192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0273 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03100  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  62.99 
 
 
655 aa  821    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0466  Fusaric acid resistance protein conserved region  62.99 
 
 
655 aa  821    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3825  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  64.36 
 
 
649 aa  835    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3627  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  62.21 
 
 
655 aa  795    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.35242  normal  0.2133 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03051  hypothetical protein  62.99 
 
 
655 aa  821    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0273  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  100 
 
 
662 aa  1355    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.489457  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  62.99 
 
 
655 aa  821    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3723  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  62.99 
 
 
655 aa  820    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0485  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  64.56 
 
 
651 aa  877    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4390  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  60.09 
 
 
655 aa  771    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  62.21 
 
 
655 aa  795    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.269228 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0466  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  62.99 
 
 
655 aa  820    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  62.83 
 
 
655 aa  819    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  62.21 
 
 
655 aa  795    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.374606  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3662  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  62.21 
 
 
655 aa  794    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250155  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1175  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  64.56 
 
 
651 aa  877    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193331 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3555  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  62.05 
 
 
655 aa  791    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3677  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  62.83 
 
 
655 aa  818    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3667  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  60.87 
 
 
651 aa  775    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0421  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  64.56 
 
 
651 aa  877    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0264  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  85.8 
 
 
662 aa  1165    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  63.14 
 
 
655 aa  822    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  62.67 
 
 
655 aa  816    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  26.52 
 
 
679 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  25.93 
 
 
699 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  27.65 
 
 
679 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  26.6 
 
 
664 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  27.34 
 
 
662 aa  135  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  26.37 
 
 
664 aa  134  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  24.57 
 
 
676 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  22.53 
 
 
670 aa  124  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  24.86 
 
 
662 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  24.24 
 
 
662 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.76 
 
 
692 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  24.77 
 
 
662 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.9 
 
 
672 aa  114  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  23.38 
 
 
691 aa  109  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  23.57 
 
 
697 aa  105  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  23.71 
 
 
724 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.88 
 
 
700 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  22.24 
 
 
730 aa  101  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  22.68 
 
 
695 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  24.52 
 
 
744 aa  98.6  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  23.32 
 
 
673 aa  98.6  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  22.43 
 
 
731 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  23.32 
 
 
673 aa  98.6  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  23.32 
 
 
673 aa  98.6  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  23.03 
 
 
700 aa  98.2  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  24.63 
 
 
731 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  21.79 
 
 
695 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  20.93 
 
 
733 aa  96.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  35.33 
 
 
670 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  22.36 
 
 
713 aa  95.9  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4155  hypothetical protein  23.39 
 
 
672 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0306653  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  21.93 
 
 
732 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  23.49 
 
 
726 aa  95.5  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  23.52 
 
 
736 aa  95.5  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  23.49 
 
 
659 aa  95.5  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  24.34 
 
 
681 aa  95.5  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  22.24 
 
 
695 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  23.24 
 
 
698 aa  94.7  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  22.22 
 
 
733 aa  94.7  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  22.22 
 
 
733 aa  94.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  22.22 
 
 
733 aa  94.7  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  22.22 
 
 
733 aa  94.7  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  22.22 
 
 
733 aa  94.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  22.22 
 
 
733 aa  94.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  22.22 
 
 
733 aa  94.7  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  22.81 
 
 
653 aa  93.6  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  21.18 
 
 
687 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  22.77 
 
 
653 aa  93.2  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2357  fusaric acid resistance domain protein  23.65 
 
 
663 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000905484  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48340  hypothetical protein  22.42 
 
 
679 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00973423  normal  0.112211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  22.81 
 
 
711 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  24.43 
 
 
731 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  22.45 
 
 
680 aa  90.5  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4422  fusaric acid resistance protein region  23.68 
 
 
690 aa  90.5  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  23.29 
 
 
676 aa  90.5  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4234  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.68 
 
 
690 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  23.32 
 
 
676 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4282  fusaric acid resistance protein region  23.68 
 
 
711 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3501  fusaric acid resistance protein region  22.83 
 
 
639 aa  89  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  21.71 
 
 
722 aa  89  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0118  fusaric acid resistance protein region  23.68 
 
 
690 aa  89  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.429698  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  28.32 
 
 
724 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5952  membrane protein  24.53 
 
 
623 aa  88.2  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  21.61 
 
 
725 aa  87.4  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.43 
 
 
739 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  24.01 
 
 
729 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  24.62 
 
 
676 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1984  fusaric acid resistance protein region  23.14 
 
 
670 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0152424  hitchhiker  0.000622676 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01615  conserved inner membrane protein  23.14 
 
 
670 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.174689  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1995  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.14 
 
 
670 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000064393  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  21.36 
 
 
697 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1553  fusaric acid resistance domain-containing protein  23.14 
 
 
670 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.266646  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1856  fusaric acid resistance domain-containing protein  23.14 
 
 
670 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0794628  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1722  fusaric acid resistance domain-containing protein  23.14 
 
 
670 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  22.15 
 
 
625 aa  85.5  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1802  fusaric acid resistance protein region  21.07 
 
 
677 aa  84.3  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  25.36 
 
 
679 aa  84  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>