 aa  996    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1682  fusaric acid resistance protein  91.2 
 
 
727 aa  1286    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158795  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1647  fusaric acid resistance domain-containing protein  71.92 
 
 
743 aa  953    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0396  aromatic acid (fusaric acid) exporter, (ArAE)family  56.68 
 
 
727 aa  723    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4286  fusaric acid resistance protein region  88.02 
 
 
727 aa  1226    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.566792 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4042  fusaric acid resistance protein region  91.33 
 
 
727 aa  1311    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599052  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3739  fusaric acid resistance protein region  98.76 
 
 
726 aa  1450    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.7262  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4324  fusaric acid resistance protein region  91.33 
 
 
727 aa  1311    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0873  fusaric acid resistance domain-containing protein  71.58 
 
 
745 aa  998    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1110  putative fusaric acid resistance protein  71.31 
 
 
745 aa  995    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.853894  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1024  putative fusaric acid resistance protein  71.72 
 
 
745 aa  998    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1840  fusaric acid resistance domain-containing protein  71.58 
 
 
745 aa  998    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  57.58 
 
 
726 aa  784    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4213  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 
726 aa  1465    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260755 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  48.2 
 
 
736 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  47.92 
 
 
739 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  46.46 
 
 
744 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  46.7 
 
 
733 aa  601  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  46.14 
 
 
733 aa  602  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  45.44 
 
 
734 aa  592  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  45.93 
 
 
734 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  45.93 
 
 
734 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  45.32 
 
 
734 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  46.97 
 
 
733 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  46.97 
 
 
733 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  46.97 
 
 
733 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  46.97 
 
 
733 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  46.97 
 
 
733 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  46.97 
 
 
733 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  46.97 
 
 
733 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  46.54 
 
 
733 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  46.08 
 
 
733 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  39.78 
 
 
730 aa  491  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  40.79 
 
 
725 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  40.79 
 
 
725 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  41.08 
 
 
725 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  40.65 
 
 
725 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  40.54 
 
 
729 aa  478  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  38.61 
 
 
731 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  40.8 
 
 
728 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  39.47 
 
 
725 aa  467  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  41.58 
 
 
731 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  41.22 
 
 
731 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  38.46 
 
 
732 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1863  hypothetical protein  57.68 
 
 
411 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  33.85 
 
 
726 aa  372  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  31.05 
 
 
727 aa  300  8e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4279  putative fusaric acid resistance protein  31.02 
 
 
728 aa  288  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5713  fusaric acid resistance protein region  27.09 
 
 
750 aa  207  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  0.787817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  27.82 
 
 
664 aa  184  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  31.1 
 
 
676 aa  183  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  30.75 
 
 
673 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  30.75 
 
 
673 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  30.75 
 
 
673 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6856  fusaric acid resistance protein  27.23 
 
 
700 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  27.42 
 
 
676 aa  164  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  31.35 
 
 
679 aa  161  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  27.67 
 
 
702 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  28.69 
 
 
662 aa  152  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  26.77 
 
 
662 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  26.01 
 
 
662 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  25.25 
 
 
670 aa  146  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  27.42 
 
 
704 aa  146  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.4 
 
 
653 aa  145  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  25.14 
 
 
713 aa  143  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.75 
 
 
680 aa  142  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.07 
 
 
697 aa  140  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0484  fusaric acid resistance protein region  29.29 
 
 
679 aa  140  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.122808  normal  0.212474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  38.07 
 
 
664 aa  140  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  26.03 
 
 
699 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  25.34 
 
 
662 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.94 
 
 
653 aa  134  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.97 
 
 
670 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  25.37 
 
 
691 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  27.62 
 
 
697 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  30.18 
 
 
679 aa  127  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.66 
 
 
679 aa  124  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  26.61 
 
 
724 aa  124  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  39.13 
 
 
687 aa  124  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  26.74 
 
 
711 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.73 
 
 
672 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.63 
 
 
680 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  26.65 
 
 
724 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  37.57 
 
 
700 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.58 
 
 
699 aa  119  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1250  hypothetical protein  25.13 
 
 
690 aa  119  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48340  hypothetical protein  26.8 
 
 
679 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00973423  normal  0.112211 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2636  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.79 
 
 
741 aa  117  8.999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  26.25 
 
 
698 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  26.42 
 
 
687 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1401  fusaric acid resistance protein region  26.61 
 
 
714 aa  117  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  37.02 
 
 
700 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  36.46 
 
 
718 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  38 
 
 
679 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6148  fusaric acid resistance protein region  26.32 
 
 
710 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.623711 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7722  fusaric acid resistance protein  27.6 
 
 
710 aa  114  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6015  fusaric acid resistance protein region  26.37 
 
 
713 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>