232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1046 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  60.06 
 
 
731 aa  858    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  48.02 
 
 
744 aa  647    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  69.17 
 
 
725 aa  1005    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  95.18 
 
 
728 aa  1323    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 
729 aa  1475    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  73 
 
 
730 aa  1077    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  47.46 
 
 
734 aa  636    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  69.68 
 
 
725 aa  1001    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  48.31 
 
 
736 aa  655    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  53.05 
 
 
725 aa  722    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  48.43 
 
 
733 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  60.47 
 
 
731 aa  866    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  49.16 
 
 
739 aa  662    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  56.86 
 
 
731 aa  792    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  48.29 
 
 
733 aa  641    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  56.74 
 
 
732 aa  792    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  68.33 
 
 
725 aa  998    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  69.17 
 
 
725 aa  1005    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  48.37 
 
 
734 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  48.42 
 
 
734 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  48.42 
 
 
734 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  47.52 
 
 
733 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  46.73 
 
 
733 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  46.6 
 
 
733 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  47.73 
 
 
733 aa  600  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  46.73 
 
 
733 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  46.73 
 
 
733 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  46.73 
 
 
733 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  46.73 
 
 
733 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  46.73 
 
 
733 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  41.25 
 
 
726 aa  521  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  39.86 
 
 
722 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4213  fusaric acid resistance protein region  40.54 
 
 
726 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260755 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3739  fusaric acid resistance protein region  40.4 
 
 
726 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.7262  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4286  fusaric acid resistance protein region  41.33 
 
 
727 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.566792 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4042  fusaric acid resistance protein region  40.88 
 
 
727 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4324  fusaric acid resistance protein region  40.88 
 
 
727 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1110  putative fusaric acid resistance protein  41.31 
 
 
745 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.853894  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0595  fusaric acid resistance domain-containing protein  41.31 
 
 
745 aa  479  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3197  fusaric acid resistance protein region  40.74 
 
 
727 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2328  fusaric acid resistance domain-containing protein  41.31 
 
 
745 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1682  fusaric acid resistance protein  40.68 
 
 
727 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158795  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0873  fusaric acid resistance domain-containing protein  41.31 
 
 
745 aa  479  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1024  putative fusaric acid resistance protein  41.31 
 
 
745 aa  479  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1840  fusaric acid resistance domain-containing protein  41.31 
 
 
745 aa  479  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1647  fusaric acid resistance domain-containing protein  41.07 
 
 
743 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0396  aromatic acid (fusaric acid) exporter, (ArAE)family  37.89 
 
 
727 aa  425  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  33.61 
 
 
726 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4279  putative fusaric acid resistance protein  31.48 
 
 
728 aa  318  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  33.56 
 
 
727 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1863  hypothetical protein  43.58 
 
 
411 aa  272  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5713  fusaric acid resistance protein region  30.33 
 
 
750 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  0.787817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  29.93 
 
 
664 aa  200  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  30.1 
 
 
664 aa  191  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  30.76 
 
 
676 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  29.12 
 
 
676 aa  188  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  30.86 
 
 
679 aa  187  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  30.99 
 
 
679 aa  184  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  31.3 
 
 
673 aa  178  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  31.3 
 
 
673 aa  178  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  31.3 
 
 
673 aa  178  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  30.02 
 
 
662 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  29.73 
 
 
662 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  29.32 
 
 
676 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  29.37 
 
 
676 aa  171  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  29.85 
 
 
662 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6856  fusaric acid resistance protein  25.99 
 
 
700 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  27.98 
 
 
702 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  28.68 
 
 
724 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  28.37 
 
 
662 aa  157  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  26.84 
 
 
670 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  28.92 
 
 
711 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  24.51 
 
 
697 aa  151  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2636  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.27 
 
 
741 aa  150  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  27.26 
 
 
704 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  27.63 
 
 
724 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  25.46 
 
 
698 aa  148  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  27.9 
 
 
691 aa  148  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1401  fusaric acid resistance protein region  26.8 
 
 
714 aa  149  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.31 
 
 
697 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  26.17 
 
 
713 aa  147  6e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.32 
 
 
672 aa  147  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.06 
 
 
653 aa  143  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.45 
 
 
688 aa  142  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.1 
 
 
700 aa  138  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  27 
 
 
692 aa  136  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  26.32 
 
 
700 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.17 
 
 
699 aa  134  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  27.79 
 
 
679 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  27.84 
 
 
699 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  26.28 
 
 
718 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2357  fusaric acid resistance domain protein  27.13 
 
 
663 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000905484  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1837  fusaric acid resistance domain protein  27.21 
 
 
670 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235624  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.9 
 
 
680 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1984  fusaric acid resistance protein region  27.13 
 
 
670 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0152424  hitchhiker  0.000622676 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1553  fusaric acid resistance domain-containing protein  26.97 
 
 
670 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.266646  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1995  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.13 
 
 
670 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000064393  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1722  fusaric acid resistance domain-containing protein  27.13 
 
 
670 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01615  conserved inner membrane protein  26.97 
 
 
670 aa  128  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.174689  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1856  fusaric acid resistance domain-containing protein  26.97 
 
 
670 aa  128  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0794628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>