210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0867 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  100 
 
 		 692 aa  1353    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  59.79 
 
 		 672 aa  732    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  40.06 
 
 		 698 aa  465  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  39.8 
 
 		 697 aa  449  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  43.8 
 
 		 680 aa  411  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  38.91 
 
 		 670 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  38.18 
 
 		 691 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3170  fusaric acid resistance protein region  37.08 
 
 		 716 aa  365  2e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.841968 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  41.03 
 
 		 679 aa  360  5e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  39.74 
 
 		 680 aa  357  5.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  35.29 
 
 		 718 aa  351  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  37.11 
 
 		 681 aa  350  7e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  37.92 
 
 		 679 aa  349  9e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  34.12 
 
 		 659 aa  346  7e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  37.94 
 
 		 688 aa  343  8e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2406  fusaric acid resistance protein region  40.58 
 
 		 690 aa  342  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  36.82 
 
 		 702 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  37.97 
 
 		 687 aa  337  5e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  35.12 
 
 		 700 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  34.98 
 
 		 700 aa  333  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7722  fusaric acid resistance protein  34.89 
 
 		 710 aa  333  9e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  35.24 
 
 		 697 aa  332  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6148  fusaric acid resistance protein region  34.97 
 
 		 710 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.623711 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0110  fusaric acid resistance protein, putative  34.56 
 
 		 749 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6657  fusaric acid resistance protein region  35.29 
 
 		 707 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5813  fusaric acid resistance protein region  35.11 
 
 		 707 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6177  fusaric acid resistance protein region  35.11 
 
 		 707 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6015  fusaric acid resistance protein region  34.45 
 
 		 713 aa  321  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  37.13 
 
 		 704 aa  320  5e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5771  fusaric acid resistance protein region  35.67 
 
 		 719 aa  318  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  32.84 
 
 		 687 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3618  hypothetical protein  32.2 
 
 		 688 aa  302  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.94953  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3378  fusaric acid resistance protein region  31.85 
 
 		 695 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  33.04 
 
 		 695 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  36.08 
 
 		 653 aa  296  6e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  33.28 
 
 		 695 aa  296  9e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  34.11 
 
 		 625 aa  295  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  33.28 
 
 		 695 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  34.18 
 
 		 695 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  34.05 
 
 		 682 aa  293  7e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  33.92 
 
 		 713 aa  290  5.0000000000000004e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3501  fusaric acid resistance protein region  36.4 
 
 		 639 aa  290  6e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  32.62 
 
 		 664 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4098  efflux transporter  29.78 
 
 		 693 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870113  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  32.39 
 
 		 664 aa  191  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  30.75 
 
 		 726 aa  179  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  29.71 
 
 		 676 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  30.67 
 
 		 662 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  33.04 
 
 		 679 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  29 
 
 		 662 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  30.69 
 
 		 691 aa  165  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  29.13 
 
 		 676 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  29.78 
 
 		 662 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  27.02 
 
 		 670 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  29.73 
 
 		 673 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  29.73 
 
 		 673 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  29.73 
 
 		 673 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  27 
 
 		 744 aa  150  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1175  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.88 
 
 		 651 aa  148  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193331 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0485  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.88 
 
 		 651 aa  148  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0421  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.88 
 
 		 651 aa  148  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  25.14 
 
 		 730 aa  147  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.79 
 
 		 739 aa  147  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  28.45 
 
 		 736 aa  146  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0264  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  26.12 
 
 		 662 aa  144  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  28.4 
 
 		 725 aa  144  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  28.4 
 
 		 725 aa  144  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03100  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  25.57 
 
 		 655 aa  139  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0466  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.95 
 
 		 655 aa  139  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3723  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.95 
 
 		 655 aa  139  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  27.43 
 
 		 729 aa  139  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.95 
 
 		 655 aa  139  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.95 
 
 		 655 aa  139  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03051  hypothetical protein  25.57 
 
 		 655 aa  139  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.95 
 
 		 655 aa  139  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  28.04 
 
 		 724 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0466  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.95 
 
 		 655 aa  139  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  27.79 
 
 		 725 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  27 
 
 		 728 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  26.71 
 
 		 733 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.95 
 
 		 655 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  27.1 
 
 		 711 aa  138  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  29.6 
 
 		 676 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  25.34 
 
 		 727 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  26.43 
 
 		 731 aa  135  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  26.12 
 
 		 733 aa  134  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  27.79 
 
 		 724 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  27.11 
 
 		 732 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  26.12 
 
 		 733 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  26.12 
 
 		 733 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  26.12 
 
 		 733 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  26.12 
 
 		 733 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  26.12 
 
 		 733 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  26.12 
 
 		 733 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  26.69 
 
 		 725 aa  133  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0273  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.73 
 
 		 662 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.489457  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  26.99 
 
 		 699 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.62 
 
 		 655 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.269228 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3627  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.62 
 
 		 655 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.35242  normal  0.2133 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.62 
 
 		 655 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.374606  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>