225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0939 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  53.84 
 
 
725 aa  763    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  75.52 
 
 
725 aa  1113    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  76.2 
 
 
725 aa  1112    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  72.59 
 
 
728 aa  1010    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  50.83 
 
 
744 aa  678    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  56.24 
 
 
732 aa  796    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  73 
 
 
729 aa  1044    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  49.79 
 
 
733 aa  672    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  75.1 
 
 
725 aa  1112    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 
730 aa  1481    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  49.58 
 
 
734 aa  672    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  50.57 
 
 
733 aa  641    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  50.5 
 
 
733 aa  643    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  51.12 
 
 
736 aa  697    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  50.07 
 
 
734 aa  655    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  49.93 
 
 
733 aa  669    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  63.04 
 
 
731 aa  905    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  56.1 
 
 
731 aa  795    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  50.07 
 
 
734 aa  655    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  50.14 
 
 
734 aa  662    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  51.89 
 
 
739 aa  696    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  75.52 
 
 
725 aa  1113    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  62.9 
 
 
731 aa  895    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  49.78 
 
 
733 aa  631  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  49.78 
 
 
733 aa  631  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  49.78 
 
 
733 aa  631  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  49.78 
 
 
733 aa  631  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  49.78 
 
 
733 aa  632  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  49.78 
 
 
733 aa  631  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  49.78 
 
 
733 aa  631  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  41.8 
 
 
726 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  41.83 
 
 
722 aa  501  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4213  fusaric acid resistance protein region  39.95 
 
 
726 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260755 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3739  fusaric acid resistance protein region  39.67 
 
 
726 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.7262  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0595  fusaric acid resistance domain-containing protein  40.34 
 
 
745 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2328  fusaric acid resistance domain-containing protein  40.34 
 
 
745 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4042  fusaric acid resistance protein region  39.94 
 
 
727 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4324  fusaric acid resistance protein region  39.94 
 
 
727 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0873  fusaric acid resistance domain-containing protein  40.34 
 
 
745 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1110  putative fusaric acid resistance protein  40.34 
 
 
745 aa  465  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.853894  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1024  putative fusaric acid resistance protein  40.34 
 
 
745 aa  465  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1840  fusaric acid resistance domain-containing protein  40.34 
 
 
745 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3197  fusaric acid resistance protein region  39.34 
 
 
727 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1682  fusaric acid resistance protein  39.66 
 
 
727 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158795  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4286  fusaric acid resistance protein region  40.61 
 
 
727 aa  459  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.566792 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1647  fusaric acid resistance domain-containing protein  40.83 
 
 
743 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0396  aromatic acid (fusaric acid) exporter, (ArAE)family  39.72 
 
 
727 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  34.76 
 
 
726 aa  382  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4279  putative fusaric acid resistance protein  33.71 
 
 
728 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  30.94 
 
 
727 aa  318  3e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1863  hypothetical protein  42.57 
 
 
411 aa  280  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5713  fusaric acid resistance protein region  29.19 
 
 
750 aa  252  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  0.787817 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  29.42 
 
 
676 aa  195  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  29.1 
 
 
673 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  29.1 
 
 
673 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  29.1 
 
 
673 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  29.53 
 
 
676 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  28.35 
 
 
664 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  28.86 
 
 
676 aa  178  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  26.63 
 
 
670 aa  166  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  27.1 
 
 
676 aa  164  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  27.63 
 
 
662 aa  161  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  27.46 
 
 
662 aa  161  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.8 
 
 
688 aa  154  5e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1250  hypothetical protein  26.62 
 
 
690 aa  154  8e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  26.58 
 
 
702 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  26.74 
 
 
662 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  40.09 
 
 
664 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0484  fusaric acid resistance protein region  27.2 
 
 
679 aa  150  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.122808  normal  0.212474 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  26.39 
 
 
713 aa  150  9e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  27.19 
 
 
662 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  26.73 
 
 
711 aa  148  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1401  fusaric acid resistance protein region  25.12 
 
 
714 aa  148  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  27.15 
 
 
699 aa  145  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  26.71 
 
 
659 aa  145  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  26.39 
 
 
704 aa  144  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  26.36 
 
 
724 aa  144  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2636  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.68 
 
 
741 aa  143  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.58 
 
 
700 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.02 
 
 
653 aa  142  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  26.43 
 
 
700 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  26.27 
 
 
724 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.19 
 
 
670 aa  138  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.9 
 
 
680 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.91 
 
 
692 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  27.56 
 
 
679 aa  134  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.04 
 
 
653 aa  134  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.37 
 
 
699 aa  133  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  23.6 
 
 
697 aa  132  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  22.77 
 
 
698 aa  131  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7722  fusaric acid resistance protein  27.71 
 
 
710 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  25.39 
 
 
718 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.19 
 
 
697 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.54 
 
 
672 aa  129  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  25.44 
 
 
691 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  25.05 
 
 
687 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  24.78 
 
 
691 aa  127  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2357  fusaric acid resistance domain protein  26.05 
 
 
663 aa  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000905484  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  49.62 
 
 
679 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  46.76 
 
 
679 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>