199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0134 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 
681 aa  1374    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  50.37 
 
 
680 aa  600  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2406  fusaric acid resistance protein region  48.97 
 
 
690 aa  532  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  43.85 
 
 
680 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  44.4 
 
 
679 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  41.2 
 
 
688 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  38.02 
 
 
670 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  38.11 
 
 
679 aa  388  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  36.36 
 
 
698 aa  372  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  36.05 
 
 
697 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  35.7 
 
 
691 aa  365  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  34.34 
 
 
659 aa  362  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  37.11 
 
 
692 aa  349  8e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  33.24 
 
 
718 aa  346  8e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  36.89 
 
 
687 aa  345  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5771  fusaric acid resistance protein region  35.53 
 
 
719 aa  343  8e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6015  fusaric acid resistance protein region  35.22 
 
 
713 aa  340  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7722  fusaric acid resistance protein  33.84 
 
 
710 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  34.75 
 
 
700 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6148  fusaric acid resistance protein region  33.85 
 
 
710 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.623711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.24 
 
 
700 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.35 
 
 
697 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6657  fusaric acid resistance protein region  35.38 
 
 
707 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5813  fusaric acid resistance protein region  35.38 
 
 
707 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6177  fusaric acid resistance protein region  35.38 
 
 
707 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717344  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.68 
 
 
672 aa  320  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3170  fusaric acid resistance protein region  32.98 
 
 
716 aa  318  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.841968 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  34.07 
 
 
682 aa  313  7.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  33.44 
 
 
702 aa  313  9e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  32.23 
 
 
695 aa  308  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  35.54 
 
 
704 aa  306  7e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  32.09 
 
 
695 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  32.19 
 
 
695 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0110  fusaric acid resistance protein, putative  32.38 
 
 
749 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  36.23 
 
 
713 aa  302  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  32.39 
 
 
695 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3618  hypothetical protein  33.24 
 
 
688 aa  299  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.94953  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  32.14 
 
 
687 aa  299  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3378  fusaric acid resistance protein region  32.61 
 
 
695 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926577  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  33.88 
 
 
625 aa  289  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  32.76 
 
 
653 aa  265  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3501  fusaric acid resistance protein region  34.37 
 
 
639 aa  257  5e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4098  efflux transporter  32.93 
 
 
693 aa  238  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  29.98 
 
 
664 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  27.49 
 
 
676 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  30.78 
 
 
676 aa  173  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  26.34 
 
 
726 aa  170  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  26.19 
 
 
727 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  31.33 
 
 
673 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  31.33 
 
 
673 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  31.33 
 
 
673 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  27.24 
 
 
736 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  27.59 
 
 
662 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.71 
 
 
739 aa  159  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  28.35 
 
 
662 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  27.95 
 
 
662 aa  158  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  23.37 
 
 
670 aa  154  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  28.74 
 
 
676 aa  151  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  25.72 
 
 
744 aa  150  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  26.19 
 
 
730 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  28.35 
 
 
676 aa  148  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.62 
 
 
722 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  27.98 
 
 
724 aa  143  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  27.2 
 
 
711 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  27.29 
 
 
734 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  27.29 
 
 
734 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  28.33 
 
 
662 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  27.4 
 
 
724 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  27.29 
 
 
734 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  25.54 
 
 
725 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  25.54 
 
 
725 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  27.09 
 
 
733 aa  140  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  27.09 
 
 
733 aa  140  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  27.09 
 
 
733 aa  140  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  27.09 
 
 
733 aa  140  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  27.09 
 
 
733 aa  140  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  27.09 
 
 
733 aa  140  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  27.09 
 
 
733 aa  140  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  27.15 
 
 
679 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  25.44 
 
 
734 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  45.1 
 
 
664 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  26.88 
 
 
726 aa  138  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  26.45 
 
 
733 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  25.18 
 
 
725 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  27.27 
 
 
679 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  26.54 
 
 
699 aa  134  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  25.87 
 
 
691 aa  134  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.62 
 
 
699 aa  134  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  25.18 
 
 
725 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  26.97 
 
 
731 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03100  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  25.28 
 
 
655 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03051  hypothetical protein  25.28 
 
 
655 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  26.97 
 
 
732 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  26.4 
 
 
725 aa  129  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3677  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25 
 
 
655 aa  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0466  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.7 
 
 
655 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.7 
 
 
655 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0466  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.7 
 
 
655 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.61 
 
 
655 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3723  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.7 
 
 
655 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>