230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1490 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  62.69 
 
 
662 aa  750    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  62.84 
 
 
662 aa  745    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  62.67 
 
 
676 aa  770    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  58.38 
 
 
664 aa  669    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 
662 aa  1288    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  62.54 
 
 
662 aa  736    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  57.67 
 
 
664 aa  640    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  50.46 
 
 
679 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  51.38 
 
 
679 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  35.7 
 
 
691 aa  304  4.0000000000000003e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  29.8 
 
 
736 aa  223  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  34.13 
 
 
676 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  34.65 
 
 
673 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  34.65 
 
 
673 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  34.65 
 
 
673 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.46 
 
 
739 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  27.51 
 
 
726 aa  211  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  29.57 
 
 
744 aa  207  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4422  fusaric acid resistance protein region  28.52 
 
 
690 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4234  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.95 
 
 
690 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4282  fusaric acid resistance protein region  28.71 
 
 
711 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0118  fusaric acid resistance protein region  28.78 
 
 
690 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.429698  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  30.46 
 
 
733 aa  201  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  30.46 
 
 
733 aa  201  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  30.46 
 
 
733 aa  201  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  30.46 
 
 
733 aa  201  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  30.46 
 
 
733 aa  201  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  30.46 
 
 
733 aa  201  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  31.42 
 
 
733 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  30.53 
 
 
733 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  32.33 
 
 
725 aa  196  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  30.91 
 
 
713 aa  196  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  30.28 
 
 
733 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  29.56 
 
 
733 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  29.87 
 
 
711 aa  192  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  29.87 
 
 
734 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  30.12 
 
 
734 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  33.07 
 
 
724 aa  191  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  30.12 
 
 
734 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.13 
 
 
699 aa  190  5.999999999999999e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  29.09 
 
 
659 aa  190  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  27.42 
 
 
730 aa  189  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  29.06 
 
 
734 aa  189  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  29.88 
 
 
733 aa  188  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  32.61 
 
 
724 aa  188  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  32.39 
 
 
731 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1292  fusaric acid resistance protein region  29.61 
 
 
681 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.944306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  32.39 
 
 
732 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  30.1 
 
 
729 aa  184  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.31 
 
 
653 aa  184  6e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  26.88 
 
 
726 aa  184  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3197  fusaric acid resistance protein region  29.63 
 
 
727 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  28.74 
 
 
691 aa  179  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4042  fusaric acid resistance protein region  30.43 
 
 
727 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4324  fusaric acid resistance protein region  30.43 
 
 
727 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  27.08 
 
 
670 aa  178  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  28.76 
 
 
725 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.12 
 
 
692 aa  177  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  28.76 
 
 
725 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3739  fusaric acid resistance protein region  28.6 
 
 
726 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.7262  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4213  fusaric acid resistance protein region  28.96 
 
 
726 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260755 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  28.27 
 
 
725 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  27.67 
 
 
725 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.69 
 
 
722 aa  171  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  26.46 
 
 
698 aa  170  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1682  fusaric acid resistance protein  30.57 
 
 
727 aa  170  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158795  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  25.04 
 
 
697 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4286  fusaric acid resistance protein region  28.78 
 
 
727 aa  169  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.566792 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.52 
 
 
653 aa  169  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0595  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.62 
 
 
745 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0873  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.62 
 
 
745 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1840  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.62 
 
 
745 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2328  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.62 
 
 
745 aa  167  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.94 
 
 
670 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  27.8 
 
 
695 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1024  putative fusaric acid resistance protein  28.45 
 
 
745 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1110  putative fusaric acid resistance protein  28.45 
 
 
745 aa  167  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.853894  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  27.79 
 
 
695 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0273  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  27.34 
 
 
662 aa  165  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.489457  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  29.04 
 
 
731 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  27.79 
 
 
695 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  28.97 
 
 
695 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  27.19 
 
 
682 aa  161  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  29.39 
 
 
681 aa  161  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  29.22 
 
 
731 aa  160  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  28.18 
 
 
687 aa  160  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.75 
 
 
697 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  32.45 
 
 
680 aa  159  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0421  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  28.27 
 
 
651 aa  159  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1647  fusaric acid resistance domain-containing protein  29.03 
 
 
743 aa  159  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1175  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  28.27 
 
 
651 aa  159  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193331 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0485  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  28.27 
 
 
651 aa  159  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.54 
 
 
680 aa  159  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  33.22 
 
 
679 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03100  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  27.57 
 
 
655 aa  156  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03051  hypothetical protein  27.57 
 
 
655 aa  156  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0396  aromatic acid (fusaric acid) exporter, (ArAE)family  27.57 
 
 
727 aa  156  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  27.57 
 
 
655 aa  155  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  25.45 
 
 
704 aa  155  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0264  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  27.94 
 
 
662 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>