218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2983 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  70.38 
 
 		 704 aa  931    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  64.02 
 
 		 702 aa  838    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  100 
 
 		 697 aa  1402    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  38.47 
 
 		 653 aa  393  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  37.31 
 
 		 680 aa  332  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  35.32 
 
 		 688 aa  316  8e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  33.23 
 
 		 691 aa  306  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  35.24 
 
 		 692 aa  304  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.97 
 
 		 680 aa  300  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  34.35 
 
 		 681 aa  296  7e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  32.71 
 
 		 672 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  35.79 
 
 		 679 aa  290  7e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  31 
 
 		 698 aa  290  9e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  31.15 
 
 		 697 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.02 
 
 		 670 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.43 
 
 		 679 aa  276  7e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  33.59 
 
 		 718 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.97 
 
 		 700 aa  269  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5771  fusaric acid resistance protein region  31.23 
 
 		 719 aa  265  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7722  fusaric acid resistance protein  31.34 
 
 		 710 aa  263  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  31.75 
 
 		 700 aa  262  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6015  fusaric acid resistance protein region  30.92 
 
 		 713 aa  261  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2406  fusaric acid resistance protein region  34.26 
 
 		 690 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6657  fusaric acid resistance protein region  30.76 
 
 		 707 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5813  fusaric acid resistance protein region  30.54 
 
 		 707 aa  253  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6177  fusaric acid resistance protein region  30.54 
 
 		 707 aa  253  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6148  fusaric acid resistance protein region  30.39 
 
 		 710 aa  252  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.623711 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  29.47 
 
 		 659 aa  251  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  30.33 
 
 		 682 aa  251  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  31.07 
 
 		 687 aa  250  8e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  28.55 
 
 		 687 aa  239  9e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3170  fusaric acid resistance protein region  29.29 
 
 		 716 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.841968 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0110  fusaric acid resistance protein, putative  29.55 
 
 		 749 aa  229  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  27.04 
 
 		 695 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  26.52 
 
 		 695 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3378  fusaric acid resistance protein region  27.76 
 
 		 695 aa  224  6e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926577  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  26.96 
 
 		 695 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3618  hypothetical protein  27.47 
 
 		 688 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.94953  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  26.45 
 
 		 695 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3501  fusaric acid resistance protein region  32.34 
 
 		 639 aa  218  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  28.7 
 
 		 713 aa  214  5.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4098  efflux transporter  28.16 
 
 		 693 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870113  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  39.6 
 
 		 625 aa  176  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  26.72 
 
 		 727 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  31.73 
 
 		 673 aa  161  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  31.73 
 
 		 673 aa  161  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  31.73 
 
 		 673 aa  161  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  30.57 
 
 		 676 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  26.47 
 
 		 676 aa  157  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  28.11 
 
 		 725 aa  154  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  23.2 
 
 		 670 aa  150  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  25.39 
 
 		 744 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  24.41 
 
 		 736 aa  147  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  26.55 
 
 		 726 aa  146  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  27.36 
 
 		 662 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  26.56 
 
 		 733 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  26.56 
 
 		 733 aa  145  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  27.27 
 
 		 733 aa  145  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  25.22 
 
 		 699 aa  145  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  26.56 
 
 		 733 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  26.56 
 
 		 733 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  26.56 
 
 		 733 aa  145  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  26.56 
 
 		 733 aa  145  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  26.56 
 
 		 733 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.16 
 
 		 739 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  26.83 
 
 		 662 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  27.17 
 
 		 662 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  25.93 
 
 		 731 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  26.3 
 
 		 679 aa  140  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  26.89 
 
 		 732 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  25.62 
 
 		 729 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.09 
 
 		 653 aa  136  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  27.45 
 
 		 724 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  25.68 
 
 		 728 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  28.46 
 
 		 676 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.08 
 
 		 722 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  27.07 
 
 		 734 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  25.57 
 
 		 726 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  28.46 
 
 		 676 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  25.28 
 
 		 731 aa  132  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  25.33 
 
 		 731 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  24.02 
 
 		 730 aa  129  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  24.9 
 
 		 724 aa  128  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  25.19 
 
 		 662 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4282  fusaric acid resistance protein region  23.75 
 
 		 711 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4234  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.75 
 
 		 690 aa  124  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0118  fusaric acid resistance protein region  23.5 
 
 		 690 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.429698  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0396  aromatic acid (fusaric acid) exporter, (ArAE)family  24.79 
 
 		 727 aa  122  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4422  fusaric acid resistance protein region  23.75 
 
 		 690 aa  122  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  38.82 
 
 		 664 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  24.81 
 
 		 733 aa  117  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  38.16 
 
 		 664 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4279  putative fusaric acid resistance protein  25.18 
 
 		 728 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  24.96 
 
 		 691 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  40.76 
 
 		 733 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  40.76 
 
 		 733 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  23.89 
 
 		 711 aa  114  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  40.13 
 
 		 734 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  40.13 
 
 		 734 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  40.13 
 
 		 734 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>