211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3536 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03100  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  99.39 
 
 
655 aa  1333    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0466  Fusaric acid resistance protein conserved region  99.69 
 
 
655 aa  1339    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  99.69 
 
 
655 aa  1340    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  100 
 
 
655 aa  1343    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  92.37 
 
 
655 aa  1212    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.374606  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3662  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  92.37 
 
 
655 aa  1212    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250155  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0273  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  62.83 
 
 
662 aa  841    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.489457  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0466  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  99.85 
 
 
655 aa  1342    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4390  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  63.21 
 
 
655 aa  824    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3667  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  54.97 
 
 
651 aa  690    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3627  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  92.37 
 
 
655 aa  1212    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.35242  normal  0.2133 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  99.54 
 
 
655 aa  1336    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3825  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  57.3 
 
 
649 aa  722    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0264  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  64.91 
 
 
662 aa  847    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0421  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  64.64 
 
 
651 aa  871    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1175  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  64.64 
 
 
651 aa  871    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193331 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3723  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  99.85 
 
 
655 aa  1342    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  99.54 
 
 
655 aa  1338    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0485  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  64.64 
 
 
651 aa  871    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3555  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  92.21 
 
 
655 aa  1209    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3677  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  83.05 
 
 
655 aa  1126    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03051  hypothetical protein  99.39 
 
 
655 aa  1333    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  92.37 
 
 
655 aa  1212    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.269228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  27.08 
 
 
664 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  27.54 
 
 
679 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  27.32 
 
 
699 aa  147  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  26.27 
 
 
676 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  26.72 
 
 
664 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.53 
 
 
672 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  26.72 
 
 
662 aa  134  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.13 
 
 
692 aa  133  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  26.1 
 
 
662 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  27.57 
 
 
662 aa  129  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  26.14 
 
 
662 aa  125  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  25.44 
 
 
673 aa  124  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  25.44 
 
 
673 aa  124  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  25.44 
 
 
673 aa  124  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  24.67 
 
 
713 aa  121  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  25.65 
 
 
691 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  23.36 
 
 
687 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  22.39 
 
 
695 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  21.93 
 
 
695 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  21.96 
 
 
724 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  22.12 
 
 
695 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  24.42 
 
 
659 aa  114  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  22.55 
 
 
695 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  23.37 
 
 
726 aa  114  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  23.66 
 
 
700 aa  112  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7722  fusaric acid resistance protein  23.89 
 
 
710 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3378  fusaric acid resistance protein region  24.34 
 
 
695 aa  110  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926577  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  25.14 
 
 
681 aa  109  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  27.78 
 
 
724 aa  108  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  24.95 
 
 
676 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  25.37 
 
 
736 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  22.96 
 
 
711 aa  105  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5813  fusaric acid resistance protein region  23.89 
 
 
707 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6177  fusaric acid resistance protein region  23.89 
 
 
707 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717344  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3618  hypothetical protein  23.19 
 
 
688 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.94953  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.11 
 
 
700 aa  103  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6657  fusaric acid resistance protein region  23.48 
 
 
707 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6015  fusaric acid resistance protein region  23.16 
 
 
713 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  32.49 
 
 
679 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5771  fusaric acid resistance protein region  23.12 
 
 
719 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6148  fusaric acid resistance protein region  23.48 
 
 
710 aa  102  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.623711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.19 
 
 
722 aa  101  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5952  membrane protein  24.24 
 
 
623 aa  99.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  23.71 
 
 
718 aa  100  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  25.21 
 
 
726 aa  99.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  23.63 
 
 
733 aa  96.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  23.92 
 
 
733 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  23.92 
 
 
733 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  24.74 
 
 
625 aa  96.3  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  23.92 
 
 
733 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  23.92 
 
 
733 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  23.92 
 
 
733 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  23.92 
 
 
733 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  23.92 
 
 
733 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4282  fusaric acid resistance protein region  22.83 
 
 
711 aa  94.4  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  35.44 
 
 
698 aa  94.4  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4234  Fusaric acid resistance protein conserved region  22.83 
 
 
690 aa  94  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  35.44 
 
 
697 aa  94  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1292  fusaric acid resistance protein region  25.35 
 
 
681 aa  93.6  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.944306 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  24.49 
 
 
744 aa  93.6  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4422  fusaric acid resistance protein region  22.64 
 
 
690 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0118  fusaric acid resistance protein region  22.83 
 
 
690 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.429698  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  25.1 
 
 
733 aa  92  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4155  hypothetical protein  25 
 
 
672 aa  92  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0306653  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.94 
 
 
670 aa  91.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.83 
 
 
739 aa  91.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2357  fusaric acid resistance domain protein  23.94 
 
 
663 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000905484  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1250  hypothetical protein  24.81 
 
 
690 aa  90.9  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  23.52 
 
 
682 aa  90.1  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1802  fusaric acid resistance protein region  22.46 
 
 
677 aa  90.1  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1984  fusaric acid resistance protein region  23.94 
 
 
670 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0152424  hitchhiker  0.000622676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  22.45 
 
 
730 aa  89  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1553  fusaric acid resistance domain-containing protein  23.94 
 
 
670 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.266646  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1995  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.94 
 
 
670 aa  89  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000064393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1856  fusaric acid resistance domain-containing protein  23.94 
 
 
670 aa  89  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0794628  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1722  fusaric acid resistance domain-containing protein  23.94 
 
 
670 aa  89  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  22.77 
 
 
653 aa  89  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>