189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5715 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5715  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 
661 aa  1286    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0277565 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1306  fusaric acid resistance protein region  44.29 
 
 
644 aa  463  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.389506  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2071  hypothetical protein  37.03 
 
 
493 aa  263  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.555824 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2060  fusaric acid resistance protein region  30.62 
 
 
635 aa  208  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.065197  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.85 
 
 
641 aa  201  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2360  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.29 
 
 
639 aa  196  9e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0233  membrane protein-like  30.37 
 
 
653 aa  157  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5952  membrane protein  29.54 
 
 
623 aa  149  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1401  fusaric acid resistance protein region  26.97 
 
 
714 aa  124  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  25.31 
 
 
744 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  28.28 
 
 
731 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  27 
 
 
673 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  27 
 
 
673 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  27 
 
 
673 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  28.77 
 
 
676 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  26.4 
 
 
736 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  29.05 
 
 
725 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  28.14 
 
 
732 aa  112  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  29.44 
 
 
725 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  28.66 
 
 
725 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  29.44 
 
 
725 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.46 
 
 
739 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  28.52 
 
 
682 aa  106  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  27.18 
 
 
729 aa  106  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  26.57 
 
 
734 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  28.44 
 
 
724 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  26.57 
 
 
734 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  27.76 
 
 
676 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  26.27 
 
 
734 aa  104  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1250  hypothetical protein  27.48 
 
 
690 aa  103  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  25.4 
 
 
734 aa  102  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  25.24 
 
 
702 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.65 
 
 
699 aa  102  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  27.2 
 
 
676 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  27.44 
 
 
733 aa  100  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  25.24 
 
 
733 aa  100  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  25.51 
 
 
728 aa  100  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  27.99 
 
 
724 aa  100  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  25.64 
 
 
733 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.84 
 
 
672 aa  96.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  38.51 
 
 
653 aa  96.3  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.56 
 
 
653 aa  96.3  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  25.64 
 
 
725 aa  95.1  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  32.54 
 
 
730 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  38.78 
 
 
676 aa  93.6  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1808  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.4 
 
 
742 aa  89.4  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  28.54 
 
 
704 aa  89  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  24.75 
 
 
733 aa  88.2  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  36.84 
 
 
664 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  25.1 
 
 
733 aa  87.8  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  25.1 
 
 
733 aa  87.8  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  25.1 
 
 
733 aa  87.8  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  25.1 
 
 
733 aa  87.8  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  25.1 
 
 
733 aa  87.8  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  25.1 
 
 
733 aa  87.8  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  25.1 
 
 
733 aa  87.8  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  40.3 
 
 
679 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  35.53 
 
 
664 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  37.24 
 
 
713 aa  85.5  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  23.71 
 
 
731 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  24.9 
 
 
697 aa  84.7  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  33.75 
 
 
726 aa  84.3  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  34 
 
 
670 aa  84  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4756  fusaric acid resistance protein region  35 
 
 
678 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361861  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.62 
 
 
697 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5223  Fusaric acid resistance protein conserved region  35 
 
 
678 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0716017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4155  hypothetical protein  27.05 
 
 
672 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0306653  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0484  fusaric acid resistance protein region  25.15 
 
 
679 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.122808  normal  0.212474 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  26.55 
 
 
691 aa  82.8  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  23.54 
 
 
731 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  26.21 
 
 
662 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5298  Fusaric acid resistance protein conserved region  35 
 
 
678 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.812245  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  26.5 
 
 
699 aa  80.5  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  36.2 
 
 
711 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  23.69 
 
 
727 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  32.89 
 
 
726 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  25.7 
 
 
625 aa  78.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  25.29 
 
 
698 aa  77.8  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.35 
 
 
692 aa  77.4  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  25.11 
 
 
687 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  26.4 
 
 
662 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  26.46 
 
 
662 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  28.07 
 
 
670 aa  76.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5713  fusaric acid resistance protein region  25.08 
 
 
750 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  0.787817 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0485  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  22.35 
 
 
651 aa  74.3  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1175  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  22.35 
 
 
651 aa  74.3  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193331 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0421  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  22.35 
 
 
651 aa  74.3  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  25.05 
 
 
695 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  25.16 
 
 
695 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  25.05 
 
 
659 aa  73.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.5 
 
 
688 aa  72  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4390  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  21.19 
 
 
655 aa  72  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  25.37 
 
 
695 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2636  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.55 
 
 
741 aa  71.6  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4279  putative fusaric acid resistance protein  24.49 
 
 
728 aa  70.9  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4282  fusaric acid resistance protein region  21.46 
 
 
711 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  24.89 
 
 
695 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1647  fusaric acid resistance domain-containing protein  33.33 
 
 
743 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3501  fusaric acid resistance protein region  38.93 
 
 
639 aa  69.3  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.37 
 
 
722 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>