223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2164 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  100 
 
 		 670 aa  1337    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  43.96 
 
 		 680 aa  489  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  45.58 
 
 		 679 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  42.68 
 
 		 688 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  45.28 
 
 		 680 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2406  fusaric acid resistance protein region  42.9 
 
 		 690 aa  415  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  38.47 
 
 		 681 aa  404  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  38.05 
 
 		 691 aa  402  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  38.97 
 
 		 679 aa  394  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  38.25 
 
 		 698 aa  385  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  37.46 
 
 		 697 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  34.88 
 
 		 659 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  39.03 
 
 		 692 aa  364  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  37.48 
 
 		 672 aa  351  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  35.64 
 
 		 700 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  35.55 
 
 		 700 aa  347  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  37.52 
 
 		 687 aa  344  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6015  fusaric acid resistance protein region  35.85 
 
 		 713 aa  345  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5771  fusaric acid resistance protein region  36.91 
 
 		 719 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  35.79 
 
 		 718 aa  340  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  33.97 
 
 		 713 aa  337  3.9999999999999995e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7722  fusaric acid resistance protein  35.67 
 
 		 710 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5813  fusaric acid resistance protein region  36.75 
 
 		 707 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6177  fusaric acid resistance protein region  36.75 
 
 		 707 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6657  fusaric acid resistance protein region  36.6 
 
 		 707 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  36.7 
 
 		 682 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  34.44 
 
 		 695 aa  326  7e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6148  fusaric acid resistance protein region  35.64 
 
 		 710 aa  321  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.623711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  33.67 
 
 		 695 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  33.53 
 
 		 695 aa  320  6e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  34.68 
 
 		 695 aa  317  5e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  34.85 
 
 		 625 aa  316  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  32.52 
 
 		 687 aa  313  9e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3378  fusaric acid resistance protein region  32.94 
 
 		 695 aa  303  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926577  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3618  hypothetical protein  32.89 
 
 		 688 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.94953  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3170  fusaric acid resistance protein region  33.19 
 
 		 716 aa  297  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.841968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.23 
 
 		 697 aa  296  8e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0110  fusaric acid resistance protein, putative  31.91 
 
 		 749 aa  283  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  33.39 
 
 		 704 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  31.33 
 
 		 702 aa  264  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4098  efflux transporter  32.88 
 
 		 693 aa  259  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870113  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3501  fusaric acid resistance protein region  34.92 
 
 		 639 aa  249  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.25 
 
 		 653 aa  247  6e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  27.98 
 
 		 744 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  30.39 
 
 		 676 aa  163  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  30.39 
 
 		 676 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  31.19 
 
 		 676 aa  163  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  29.56 
 
 		 673 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  29.56 
 
 		 673 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  29.56 
 
 		 673 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  27.63 
 
 		 676 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  26.47 
 
 		 725 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  26.03 
 
 		 726 aa  155  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  26.17 
 
 		 725 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  26.17 
 
 		 725 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  26.17 
 
 		 725 aa  153  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  27.68 
 
 		 734 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  28.16 
 
 		 733 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  27.2 
 
 		 691 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  26.86 
 
 		 731 aa  148  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  28.02 
 
 		 732 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  27.94 
 
 		 734 aa  147  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  27.34 
 
 		 731 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  23.28 
 
 		 730 aa  146  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  25.85 
 
 		 727 aa  145  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  28.36 
 
 		 733 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  27.38 
 
 		 734 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  27.38 
 
 		 734 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  28.36 
 
 		 733 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  28.36 
 
 		 733 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  27.53 
 
 		 733 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  28.36 
 
 		 733 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  28.36 
 
 		 733 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  28.36 
 
 		 733 aa  144  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  27.44 
 
 		 733 aa  144  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  27.29 
 
 		 662 aa  144  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  27.86 
 
 		 662 aa  142  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  27.3 
 
 		 662 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  26.88 
 
 		 725 aa  138  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  27.52 
 
 		 733 aa  138  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  27.63 
 
 		 662 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  27.79 
 
 		 733 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  46.36 
 
 		 664 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.36 
 
 		 722 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  45.7 
 
 		 664 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  37.8 
 
 		 736 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  37.8 
 
 		 739 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4279  putative fusaric acid resistance protein  27.26 
 
 		 728 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1250  hypothetical protein  26.87 
 
 		 690 aa  131  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4213  fusaric acid resistance protein region  26.7 
 
 		 726 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260755 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  24.2 
 
 		 699 aa  127  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1647  fusaric acid resistance domain-containing protein  45.51 
 
 		 743 aa  126  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  40.65 
 
 		 726 aa  125  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0595  fusaric acid resistance domain-containing protein  44.23 
 
 		 745 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2328  fusaric acid resistance domain-containing protein  44.23 
 
 		 745 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0873  fusaric acid resistance domain-containing protein  44.23 
 
 		 745 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1110  putative fusaric acid resistance protein  44.23 
 
 		 745 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.853894  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1024  putative fusaric acid resistance protein  44.23 
 
 		 745 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1840  fusaric acid resistance domain-containing protein  44.23 
 
 		 745 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5223  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.87 
 
 		 678 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0716017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>