198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3343 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  100 
 
 
688 aa  1350    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  45.71 
 
 
680 aa  486  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  48.21 
 
 
680 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  47.86 
 
 
679 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  42.68 
 
 
670 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2406  fusaric acid resistance protein region  47.09 
 
 
690 aa  450  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  41.2 
 
 
681 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  37.96 
 
 
691 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  36.11 
 
 
698 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  39.67 
 
 
679 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  36 
 
 
697 aa  364  3e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  37.88 
 
 
659 aa  342  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  35.72 
 
 
700 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  37.28 
 
 
692 aa  335  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  35.32 
 
 
697 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  37.06 
 
 
672 aa  332  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  37.96 
 
 
687 aa  332  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  35.56 
 
 
700 aa  328  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6015  fusaric acid resistance protein region  35.98 
 
 
713 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  34.27 
 
 
713 aa  326  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5771  fusaric acid resistance protein region  35.82 
 
 
719 aa  325  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  36.15 
 
 
704 aa  318  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7722  fusaric acid resistance protein  35.59 
 
 
710 aa  316  9e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5813  fusaric acid resistance protein region  35.82 
 
 
707 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6177  fusaric acid resistance protein region  35.82 
 
 
707 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717344  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6657  fusaric acid resistance protein region  35.82 
 
 
707 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  35.45 
 
 
702 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  37.95 
 
 
625 aa  310  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  33.71 
 
 
718 aa  309  9e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  37.43 
 
 
682 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6148  fusaric acid resistance protein region  36.07 
 
 
710 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.623711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3170  fusaric acid resistance protein region  33.73 
 
 
716 aa  300  6e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.841968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  33.73 
 
 
695 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  32.43 
 
 
695 aa  290  7e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  32.09 
 
 
695 aa  287  5e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  31.4 
 
 
687 aa  287  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  32.88 
 
 
695 aa  283  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.91 
 
 
653 aa  282  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0110  fusaric acid resistance protein, putative  32.89 
 
 
749 aa  278  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3618  hypothetical protein  32.44 
 
 
688 aa  275  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.94953  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3378  fusaric acid resistance protein region  32.59 
 
 
695 aa  272  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926577  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3501  fusaric acid resistance protein region  33.94 
 
 
639 aa  248  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4098  efflux transporter  32.25 
 
 
693 aa  220  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870113  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  28.8 
 
 
744 aa  188  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  27.17 
 
 
736 aa  178  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.06 
 
 
739 aa  177  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  29.06 
 
 
676 aa  168  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  31.13 
 
 
676 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  28.23 
 
 
733 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  26.83 
 
 
731 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  28.23 
 
 
733 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  25.46 
 
 
726 aa  162  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  28.23 
 
 
733 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  28.23 
 
 
733 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  28.23 
 
 
733 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  28.23 
 
 
733 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  26.83 
 
 
732 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.23 
 
 
733 aa  162  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  26.71 
 
 
730 aa  161  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  26.46 
 
 
727 aa  161  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  25.49 
 
 
670 aa  160  9e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  27.53 
 
 
725 aa  158  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  31.62 
 
 
673 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  31.62 
 
 
673 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  31.62 
 
 
673 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  26.99 
 
 
734 aa  156  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  27.74 
 
 
733 aa  156  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  26.89 
 
 
725 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  26.89 
 
 
725 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  27.67 
 
 
733 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  27.95 
 
 
733 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  27.38 
 
 
733 aa  154  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  26.38 
 
 
725 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  29.16 
 
 
662 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  29.37 
 
 
662 aa  151  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  29.95 
 
 
662 aa  150  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.96 
 
 
653 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  30.34 
 
 
662 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  25.81 
 
 
725 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4286  fusaric acid resistance protein region  25 
 
 
727 aa  145  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.566792 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.34 
 
 
722 aa  145  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  24.28 
 
 
729 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  25.73 
 
 
726 aa  140  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0396  aromatic acid (fusaric acid) exporter, (ArAE)family  26.59 
 
 
727 aa  139  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  26.09 
 
 
731 aa  138  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  25.11 
 
 
728 aa  137  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  26.82 
 
 
699 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4279  putative fusaric acid resistance protein  25.98 
 
 
728 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  27.54 
 
 
724 aa  134  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  25.64 
 
 
731 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  25.9 
 
 
691 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  45.03 
 
 
664 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.7 
 
 
699 aa  131  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  28.02 
 
 
724 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  44.37 
 
 
664 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  27.29 
 
 
711 aa  122  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0485  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.95 
 
 
651 aa  117  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0421  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.95 
 
 
651 aa  117  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1175  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.95 
 
 
651 aa  117  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193331 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  43.24 
 
 
676 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>