212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1167 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  91.09 
 
 
662 aa  1153    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 
676 aa  1335    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  90.63 
 
 
662 aa  1150    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  62.67 
 
 
662 aa  705    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  91.09 
 
 
662 aa  1145    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  53.3 
 
 
664 aa  634  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  53.6 
 
 
664 aa  620  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  46.82 
 
 
679 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  47.42 
 
 
679 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  33.23 
 
 
691 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  28.13 
 
 
736 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  33.75 
 
 
676 aa  219  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  29.3 
 
 
744 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.29 
 
 
739 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  33.28 
 
 
673 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  33.28 
 
 
673 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  33.28 
 
 
673 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4422  fusaric acid resistance protein region  29.05 
 
 
690 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4282  fusaric acid resistance protein region  29.05 
 
 
711 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4234  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.05 
 
 
690 aa  207  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0118  fusaric acid resistance protein region  29.05 
 
 
690 aa  207  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.429698  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  28.57 
 
 
733 aa  194  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.13 
 
 
699 aa  194  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  31.49 
 
 
724 aa  193  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  27.12 
 
 
733 aa  190  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  27.55 
 
 
733 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  28.43 
 
 
729 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  30.85 
 
 
731 aa  187  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  28.03 
 
 
733 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  28.03 
 
 
733 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  27.38 
 
 
734 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  28.03 
 
 
733 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  28.03 
 
 
733 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  28.03 
 
 
733 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  28.03 
 
 
733 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  32.93 
 
 
724 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  30.72 
 
 
732 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  27.99 
 
 
733 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  27.62 
 
 
733 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  27.36 
 
 
734 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  27.36 
 
 
734 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  29.73 
 
 
711 aa  184  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  26.39 
 
 
726 aa  183  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.8 
 
 
653 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  27.5 
 
 
734 aa  179  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1292  fusaric acid resistance protein region  25.29 
 
 
681 aa  179  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.944306 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  30.3 
 
 
725 aa  178  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  27.74 
 
 
728 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  27.39 
 
 
726 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  26.07 
 
 
725 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  26.07 
 
 
725 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  27.65 
 
 
730 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  27.34 
 
 
713 aa  172  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  25.77 
 
 
725 aa  172  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.56 
 
 
692 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  27.5 
 
 
659 aa  169  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  25.63 
 
 
725 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.23 
 
 
722 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  27.97 
 
 
731 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  27.49 
 
 
681 aa  164  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.47 
 
 
697 aa  163  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.27 
 
 
670 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  27.27 
 
 
731 aa  161  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  27.51 
 
 
682 aa  158  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  27.63 
 
 
695 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  28.12 
 
 
727 aa  157  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1250  hypothetical protein  28.17 
 
 
690 aa  157  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0421  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  27.24 
 
 
651 aa  157  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0485  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  27.24 
 
 
651 aa  157  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1175  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  27.24 
 
 
651 aa  157  8e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193331 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.52 
 
 
653 aa  157  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  25.54 
 
 
670 aa  156  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  24.6 
 
 
702 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  26.16 
 
 
704 aa  154  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  31.21 
 
 
679 aa  154  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  27.04 
 
 
695 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  27.68 
 
 
695 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.97 
 
 
680 aa  151  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  27.04 
 
 
695 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  24.8 
 
 
698 aa  151  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  26.39 
 
 
687 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  26.27 
 
 
655 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0396  aromatic acid (fusaric acid) exporter, (ArAE)family  25.86 
 
 
727 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4279  putative fusaric acid resistance protein  25.18 
 
 
728 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03100  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  25.81 
 
 
655 aa  148  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0466  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.27 
 
 
655 aa  148  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3723  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  26.27 
 
 
655 aa  148  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0466  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  26.27 
 
 
655 aa  148  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  26.27 
 
 
655 aa  148  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03051  hypothetical protein  25.81 
 
 
655 aa  148  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  26.27 
 
 
655 aa  148  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  26.18 
 
 
655 aa  148  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  23.99 
 
 
697 aa  146  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3618  hypothetical protein  27.3 
 
 
688 aa  144  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.94953  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1538  fusaric acid resistance domain protein  25.83 
 
 
679 aa  144  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0513426  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1551  fusaric acid resistance domain protein  25.83 
 
 
679 aa  143  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1611  fusaric acid resistance domain-containing protein  25.83 
 
 
679 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.461133  normal  0.751418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1733  fusaric acid resistance domain protein  25.83 
 
 
679 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105287  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1902  fusaric acid resistance domain-containing protein  25.83 
 
 
679 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.48277  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3677  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  26.82 
 
 
655 aa  142  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>