187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4756 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_4756  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 
678 aa  1326    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361861  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0484  fusaric acid resistance protein region  66.57 
 
 
679 aa  788    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.122808  normal  0.212474 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5298  Fusaric acid resistance protein conserved region  90.56 
 
 
678 aa  1117    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.812245  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5223  Fusaric acid resistance protein conserved region  98.53 
 
 
678 aa  1303    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0716017 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1401  fusaric acid resistance protein region  36.12 
 
 
714 aa  345  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1250  hypothetical protein  36.42 
 
 
690 aa  323  8e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  29.9 
 
 
664 aa  154  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  26.77 
 
 
726 aa  152  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6856  fusaric acid resistance protein  27.19 
 
 
700 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.54 
 
 
653 aa  143  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  29.46 
 
 
664 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  30.95 
 
 
673 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  30.95 
 
 
673 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  30.95 
 
 
673 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  25.47 
 
 
730 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  27.17 
 
 
725 aa  140  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  30.99 
 
 
676 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  27.76 
 
 
732 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  28.02 
 
 
731 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  25.88 
 
 
725 aa  138  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  28.06 
 
 
731 aa  137  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  28.36 
 
 
713 aa  135  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  26.71 
 
 
731 aa  135  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.5 
 
 
699 aa  134  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  27.29 
 
 
725 aa  134  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  30.49 
 
 
679 aa  134  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  27.29 
 
 
725 aa  134  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  30.19 
 
 
679 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3739  fusaric acid resistance protein region  27.52 
 
 
726 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.7262  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4213  fusaric acid resistance protein region  27.13 
 
 
726 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4042  fusaric acid resistance protein region  28.52 
 
 
727 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4324  fusaric acid resistance protein region  28.52 
 
 
727 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.72 
 
 
722 aa  125  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  25.71 
 
 
734 aa  124  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  28.1 
 
 
676 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  25.93 
 
 
691 aa  120  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2636  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.55 
 
 
741 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1682  fusaric acid resistance protein  25.99 
 
 
727 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158795  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4279  putative fusaric acid resistance protein  27.44 
 
 
728 aa  117  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  26.01 
 
 
725 aa  117  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.32 
 
 
670 aa  117  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48340  hypothetical protein  28.31 
 
 
679 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00973423  normal  0.112211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  27.23 
 
 
687 aa  114  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  43.03 
 
 
676 aa  114  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1306  fusaric acid resistance protein region  27.12 
 
 
644 aa  114  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.389506  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.68 
 
 
653 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  23.83 
 
 
702 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  42.42 
 
 
676 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  24.65 
 
 
697 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  27.65 
 
 
695 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  27.65 
 
 
695 aa  111  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3378  fusaric acid resistance protein region  25.59 
 
 
695 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926577  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  24.29 
 
 
704 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.58 
 
 
697 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  27.45 
 
 
695 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4155  hypothetical protein  27.51 
 
 
672 aa  108  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0306653  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  27.45 
 
 
695 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  24.64 
 
 
670 aa  106  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.83 
 
 
679 aa  104  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3618  hypothetical protein  25.05 
 
 
688 aa  104  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.94953  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.68 
 
 
680 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  26.91 
 
 
724 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  28.7 
 
 
662 aa  103  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.63 
 
 
641 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  26.03 
 
 
724 aa  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  36 
 
 
698 aa  100  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  28.01 
 
 
662 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1808  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.97 
 
 
742 aa  100  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  35.29 
 
 
729 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  35.29 
 
 
728 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6657  fusaric acid resistance protein region  25.09 
 
 
707 aa  98.2  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0396  aromatic acid (fusaric acid) exporter, (ArAE)family  24.27 
 
 
727 aa  97.4  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1175  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.14 
 
 
651 aa  97.4  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193331 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.4 
 
 
680 aa  97.4  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5813  fusaric acid resistance protein region  24.91 
 
 
707 aa  97.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6177  fusaric acid resistance protein region  24.91 
 
 
707 aa  97.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717344  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0485  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.14 
 
 
651 aa  97.4  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0421  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.14 
 
 
651 aa  97.4  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.38 
 
 
672 aa  97.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7722  fusaric acid resistance protein  26.01 
 
 
710 aa  97.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  26.27 
 
 
691 aa  95.5  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  26.09 
 
 
682 aa  94.7  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  26.71 
 
 
662 aa  94  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5771  fusaric acid resistance protein region  25.09 
 
 
719 aa  94  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4234  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.48 
 
 
690 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6015  fusaric acid resistance protein region  25.13 
 
 
713 aa  93.6  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4422  fusaric acid resistance protein region  23.16 
 
 
690 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  33.33 
 
 
726 aa  93.6  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  32.42 
 
 
687 aa  93.6  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  31.33 
 
 
727 aa  92.4  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4282  fusaric acid resistance protein region  23.48 
 
 
711 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  38.13 
 
 
739 aa  92  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  26.8 
 
 
700 aa  91.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  26.1 
 
 
679 aa  91.7  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0118  fusaric acid resistance protein region  23.16 
 
 
690 aa  91.7  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.429698  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  37.41 
 
 
736 aa  91.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  36.43 
 
 
744 aa  91.3  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  25 
 
 
681 aa  90.5  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  26.71 
 
 
662 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  35.86 
 
 
688 aa  90.5  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>