218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4267 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  94.86 
 
 		 662 aa  1199    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  90.63 
 
 		 676 aa  1172    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 		 662 aa  1305    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  62.84 
 
 		 662 aa  706    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  94.86 
 
 		 662 aa  1191    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  53.54 
 
 		 664 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  53.85 
 
 		 664 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  47.79 
 
 		 679 aa  492  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  48.09 
 
 		 679 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  34.46 
 
 		 691 aa  313  4.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  33.8 
 
 		 676 aa  228  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  28.93 
 
 		 736 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  34.73 
 
 		 673 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  34.73 
 
 		 673 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  34.73 
 
 		 673 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.24 
 
 		 739 aa  218  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  29.3 
 
 		 744 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4282  fusaric acid resistance protein region  29.18 
 
 		 711 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4234  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.18 
 
 		 690 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0118  fusaric acid resistance protein region  29.03 
 
 		 690 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.429698  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4422  fusaric acid resistance protein region  29.03 
 
 		 690 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  26.23 
 
 		 726 aa  192  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  28.15 
 
 		 733 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  27.98 
 
 		 733 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  30.1 
 
 		 729 aa  191  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  28.03 
 
 		 730 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.38 
 
 		 699 aa  189  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  30.86 
 
 		 731 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  28.29 
 
 		 733 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  30.12 
 
 		 711 aa  188  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  30.23 
 
 		 732 aa  187  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.11 
 
 		 653 aa  187  6e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  27.47 
 
 		 733 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  27.47 
 
 		 733 aa  185  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  31.97 
 
 		 724 aa  185  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  27.47 
 
 		 733 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  27.47 
 
 		 733 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  27.67 
 
 		 733 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  27.47 
 
 		 733 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  27.47 
 
 		 733 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  27.89 
 
 		 734 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  28.3 
 
 		 713 aa  183  9.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  27.06 
 
 		 725 aa  183  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  29.26 
 
 		 728 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  27.23 
 
 		 733 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  27.89 
 
 		 734 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  27.89 
 
 		 734 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  30.24 
 
 		 725 aa  182  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  27.06 
 
 		 725 aa  183  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1292  fusaric acid resistance protein region  27.61 
 
 		 681 aa  182  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.944306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.71 
 
 		 692 aa  181  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  28.15 
 
 		 734 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  32.06 
 
 		 724 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  27.92 
 
 		 725 aa  180  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  27.22 
 
 		 725 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  27.24 
 
 		 726 aa  174  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.71 
 
 		 672 aa  172  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  28.24 
 
 		 659 aa  169  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  28.98 
 
 		 731 aa  169  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1175  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  29.18 
 
 		 651 aa  167  8e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193331 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0421  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  29.18 
 
 		 651 aa  167  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0485  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  29.18 
 
 		 651 aa  167  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.93 
 
 		 722 aa  167  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  27.03 
 
 		 695 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6856  fusaric acid resistance protein  27.82 
 
 		 700 aa  165  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  28.76 
 
 		 731 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  27.95 
 
 		 681 aa  162  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  26.52 
 
 		 695 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  26.52 
 
 		 695 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  25.37 
 
 		 698 aa  159  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  28.12 
 
 		 727 aa  159  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.83 
 
 		 697 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.38 
 
 		 670 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1250  hypothetical protein  27.61 
 
 		 690 aa  157  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.53 
 
 		 680 aa  156  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3501  fusaric acid resistance protein region  32.76 
 
 		 639 aa  156  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  25.18 
 
 		 670 aa  155  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  27.26 
 
 		 682 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  25.12 
 
 		 702 aa  154  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  26.27 
 
 		 695 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  23.42 
 
 		 697 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0396  aromatic acid (fusaric acid) exporter, (ArAE)family  26.67 
 
 		 727 aa  152  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03100  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  26.91 
 
 		 655 aa  150  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03051  hypothetical protein  26.91 
 
 		 655 aa  150  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  27.01 
 
 		 687 aa  150  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  30.97 
 
 		 679 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  26.72 
 
 		 655 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.69 
 
 		 653 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0466  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.72 
 
 		 655 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3723  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  26.72 
 
 		 655 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  26.72 
 
 		 655 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  26.72 
 
 		 655 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  26.72 
 
 		 655 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0466  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  26.72 
 
 		 655 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3618  hypothetical protein  26.71 
 
 		 688 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.94953  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5713  fusaric acid resistance protein region  25.37 
 
 		 750 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  0.787817 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  28.22 
 
 		 699 aa  146  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  26.85 
 
 		 704 aa  145  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2406  fusaric acid resistance protein region  29.39 
 
 		 690 aa  144  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3378  fusaric acid resistance protein region  27.13 
 
 		 695 aa  143  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926577  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>