204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1837 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01615  conserved inner membrane protein  98.66 
 
 
670 aa  1341    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.174689  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1995  Fusaric acid resistance protein conserved region  98.51 
 
 
670 aa  1340    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000064393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1856  fusaric acid resistance domain-containing protein  98.66 
 
 
670 aa  1341    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0794628  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1722  fusaric acid resistance domain-containing protein  98.51 
 
 
670 aa  1340    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1902  fusaric acid resistance domain-containing protein  84.28 
 
 
679 aa  1142    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.48277  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1611  fusaric acid resistance domain-containing protein  84.43 
 
 
679 aa  1143    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.461133  normal  0.751418 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1538  fusaric acid resistance domain protein  84.43 
 
 
679 aa  1142    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0513426  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1553  fusaric acid resistance domain-containing protein  97.76 
 
 
670 aa  1288    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.266646  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  64.05 
 
 
670 aa  885    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2357  fusaric acid resistance domain protein  98.04 
 
 
663 aa  1322    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000905484  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1984  fusaric acid resistance protein region  98.36 
 
 
670 aa  1337    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0152424  hitchhiker  0.000622676 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1837  fusaric acid resistance domain protein  100 
 
 
670 aa  1360    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235624  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1802  fusaric acid resistance protein region  78.33 
 
 
677 aa  1039    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1551  fusaric acid resistance domain protein  84.28 
 
 
679 aa  1142    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1733  fusaric acid resistance domain protein  84.63 
 
 
679 aa  1146    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105287  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  28.12 
 
 
744 aa  154  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  26.53 
 
 
726 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  27.07 
 
 
676 aa  145  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  26.79 
 
 
679 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  25.27 
 
 
659 aa  137  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  26.63 
 
 
733 aa  135  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  26.63 
 
 
733 aa  135  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  25.77 
 
 
733 aa  135  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  26.63 
 
 
733 aa  135  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  26.63 
 
 
733 aa  135  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  26.63 
 
 
733 aa  135  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  26.63 
 
 
733 aa  135  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  26.63 
 
 
733 aa  135  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  26.43 
 
 
673 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  26.43 
 
 
673 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  26.43 
 
 
673 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  25.2 
 
 
734 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  26.42 
 
 
664 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  26.45 
 
 
736 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  24.64 
 
 
733 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  25.84 
 
 
676 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  25.76 
 
 
730 aa  128  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  24.43 
 
 
734 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  25.25 
 
 
733 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.95 
 
 
670 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  24.43 
 
 
734 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  24.43 
 
 
734 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  25.62 
 
 
676 aa  127  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  26.63 
 
 
729 aa  127  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  24.72 
 
 
713 aa  125  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  24.15 
 
 
733 aa  126  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  26.79 
 
 
679 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  26.55 
 
 
728 aa  125  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  25.23 
 
 
698 aa  123  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  26.48 
 
 
687 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  25.11 
 
 
695 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.2 
 
 
739 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  23.89 
 
 
697 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.83 
 
 
672 aa  120  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  25.51 
 
 
695 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  25.21 
 
 
695 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  24.17 
 
 
699 aa  119  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  25.09 
 
 
691 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7722  fusaric acid resistance protein  26.55 
 
 
710 aa  115  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  25.49 
 
 
725 aa  115  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  25.62 
 
 
662 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  25.77 
 
 
695 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  23.55 
 
 
681 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.68 
 
 
680 aa  112  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  24.95 
 
 
625 aa  112  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  25.88 
 
 
662 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  25.32 
 
 
731 aa  111  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  36.48 
 
 
664 aa  111  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  25.76 
 
 
732 aa  111  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.25 
 
 
722 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1110  putative fusaric acid resistance protein  26.14 
 
 
745 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.853894  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  27.29 
 
 
682 aa  110  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  22.67 
 
 
691 aa  109  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  24.29 
 
 
731 aa  109  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1647  fusaric acid resistance domain-containing protein  25.58 
 
 
743 aa  108  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  25.52 
 
 
726 aa  107  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0485  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.2 
 
 
651 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  23.07 
 
 
727 aa  107  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1175  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.2 
 
 
651 aa  106  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193331 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0421  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.2 
 
 
651 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.45 
 
 
697 aa  106  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03100  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  23.85 
 
 
655 aa  105  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03051  hypothetical protein  23.85 
 
 
655 aa  105  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.75 
 
 
692 aa  105  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.28 
 
 
679 aa  103  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.85 
 
 
655 aa  104  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.85 
 
 
655 aa  104  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.99 
 
 
655 aa  103  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0264  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  22.09 
 
 
662 aa  103  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3723  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.85 
 
 
655 aa  103  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.61 
 
 
655 aa  103  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0466  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.85 
 
 
655 aa  103  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  25.62 
 
 
662 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0466  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.85 
 
 
655 aa  103  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0396  aromatic acid (fusaric acid) exporter, (ArAE)family  24.79 
 
 
727 aa  103  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.62 
 
 
680 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  41.45 
 
 
676 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.56 
 
 
653 aa  102  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  25.86 
 
 
731 aa  103  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0484  fusaric acid resistance protein region  25.84 
 
 
679 aa  101  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.122808  normal  0.212474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>