200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4390 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03100  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  63.37 
 
 
655 aa  843    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0466  Fusaric acid resistance protein conserved region  63.37 
 
 
655 aa  844    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  63.06 
 
 
655 aa  840    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3667  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  54.81 
 
 
651 aa  690    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3627  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  62.29 
 
 
655 aa  813    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.35242  normal  0.2133 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0466  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  63.37 
 
 
655 aa  843    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0264  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  64.26 
 
 
662 aa  838    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4390  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  100 
 
 
655 aa  1343    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3555  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  62.29 
 
 
655 aa  812    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1175  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  71.1 
 
 
651 aa  969    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193331 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  63.21 
 
 
655 aa  842    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  62.29 
 
 
655 aa  813    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.269228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  63.37 
 
 
655 aa  845    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03051  hypothetical protein  63.37 
 
 
655 aa  843    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3662  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  62.29 
 
 
655 aa  812    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250155  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0273  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  60.09 
 
 
662 aa  808    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.489457  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  63.21 
 
 
655 aa  842    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0485  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  71.1 
 
 
651 aa  969    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3723  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  63.37 
 
 
655 aa  843    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  62.29 
 
 
655 aa  813    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.374606  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3677  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  62.91 
 
 
655 aa  848    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3825  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  60.76 
 
 
649 aa  766    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0421  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  71.1 
 
 
651 aa  969    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  25.08 
 
 
699 aa  144  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  27.04 
 
 
676 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  25.91 
 
 
664 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  27.33 
 
 
662 aa  125  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  26.35 
 
 
664 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.26 
 
 
672 aa  123  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  26.94 
 
 
662 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  24.62 
 
 
724 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  25.4 
 
 
673 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  25.4 
 
 
673 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  25.4 
 
 
673 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  24.62 
 
 
724 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  26.47 
 
 
676 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  26.67 
 
 
676 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  26.55 
 
 
662 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  22.56 
 
 
670 aa  115  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4422  fusaric acid resistance protein region  26.69 
 
 
690 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4234  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.69 
 
 
690 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4282  fusaric acid resistance protein region  26.69 
 
 
711 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  22.49 
 
 
713 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0118  fusaric acid resistance protein region  26.69 
 
 
690 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.429698  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  21.29 
 
 
698 aa  107  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  25.29 
 
 
676 aa  107  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  26.43 
 
 
662 aa  107  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  23.01 
 
 
711 aa  105  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  23.94 
 
 
691 aa  105  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  22.92 
 
 
692 aa  104  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  25 
 
 
653 aa  103  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  36.21 
 
 
679 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  35.63 
 
 
679 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  23.39 
 
 
687 aa  99  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  22.27 
 
 
697 aa  98.2  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1802  fusaric acid resistance protein region  22.14 
 
 
677 aa  95.5  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1553  fusaric acid resistance domain-containing protein  22.3 
 
 
670 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.266646  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  23.95 
 
 
726 aa  92.8  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01615  conserved inner membrane protein  22.3 
 
 
670 aa  92  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.174689  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1856  fusaric acid resistance domain-containing protein  22.3 
 
 
670 aa  92  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0794628  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1984  fusaric acid resistance protein region  22.3 
 
 
670 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0152424  hitchhiker  0.000622676 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1995  Fusaric acid resistance protein conserved region  22.3 
 
 
670 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000064393  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3378  fusaric acid resistance protein region  23.22 
 
 
695 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926577  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1722  fusaric acid resistance domain-containing protein  22.3 
 
 
670 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2357  fusaric acid resistance domain protein  22.3 
 
 
663 aa  91.3  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000905484  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  32.37 
 
 
670 aa  91.3  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  22.46 
 
 
733 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1837  fusaric acid resistance domain protein  22.12 
 
 
670 aa  89  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235624  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  22.46 
 
 
733 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  22.46 
 
 
733 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  22.46 
 
 
733 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  22.46 
 
 
733 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  22.46 
 
 
733 aa  89  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  21.34 
 
 
659 aa  88.6  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5952  membrane protein  23.51 
 
 
623 aa  87.8  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  22.61 
 
 
733 aa  87.4  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  22.32 
 
 
733 aa  87.4  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  23.91 
 
 
727 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  22.61 
 
 
718 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3618  hypothetical protein  21.9 
 
 
688 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.94953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48340  hypothetical protein  22.9 
 
 
679 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00973423  normal  0.112211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  22.24 
 
 
736 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7722  fusaric acid resistance protein  21.89 
 
 
710 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  22.01 
 
 
625 aa  83.2  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  21.34 
 
 
695 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  23.18 
 
 
682 aa  82  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1551  fusaric acid resistance domain protein  21.49 
 
 
679 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4155  hypothetical protein  23.68 
 
 
672 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0306653  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  23.5 
 
 
681 aa  80.9  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1902  fusaric acid resistance domain-containing protein  21.49 
 
 
679 aa  80.9  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.48277  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1538  fusaric acid resistance domain protein  21.49 
 
 
679 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0513426  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.78 
 
 
680 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  20.56 
 
 
697 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1611  fusaric acid resistance domain-containing protein  21.49 
 
 
679 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.461133  normal  0.751418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1733  fusaric acid resistance domain protein  21.49 
 
 
679 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105287  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5771  fusaric acid resistance protein region  21.37 
 
 
719 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  21.14 
 
 
695 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2060  fusaric acid resistance protein region  32.37 
 
 
635 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.065197  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1401  fusaric acid resistance protein region  21.26 
 
 
714 aa  77.8  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  20.83 
 
 
695 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>