203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_5051 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  94.82 
 
 
695 aa  1339    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3618  hypothetical protein  70.25 
 
 
688 aa  951    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.94953  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3378  fusaric acid resistance protein region  70.11 
 
 
695 aa  957    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926577  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  70.73 
 
 
687 aa  978    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 
695 aa  1395    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  95.4 
 
 
695 aa  1347    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  94.82 
 
 
695 aa  1338    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  48.77 
 
 
700 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  48.32 
 
 
700 aa  598  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  49.69 
 
 
718 aa  580  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7722  fusaric acid resistance protein  47.34 
 
 
710 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5813  fusaric acid resistance protein region  48.27 
 
 
707 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6177  fusaric acid resistance protein region  48.27 
 
 
707 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717344  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6148  fusaric acid resistance protein region  46.93 
 
 
710 aa  568  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.623711 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6657  fusaric acid resistance protein region  48.12 
 
 
707 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6015  fusaric acid resistance protein region  46.39 
 
 
713 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5771  fusaric acid resistance protein region  48.3 
 
 
719 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  39.7 
 
 
659 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  41.1 
 
 
687 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  37.09 
 
 
691 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  38.86 
 
 
682 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  35.29 
 
 
625 aa  355  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.76 
 
 
679 aa  322  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.39 
 
 
670 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  34.64 
 
 
698 aa  311  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.36 
 
 
672 aa  310  5.9999999999999995e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  35.1 
 
 
680 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4098  efflux transporter  36.5 
 
 
693 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870113  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  31.99 
 
 
697 aa  303  6.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  36.19 
 
 
679 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  35.15 
 
 
680 aa  281  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  32.39 
 
 
681 aa  280  6e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2406  fusaric acid resistance protein region  35.01 
 
 
690 aa  280  9e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.05 
 
 
688 aa  271  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.48 
 
 
692 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  29.87 
 
 
713 aa  243  7e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  28.76 
 
 
702 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.52 
 
 
697 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3501  fusaric acid resistance protein region  32.18 
 
 
639 aa  222  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  28.77 
 
 
704 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0110  fusaric acid resistance protein, putative  30.07 
 
 
749 aa  208  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.8 
 
 
653 aa  204  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3170  fusaric acid resistance protein region  28.95 
 
 
716 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.841968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  28.3 
 
 
676 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  25.13 
 
 
670 aa  140  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  27.65 
 
 
662 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  26.94 
 
 
662 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  29.13 
 
 
662 aa  137  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  43.71 
 
 
664 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  26.62 
 
 
662 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  26.11 
 
 
726 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  26.68 
 
 
679 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  42.38 
 
 
664 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  26.89 
 
 
679 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  28.25 
 
 
676 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  24.91 
 
 
699 aa  125  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  29.01 
 
 
673 aa  124  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  29.01 
 
 
673 aa  124  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  29.01 
 
 
673 aa  124  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  24.31 
 
 
691 aa  124  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.57 
 
 
699 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6856  fusaric acid resistance protein  25.33 
 
 
700 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  26.61 
 
 
736 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  25.26 
 
 
726 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.4 
 
 
739 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  25.41 
 
 
744 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03100  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  22.76 
 
 
655 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03051  hypothetical protein  22.76 
 
 
655 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0466  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  22.74 
 
 
655 aa  114  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3723  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  22.74 
 
 
655 aa  114  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0466  Fusaric acid resistance protein conserved region  22.74 
 
 
655 aa  114  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  22.55 
 
 
655 aa  114  8.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  22.74 
 
 
655 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4042  fusaric acid resistance protein region  26.86 
 
 
727 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4324  fusaric acid resistance protein region  26.86 
 
 
727 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  22.74 
 
 
655 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  22.74 
 
 
655 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3197  fusaric acid resistance protein region  27.2 
 
 
727 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.01 
 
 
653 aa  113  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3627  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  21.87 
 
 
655 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.35242  normal  0.2133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  21.87 
 
 
655 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.269228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3555  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  21.87 
 
 
655 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  21.87 
 
 
655 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.374606  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  25.22 
 
 
724 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3662  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  21.87 
 
 
655 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250155  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.51 
 
 
722 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  25.39 
 
 
724 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  26.05 
 
 
725 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  26.74 
 
 
730 aa  109  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1802  fusaric acid resistance protein region  24.41 
 
 
677 aa  109  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  26.05 
 
 
725 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1682  fusaric acid resistance protein  25.99 
 
 
727 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158795  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1401  fusaric acid resistance protein region  25.64 
 
 
714 aa  107  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4286  fusaric acid resistance protein region  26.89 
 
 
727 aa  107  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.566792 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3677  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  22.24 
 
 
655 aa  107  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  26.99 
 
 
725 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  24.39 
 
 
733 aa  105  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  26.01 
 
 
725 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  25.25 
 
 
711 aa  104  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4213  fusaric acid resistance protein region  26.53 
 
 
726 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>