More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1790 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1790  short chain dehydrogenase  100 
 
 
254 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1058  short chain dehydrogenase  82.21 
 
 
255 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0215  short chain dehydrogenase  82.21 
 
 
255 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.713684  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0047  short chain dehydrogenase  82.21 
 
 
257 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0370  short chain dehydrogenase  82.21 
 
 
257 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1715  short chain dehydrogenase  82.21 
 
 
255 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1628  short chain dehydrogenase  81.82 
 
 
255 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1215  short chain dehydrogenase  82.21 
 
 
257 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1195  short chain dehydrogenase  80.16 
 
 
255 aa  388  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0507386  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4056  short chain dehydrogenase  63.81 
 
 
257 aa  315  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7209  short chain dehydrogenase  63.04 
 
 
257 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0421  short chain dehydrogenase  63.42 
 
 
257 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4652  short chain dehydrogenase  46.64 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109281  normal  0.0540489 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6250  short chain dehydrogenase  44.66 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6621  short chain dehydrogenase  48.1 
 
 
258 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
259 aa  179  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5678  short chain dehydrogenase  44.29 
 
 
258 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
257 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
282 aa  142  4e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.451543 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0746  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.19 
 
 
257 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6108  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05365  acetoacetyl-CoA reductase  34.68 
 
 
268 aa  138  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.39 
 
 
245 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2700  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
268 aa  136  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.657901 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0631  acetoacetyl-CoA reductase  34.55 
 
 
246 aa  133  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.84 
 
 
247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2625  acetoacetyl-CoA reductase  33.33 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.32 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.824236  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000520  acetoacetyl-CoA reductase  33.47 
 
 
246 aa  130  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.61 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15322  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
255 aa  128  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1151  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.84 
 
 
234 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.256582 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.19 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1935  putative short-chain alcohol dehydrogenase  35.94 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000230306  normal  0.160662 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.57 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.824888  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.25 
 
 
247 aa  126  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2363  Short-chain dehydrogenase/reductase  36.71 
 
 
254 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.68 
 
 
249 aa  125  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 
249 aa  125  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0751362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
252 aa  125  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 
242 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.78 
 
 
247 aa  125  7e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1997  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.72 
 
 
259 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2000  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.72 
 
 
259 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0281  putative short-chain dehydrogenase, oxidoreductase  35.8 
 
 
257 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
264 aa  125  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
272 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3917  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.78 
 
 
260 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.283072  normal  0.0412818 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2305  hypothetical protein  33.19 
 
 
246 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
282 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458273  normal  0.643271 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
256 aa  123  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15900  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.84 
 
 
241 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.166031  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0620  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.98 
 
 
250 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.890979 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.88 
 
 
239 aa  124  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
275 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.388897 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1175  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30 
 
 
241 aa  123  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.267366  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
267 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
274 aa  123  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.709092  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
256 aa  122  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2571  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.51 
 
 
239 aa  122  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0716578  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
246 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0908  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36 
 
 
257 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
254 aa  122  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1589  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.44 
 
 
243 aa  122  6e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.511722  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.06 
 
 
248 aa  122  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1843  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.37 
 
 
234 aa  122  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136671  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.83 
 
 
263 aa  122  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0128625 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2690  short chain dehydrogenase  32.93 
 
 
255 aa  122  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
249 aa  122  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.506283  normal  0.100596 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0354  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.17 
 
 
240 aa  121  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679576  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 
258 aa  121  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
249 aa  121  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162054  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.51 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0972  putative short-chain dehydrogenase/reductase  35.94 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000126906  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1752  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351696  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6036  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.1 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0528417  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  32.79 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2319  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  32.93 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
252 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0620  hypothetical protein  38.33 
 
 
246 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 
243 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
257 aa  119  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.92 
 
 
246 aa  119  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5938  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.02 
 
 
234 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  decreased coverage  0.00196456 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.2 
 
 
246 aa  119  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.99 
 
 
248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21780  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.1 
 
 
242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>