266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5952 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5952  membrane protein  100 
 
 		 623 aa  1245    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2060  fusaric acid resistance protein region  29.18 
 
 		 635 aa  210  8e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.065197  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.4 
 
 		 641 aa  205  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2360  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.28 
 
 		 639 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1306  fusaric acid resistance protein region  30.55 
 
 		 644 aa  175  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.389506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  29.7 
 
 		 673 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  29.7 
 
 		 673 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  29.7 
 
 		 673 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0233  membrane protein-like  32.07 
 
 		 653 aa  163  9e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5715  fusaric acid resistance protein region  29.4 
 
 		 661 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277565 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  28.38 
 
 		 676 aa  151  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  28.2 
 
 		 676 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  27.43 
 
 		 676 aa  146  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.38 
 
 		 653 aa  139  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6856  fusaric acid resistance protein  27.32 
 
 		 700 aa  136  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.81 
 
 		 722 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  26.37 
 
 		 676 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.12 
 
 		 699 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  26.23 
 
 		 662 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  23.7 
 
 		 691 aa  111  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  26.23 
 
 		 662 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1401  fusaric acid resistance protein region  24.23 
 
 		 714 aa  110  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  24.26 
 
 		 731 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  25.17 
 
 		 711 aa  107  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  25 
 
 		 732 aa  107  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0466  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.22 
 
 		 655 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.165029 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0466  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.22 
 
 		 655 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.22 
 
 		 655 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.22 
 
 		 655 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.22 
 
 		 655 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.22 
 
 		 655 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3723  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.22 
 
 		 655 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  26.43 
 
 		 662 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  25.1 
 
 		 726 aa  105  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03100  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  24 
 
 		 655 aa  104  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03051  hypothetical protein  24 
 
 		 655 aa  104  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2071  hypothetical protein  29.2 
 
 		 493 aa  103  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.555824 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0264  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.44 
 
 		 662 aa  103  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  23.67 
 
 		 664 aa  102  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3662  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.34 
 
 		 655 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3555  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.86 
 
 		 655 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.86 
 
 		 655 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.269228 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3627  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.86 
 
 		 655 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.35242  normal  0.2133 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.86 
 
 		 655 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.374606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.2 
 
 		 653 aa  100  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  31 
 
 		 724 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0396  aromatic acid (fusaric acid) exporter, (ArAE)family  24.73 
 
 		 727 aa  97.8  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  31.5 
 
 		 724 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0273  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.79 
 
 		 662 aa  97.8  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.489457  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  35.44 
 
 		 664 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1250  hypothetical protein  35.26 
 
 		 690 aa  97.4  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  27.31 
 
 		 679 aa  97.1  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3677  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.99 
 
 		 655 aa  96.7  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4282  fusaric acid resistance protein region  23.71 
 
 		 711 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  35.62 
 
 		 726 aa  94.7  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4234  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.55 
 
 		 690 aa  94  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0118  fusaric acid resistance protein region  23.79 
 
 		 690 aa  94  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.429698  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4422  fusaric acid resistance protein region  22.68 
 
 		 690 aa  93.6  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  37.34 
 
 		 713 aa  93.6  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1292  fusaric acid resistance protein region  32.47 
 
 		 681 aa  90.9  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.944306 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  25.39 
 
 		 659 aa  90.9  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4390  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.31 
 
 		 655 aa  89.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  24.38 
 
 		 731 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4155  hypothetical protein  25.43 
 
 		 672 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0306653  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0485  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  22.98 
 
 		 651 aa  88.2  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1647  fusaric acid resistance domain-containing protein  34 
 
 		 743 aa  88.2  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1175  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  22.98 
 
 		 651 aa  88.2  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193331 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  33.7 
 
 		 679 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0421  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  22.98 
 
 		 651 aa  88.2  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.69 
 
 		 670 aa  87.8  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  24.38 
 
 		 731 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  33.78 
 
 		 733 aa  87.4  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1110  putative fusaric acid resistance protein  34.67 
 
 		 745 aa  87.4  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.853894  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1024  putative fusaric acid resistance protein  34.67 
 
 		 745 aa  87.4  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  32.48 
 
 		 734 aa  87.4  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0595  fusaric acid resistance domain-containing protein  34.67 
 
 		 745 aa  87.4  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2328  fusaric acid resistance domain-containing protein  34.67 
 
 		 745 aa  87.4  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  29.55 
 
 		 702 aa  87  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0873  fusaric acid resistance domain-containing protein  34.67 
 
 		 745 aa  87.4  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1840  fusaric acid resistance domain-containing protein  34.67 
 
 		 745 aa  87.4  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  31.85 
 
 		 733 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  33.77 
 
 		 734 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  31.85 
 
 		 733 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48340  hypothetical protein  26.71 
 
 		 679 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00973423  normal  0.112211 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  33.77 
 
 		 734 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  33.11 
 
 		 744 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4756  fusaric acid resistance protein region  31.82 
 
 		 678 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5298  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.53 
 
 		 678 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.812245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  30.64 
 
 		 697 aa  85.9  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  31.21 
 
 		 734 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5223  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.82 
 
 		 678 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0716017 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4042  fusaric acid resistance protein region  36.99 
 
 		 727 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4324  fusaric acid resistance protein region  36.99 
 
 		 727 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  33.33 
 
 		 728 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3197  fusaric acid resistance protein region  36.99 
 
 		 727 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  28.05 
 
 		 704 aa  84.3  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  26.05 
 
 		 682 aa  84  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  23.72 
 
 		 699 aa  83.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4286  fusaric acid resistance protein region  32.41 
 
 		 727 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.566792 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.08 
 
 		 739 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>