185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4279 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4279  putative fusaric acid resistance protein  100 
 
 		 728 aa  1463    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5713  fusaric acid resistance protein region  36.08 
 
 		 750 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  0.787817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  33.71 
 
 		 730 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  33.33 
 
 		 733 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  33.43 
 
 		 733 aa  365  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  32.34 
 
 		 734 aa  363  6e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  33.57 
 
 		 736 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  32.36 
 
 		 734 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  32.36 
 
 		 734 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  32.22 
 
 		 734 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.33 
 
 		 739 aa  350  8e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  33.76 
 
 		 726 aa  348  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  34.07 
 
 		 733 aa  347  6e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  32.59 
 
 		 744 aa  345  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  33.01 
 
 		 731 aa  340  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  31.21 
 
 		 726 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  33.15 
 
 		 731 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  32.81 
 
 		 733 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  33.33 
 
 		 733 aa  331  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  33.33 
 
 		 733 aa  331  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  33.33 
 
 		 733 aa  331  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  33.33 
 
 		 733 aa  331  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  33.33 
 
 		 733 aa  331  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  33.33 
 
 		 733 aa  331  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  33.33 
 
 		 733 aa  331  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.12 
 
 		 722 aa  329  9e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  31.53 
 
 		 725 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  31.53 
 
 		 725 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  31.84 
 
 		 732 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  31.31 
 
 		 725 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  31.25 
 
 		 725 aa  326  9e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  31.35 
 
 		 731 aa  323  6e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  31.88 
 
 		 728 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  31.62 
 
 		 729 aa  318  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  32.05 
 
 		 725 aa  313  4.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4286  fusaric acid resistance protein region  33.11 
 
 		 727 aa  301  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.566792 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4042  fusaric acid resistance protein region  30.85 
 
 		 727 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4324  fusaric acid resistance protein region  30.85 
 
 		 727 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4213  fusaric acid resistance protein region  31.02 
 
 		 726 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260755 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3739  fusaric acid resistance protein region  30.64 
 
 		 726 aa  289  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.7262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3197  fusaric acid resistance protein region  30.72 
 
 		 727 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1024  putative fusaric acid resistance protein  31.76 
 
 		 745 aa  287  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2328  fusaric acid resistance domain-containing protein  31.72 
 
 		 745 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0595  fusaric acid resistance domain-containing protein  31.76 
 
 		 745 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0873  fusaric acid resistance domain-containing protein  31.76 
 
 		 745 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1840  fusaric acid resistance domain-containing protein  31.76 
 
 		 745 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1110  putative fusaric acid resistance protein  31.62 
 
 		 745 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.853894  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1682  fusaric acid resistance protein  30.73 
 
 		 727 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  29.77 
 
 		 727 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0396  aromatic acid (fusaric acid) exporter, (ArAE)family  30.04 
 
 		 727 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1647  fusaric acid resistance domain-containing protein  31.7 
 
 		 743 aa  260  8e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1863  hypothetical protein  30.86 
 
 		 411 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  27.58 
 
 		 664 aa  164  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  29.36 
 
 		 673 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  29.36 
 
 		 673 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  29.36 
 
 		 673 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  25.18 
 
 		 676 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  29.5 
 
 		 676 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.06 
 
 		 688 aa  145  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  27 
 
 		 676 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  25.88 
 
 		 679 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  26.19 
 
 		 691 aa  140  8.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  27.79 
 
 		 724 aa  140  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.86 
 
 		 699 aa  139  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  28.27 
 
 		 724 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.86 
 
 		 670 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  26 
 
 		 702 aa  137  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.83 
 
 		 700 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  25.71 
 
 		 697 aa  134  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  26.03 
 
 		 704 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1401  fusaric acid resistance protein region  26.9 
 
 		 714 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  25.83 
 
 		 700 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.53 
 
 		 679 aa  131  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  26.32 
 
 		 699 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.73 
 
 		 653 aa  127  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  25.88 
 
 		 662 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  26.18 
 
 		 662 aa  126  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.18 
 
 		 697 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1808  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.54 
 
 		 742 aa  125  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  22.22 
 
 		 670 aa  124  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48340  hypothetical protein  28.05 
 
 		 679 aa  124  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00973423  normal  0.112211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  38.12 
 
 		 664 aa  124  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  21.43 
 
 		 698 aa  123  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0484  fusaric acid resistance protein region  26.02 
 
 		 679 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.122808  normal  0.212474 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  23.59 
 
 		 718 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  24.78 
 
 		 662 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  24.26 
 
 		 713 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  23.84 
 
 		 711 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5223  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.53 
 
 		 678 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0716017 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1802  fusaric acid resistance protein region  24.26 
 
 		 677 aa  118  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1250  hypothetical protein  25.1 
 
 		 690 aa  117  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  26 
 
 		 662 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4155  hypothetical protein  25.8 
 
 		 672 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0306653  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2051  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.39 
 
 		 752 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.06 
 
 		 672 aa  111  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1551  fusaric acid resistance domain protein  25.18 
 
 		 679 aa  111  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2636  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.44 
 
 		 741 aa  111  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1538  fusaric acid resistance domain protein  25.18 
 
 		 679 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0513426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1611  fusaric acid resistance domain-containing protein  25.18 
 
 		 679 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.461133  normal  0.751418 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4422  fusaric acid resistance protein region  25.26 
 
 		 690 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>