188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3170 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II0110  fusaric acid resistance protein, putative  61.35 
 
 		 749 aa  757    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3170  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 		 716 aa  1408    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.841968 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  37.22 
 
 		 692 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  36.45 
 
 		 680 aa  349  8e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  37.85 
 
 		 679 aa  332  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.85 
 
 		 672 aa  327  5e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  32.98 
 
 		 681 aa  319  9e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  34.1 
 
 		 691 aa  317  5e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  36.28 
 
 		 680 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.12 
 
 		 688 aa  309  9e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.09 
 
 		 670 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  31.26 
 
 		 698 aa  300  7e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  31.08 
 
 		 659 aa  295  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  30.13 
 
 		 697 aa  294  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2406  fusaric acid resistance protein region  34.32 
 
 		 690 aa  293  6e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  32.19 
 
 		 679 aa  290  7e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  30.37 
 
 		 718 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  31.05 
 
 		 704 aa  282  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  30 
 
 		 702 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  33.38 
 
 		 687 aa  274  4.0000000000000004e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.37 
 
 		 700 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  30.68 
 
 		 700 aa  263  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  31.43 
 
 		 682 aa  263  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.44 
 
 		 697 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  30 
 
 		 713 aa  255  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7722  fusaric acid resistance protein  29.94 
 
 		 710 aa  250  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6015  fusaric acid resistance protein region  29.25 
 
 		 713 aa  241  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  31 
 
 		 653 aa  239  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3501  fusaric acid resistance protein region  32.22 
 
 		 639 aa  236  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6148  fusaric acid resistance protein region  30.13 
 
 		 710 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.623711 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5771  fusaric acid resistance protein region  29.68 
 
 		 719 aa  234  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6657  fusaric acid resistance protein region  29.71 
 
 		 707 aa  231  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5813  fusaric acid resistance protein region  29.57 
 
 		 707 aa  230  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6177  fusaric acid resistance protein region  29.57 
 
 		 707 aa  230  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  28.1 
 
 		 625 aa  228  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  27.3 
 
 		 687 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  28.61 
 
 		 695 aa  226  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  28.02 
 
 		 695 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  28.13 
 
 		 695 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3618  hypothetical protein  28.21 
 
 		 688 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.94953  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  29.64 
 
 		 695 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3378  fusaric acid resistance protein region  27.69 
 
 		 695 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4098  efflux transporter  29.97 
 
 		 693 aa  205  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870113  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  29.44 
 
 		 676 aa  150  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  26.11 
 
 		 744 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  28.45 
 
 		 679 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  25.22 
 
 		 676 aa  144  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  26.01 
 
 		 664 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  26.44 
 
 		 662 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  26.01 
 
 		 662 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  26.32 
 
 		 662 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  23.75 
 
 		 733 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  28.27 
 
 		 673 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  28.27 
 
 		 673 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  28.27 
 
 		 673 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  23.33 
 
 		 733 aa  124  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  27.18 
 
 		 676 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  23.46 
 
 		 736 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  25.47 
 
 		 733 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  22.69 
 
 		 722 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  23.37 
 
 		 730 aa  118  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  25.17 
 
 		 733 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  25.32 
 
 		 729 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  23.54 
 
 		 734 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  23.85 
 
 		 670 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  24.21 
 
 		 699 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  26.49 
 
 		 726 aa  114  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  25.97 
 
 		 733 aa  111  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  25.97 
 
 		 733 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  25.97 
 
 		 733 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  25.97 
 
 		 733 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  25.97 
 
 		 733 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  25.97 
 
 		 733 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  25.97 
 
 		 733 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  23.13 
 
 		 734 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  25.86 
 
 		 725 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  23.13 
 
 		 734 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  23.13 
 
 		 734 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  24.41 
 
 		 728 aa  108  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  25.18 
 
 		 731 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  23.6 
 
 		 691 aa  107  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  23.51 
 
 		 731 aa  107  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  25 
 
 		 725 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  25 
 
 		 725 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4213  fusaric acid resistance protein region  24.69 
 
 		 726 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260755 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  22.16 
 
 		 727 aa  105  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3739  fusaric acid resistance protein region  24.69 
 
 		 726 aa  105  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.7262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  23.94 
 
 		 731 aa  105  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  24.15 
 
 		 725 aa  104  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  32.67 
 
 		 664 aa  104  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  25 
 
 		 725 aa  104  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  28.04 
 
 		 724 aa  104  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  27.81 
 
 		 724 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  23.33 
 
 		 732 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0396  aromatic acid (fusaric acid) exporter, (ArAE)family  24.24 
 
 		 727 aa  99  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4286  fusaric acid resistance protein region  24.13 
 
 		 727 aa  99  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.566792 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.47 
 
 		 739 aa  98.6  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1401  fusaric acid resistance protein region  25.42 
 
 		 714 aa  95.9  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.855004 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03100  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  23.22 
 
 		 655 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03051  hypothetical protein  23.22 
 
 		 655 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>