More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03700 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_03700  choline/carnitine/betaine transport  100 
 
 		 600 aa  1197    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04020  choline/carnitine/betaine transport  58.07 
 
 		 609 aa  648    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0187444  normal  0.0477577 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2667  choline/carnitine/betaine transporter  71.57 
 
 		 606 aa  864    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3532  choline/carnitine/betaine transporter  60.62 
 
 		 556 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11170  dephospho-CoA kinase  49.73 
 
 		 789 aa  547  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.901477  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13950  choline/carnitine/betaine transport  52.55 
 
 		 568 aa  535  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3107  choline/carnitine/betaine transporter  49.9 
 
 		 539 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  43.43 
 
 		 657 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  44.04 
 
 		 659 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  44.04 
 
 		 659 aa  411  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  43.96 
 
 		 661 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  44.86 
 
 		 661 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  45.82 
 
 		 538 aa  405  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  39.41 
 
 		 660 aa  394  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  41.51 
 
 		 545 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  39.56 
 
 		 667 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  43.38 
 
 		 637 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1805  choline/carnitine/betaine transporter  44.01 
 
 		 664 aa  382  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.376035  hitchhiker  0.00814736 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  42.47 
 
 		 573 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04148  secondary glycine betaine transporter BetU  40.81 
 
 		 667 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  38.28 
 
 		 551 aa  373  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04111  hypothetical protein  40.81 
 
 		 667 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0154  choline/carnitine/betaine transporter  40.5 
 
 		 682 aa  374  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0764  transporter, BCCT family  40.81 
 
 		 667 aa  373  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.846408  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  41.1 
 
 		 567 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  40.68 
 
 		 606 aa  371  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  39.49 
 
 		 550 aa  370  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  40.83 
 
 		 541 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4850  BCCT family transporter  40.64 
 
 		 667 aa  371  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00270  choline transporter of high affinity  40.51 
 
 		 677 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3292  choline/carnitine/betaine transporter  40.51 
 
 		 677 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0376  choline transport protein BetT  40.51 
 
 		 677 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597337 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3309  choline transport protein BetT  40.51 
 
 		 677 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  38.96 
 
 		 656 aa  369  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1512  choline transport protein BetT  39.38 
 
 		 679 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0971262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  42.06 
 
 		 503 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0373  choline transport protein BetT  40.51 
 
 		 677 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.834443  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2645  choline transport protein BetT  39.65 
 
 		 684 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00290709  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0345  choline transport protein BetT  40.51 
 
 		 677 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00273  hypothetical protein  40.51 
 
 		 677 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0331  choline transport protein BetT  40.51 
 
 		 677 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  41.59 
 
 		 534 aa  366  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  38.72 
 
 		 542 aa  368  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  40.82 
 
 		 583 aa  368  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1174  choline transporter  36.24 
 
 		 671 aa  365  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  42.23 
 
 		 685 aa  365  2e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  41.7 
 
 		 506 aa  364  3e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  39.85 
 
 		 523 aa  362  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  40.07 
 
 		 682 aa  360  6e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  40.3 
 
 		 531 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0224  high-affinity choline transport protein  35.1 
 
 		 644 aa  357  2.9999999999999997e-97  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12990  choline transporter  37.41 
 
 		 653 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.283179 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3496  choline/carnitine/betaine transporter  36.67 
 
 		 724 aa  357  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.81429 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0421  choline/carnitine/betaine transporter  42.66 
 
 		 661 aa  357  3.9999999999999996e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.45567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  39.74 
 
 		 573 aa  357  5e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5269  choline transporter  37.01 
 
 		 664 aa  357  5e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3745  choline/carnitine/betaine transporter  37.95 
 
 		 724 aa  357  5e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1337  choline/carnitine/betaine transport  39.6 
 
 		 687 aa  356  5.999999999999999e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2828  choline transport protein BetT  40.08 
 
 		 682 aa  354  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  41.6 
 
 		 497 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2914  choline transport protein BetT  40.08 
 
 		 682 aa  354  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929761  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  38.66 
 
 		 646 aa  353  4e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4827  BCCT transporter  36.82 
 
 		 664 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.767861 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4336  choline/carnitine/betaine transporter  40 
 
 		 529 aa  353  5e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  40.04 
 
 		 508 aa  352  1e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3164  choline/carnitine/betaine transporter  40.5 
 
 		 660 aa  352  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  38.6 
 
 		 526 aa  351  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  38.91 
 
 		 530 aa  350  4e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1109  choline/carnitine/betaine transporter  40.19 
 
 		 676 aa  350  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507446  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  43.67 
 
 		 498 aa  350  5e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0247  BCCT transporter  37.08 
 
 		 666 aa  350  5e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.442957  normal  0.516419 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2557  choline transport protein BetT  39.34 
 
 		 677 aa  349  9e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  39.88 
 
 		 504 aa  348  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2792  choline/carnitine/betaine transporter  38.92 
 
 		 711 aa  349  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2741  choline/carnitine/betaine transporter  40.7 
 
 		 661 aa  348  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  39.46 
 
 		 505 aa  348  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  40.52 
 
 		 610 aa  348  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  39.69 
 
 		 504 aa  348  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  41.21 
 
 		 698 aa  347  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4280  choline/carnitine/betaine transporter  36.27 
 
 		 720 aa  347  3e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.692689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  40.04 
 
 		 583 aa  347  3e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1505  choline/carnitine/betaine transporter  40.99 
 
 		 668 aa  347  4e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  40.5 
 
 		 505 aa  346  6e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  40.5 
 
 		 505 aa  346  7e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  40.5 
 
 		 505 aa  346  7e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  40.8 
 
 		 582 aa  346  7e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  40.5 
 
 		 505 aa  346  7e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  40.8 
 
 		 582 aa  346  7e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2003  choline/carnitine/betaine transport family protein  41.92 
 
 		 535 aa  346  8.999999999999999e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  40.8 
 
 		 582 aa  346  8.999999999999999e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  41.12 
 
 		 490 aa  345  1e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  40.87 
 
 		 504 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0237  choline/carnitine/betaine transporter  41.13 
 
 		 550 aa  345  1e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000527978  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0240  choline/carnitine/betaine transporter  42.39 
 
 		 662 aa  344  2.9999999999999997e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  37.55 
 
 		 530 aa  343  5.999999999999999e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  37.97 
 
 		 577 aa  343  7e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  40.97 
 
 		 505 aa  343  7e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  36.83 
 
 		 544 aa  342  8e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  38.37 
 
 		 494 aa  342  9e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  39.1 
 
 		 538 aa  342  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>