199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1540 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1540  Fusaric acid resistance protein conserved region  100 
 
 		 683 aa  1330    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.17 
 
 		 697 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  26.54 
 
 		 702 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  30.85 
 
 		 676 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1401  fusaric acid resistance protein region  27.96 
 
 		 714 aa  127  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  28.51 
 
 		 704 aa  126  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  28.19 
 
 		 679 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1250  hypothetical protein  28.44 
 
 		 690 aa  125  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.6 
 
 		 733 aa  117  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  26.82 
 
 		 726 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  29.01 
 
 		 676 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  28.24 
 
 		 733 aa  115  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  28.24 
 
 		 733 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  28.24 
 
 		 733 aa  115  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  28.24 
 
 		 733 aa  115  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.24 
 
 		 733 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  28.24 
 
 		 733 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  28.24 
 
 		 733 aa  115  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  29.19 
 
 		 731 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  28.71 
 
 		 732 aa  114  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2636  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.16 
 
 		 741 aa  114  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  24.62 
 
 		 691 aa  112  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  27.9 
 
 		 725 aa  111  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  27.14 
 
 		 664 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  25.64 
 
 		 729 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.5 
 
 		 688 aa  107  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.99 
 
 		 653 aa  106  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6856  fusaric acid resistance protein  27.14 
 
 		 700 aa  105  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0264  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  26.3 
 
 		 662 aa  103  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  26.06 
 
 		 728 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  28.27 
 
 		 726 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  22.92 
 
 		 670 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  25.38 
 
 		 733 aa  102  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  28.76 
 
 		 662 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0484  fusaric acid resistance protein region  27.76 
 
 		 679 aa  101  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.122808  normal  0.212474 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  24.41 
 
 		 691 aa  100  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1808  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.61 
 
 		 742 aa  100  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  25.19 
 
 		 730 aa  99  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  27.8 
 
 		 662 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1306  fusaric acid resistance protein region  27.16 
 
 		 644 aa  99.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.389506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  25.97 
 
 		 734 aa  98.6  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  39.13 
 
 		 676 aa  97.8  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  39.13 
 
 		 676 aa  97.4  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.49 
 
 		 699 aa  96.7  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  37.89 
 
 		 673 aa  94.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  37.89 
 
 		 673 aa  94.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  37.89 
 
 		 673 aa  94.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1175  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.22 
 
 		 651 aa  94.7  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193331 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  27.74 
 
 		 731 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0485  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.22 
 
 		 651 aa  94.7  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0421  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.22 
 
 		 651 aa  94.7  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  28.32 
 
 		 731 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5298  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.3 
 
 		 678 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.812245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  26.58 
 
 		 725 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  26.58 
 
 		 725 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  28.11 
 
 		 662 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5223  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.96 
 
 		 678 aa  90.9  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0716017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  26.02 
 
 		 725 aa  90.5  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  23.38 
 
 		 687 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  39.57 
 
 		 679 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1802  fusaric acid resistance protein region  25.05 
 
 		 677 aa  89.7  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  32 
 
 		 724 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.12 
 
 		 680 aa  88.6  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4756  fusaric acid resistance protein region  28.96 
 
 		 678 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.15 
 
 		 655 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0466  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.15 
 
 		 655 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.15 
 
 		 655 aa  86.7  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.15 
 
 		 655 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3723  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.15 
 
 		 655 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1551  fusaric acid resistance domain protein  24.48 
 
 		 679 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  30.86 
 
 		 724 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1902  fusaric acid resistance domain-containing protein  24.31 
 
 		 679 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.48277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4286  fusaric acid resistance protein region  26.79 
 
 		 727 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.566792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1538  fusaric acid resistance domain protein  24.48 
 
 		 679 aa  84.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0513426  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0466  Fusaric acid resistance protein conserved region  22.96 
 
 		 655 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1611  fusaric acid resistance domain-containing protein  24.13 
 
 		 679 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.461133  normal  0.751418 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.22 
 
 		 653 aa  84  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3825  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.44 
 
 		 649 aa  83.6  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  33.33 
 
 		 711 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0273  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.05 
 
 		 662 aa  82.4  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.489457  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1733  fusaric acid resistance domain protein  24.13 
 
 		 679 aa  82.4  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105287  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  34.97 
 
 		 725 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2360  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.66 
 
 		 639 aa  81.3  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3677  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.32 
 
 		 655 aa  80.9  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  38.16 
 
 		 664 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03100  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  24.04 
 
 		 655 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03051  hypothetical protein  24.04 
 
 		 655 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  34.38 
 
 		 744 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.85 
 
 		 672 aa  79  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4279  putative fusaric acid resistance protein  24.51 
 
 		 728 aa  77.4  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  25.73 
 
 		 695 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  25.64 
 
 		 695 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48340  hypothetical protein  26.57 
 
 		 679 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00973423  normal  0.112211 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  23.57 
 
 		 699 aa  75.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  25.55 
 
 		 695 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  36.17 
 
 		 733 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2060  fusaric acid resistance protein region  30.69 
 
 		 635 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.065197  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5952  membrane protein  27.36 
 
 		 623 aa  75.1  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  36.84 
 
 		 733 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3555  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  31.18 
 
 		 655 aa  74.7  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>