206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0485 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03100  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  64.8 
 
 		 655 aa  848    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0466  Fusaric acid resistance protein conserved region  64.8 
 
 		 655 aa  850    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3627  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  64.02 
 
 		 655 aa  821    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.35242  normal  0.2133 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  64.95 
 
 		 655 aa  852    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0485  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  100 
 
 		 651 aa  1335    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  64.49 
 
 		 655 aa  845    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3662  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  64.02 
 
 		 655 aa  820    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3555  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  64.02 
 
 		 655 aa  820    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0466  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  64.8 
 
 		 655 aa  849    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0421  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  100 
 
 		 651 aa  1335    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0273  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  64.56 
 
 		 662 aa  877    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.489457  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  64.8 
 
 		 655 aa  850    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4390  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  71.1 
 
 		 655 aa  928    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  64.02 
 
 		 655 aa  821    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.269228 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3825  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  62.46 
 
 		 649 aa  815    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1175  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  100 
 
 		 651 aa  1335    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193331 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03051  hypothetical protein  64.8 
 
 		 655 aa  848    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3723  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  64.8 
 
 		 655 aa  849    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0264  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  69.8 
 
 		 662 aa  912    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3677  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  64.02 
 
 		 655 aa  850    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3667  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  56.31 
 
 		 651 aa  736    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  64.02 
 
 		 655 aa  821    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.374606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  64.64 
 
 		 655 aa  848    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  26.12 
 
 		 699 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  27.43 
 
 		 664 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  27.24 
 
 		 676 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  29.18 
 
 		 662 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  28.29 
 
 		 662 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  27.48 
 
 		 664 aa  147  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  28.49 
 
 		 662 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  27.63 
 
 		 662 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.09 
 
 		 692 aa  127  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  25.27 
 
 		 711 aa  126  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  24.44 
 
 		 724 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  24 
 
 		 724 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  23.15 
 
 		 670 aa  122  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.68 
 
 		 672 aa  121  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  23.5 
 
 		 713 aa  118  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  24.7 
 
 		 691 aa  117  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  24.22 
 
 		 697 aa  115  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  25.94 
 
 		 676 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  25.94 
 
 		 676 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  23.25 
 
 		 698 aa  114  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  23.82 
 
 		 726 aa  113  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  24.67 
 
 		 682 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  23.41 
 
 		 687 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  23 
 
 		 659 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  24.57 
 
 		 730 aa  112  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  23.69 
 
 		 700 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  22.05 
 
 		 695 aa  107  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  21.87 
 
 		 695 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  22.7 
 
 		 700 aa  104  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  23.93 
 
 		 733 aa  104  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  21.87 
 
 		 695 aa  104  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  23.48 
 
 		 733 aa  103  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  23.48 
 
 		 733 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  23.48 
 
 		 733 aa  103  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  23.48 
 
 		 733 aa  103  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  23.48 
 
 		 733 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  23.48 
 
 		 733 aa  103  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1802  fusaric acid resistance protein region  23.49 
 
 		 677 aa  103  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3378  fusaric acid resistance protein region  22.9 
 
 		 695 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  23.48 
 
 		 733 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  25 
 
 		 676 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  24.57 
 
 		 744 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  37.43 
 
 		 679 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4282  fusaric acid resistance protein region  24.15 
 
 		 711 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  22.22 
 
 		 679 aa  102  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  36.84 
 
 		 679 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4422  fusaric acid resistance protein region  24.37 
 
 		 690 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4234  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.37 
 
 		 690 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3618  hypothetical protein  23.33 
 
 		 688 aa  101  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.94953  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0118  fusaric acid resistance protein region  24.37 
 
 		 690 aa  100  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.429698  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  24.79 
 
 		 736 aa  100  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  25 
 
 		 733 aa  99.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  22.71 
 
 		 722 aa  99.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7722  fusaric acid resistance protein  22.92 
 
 		 710 aa  98.2  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1902  fusaric acid resistance domain-containing protein  22.65 
 
 		 679 aa  97.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.48277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1551  fusaric acid resistance domain protein  22.48 
 
 		 679 aa  96.3  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4155  hypothetical protein  23.19 
 
 		 672 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0306653  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2357  fusaric acid resistance domain protein  23.2 
 
 		 663 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000905484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  35.88 
 
 		 670 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1538  fusaric acid resistance domain protein  22.48 
 
 		 679 aa  95.1  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0513426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1733  fusaric acid resistance domain protein  22.48 
 
 		 679 aa  94.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105287  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  22.5 
 
 		 702 aa  94.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1611  fusaric acid resistance domain-containing protein  22.48 
 
 		 679 aa  94.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.461133  normal  0.751418 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  23.8 
 
 		 726 aa  94  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  22.9 
 
 		 734 aa  94  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  22.63 
 
 		 697 aa  93.6  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  24.2 
 
 		 732 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  23.44 
 
 		 727 aa  92.4  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  24.2 
 
 		 731 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  21.98 
 
 		 681 aa  92  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5298  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.05 
 
 		 678 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.812245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  23.84 
 
 		 733 aa  91.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  23.67 
 
 		 718 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  22.5 
 
 		 734 aa  91.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  22.91 
 
 		 734 aa  91.3  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  22.91 
 
 		 734 aa  91.3  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1837  fusaric acid resistance domain protein  23.02 
 
 		 670 aa  90.9  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>