More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1195 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1195  short chain dehydrogenase  100 
 
 
255 aa  497  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0507386  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1058  short chain dehydrogenase  95.29 
 
 
255 aa  474  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0215  short chain dehydrogenase  95.29 
 
 
255 aa  474  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.713684  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1215  short chain dehydrogenase  95.29 
 
 
257 aa  474  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1628  short chain dehydrogenase  94.9 
 
 
255 aa  474  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0047  short chain dehydrogenase  95.29 
 
 
257 aa  474  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0370  short chain dehydrogenase  95.29 
 
 
257 aa  474  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1715  short chain dehydrogenase  95.29 
 
 
255 aa  474  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1790  short chain dehydrogenase  82.14 
 
 
254 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0421  short chain dehydrogenase  63.92 
 
 
257 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7209  short chain dehydrogenase  63.53 
 
 
257 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4056  short chain dehydrogenase  63.14 
 
 
257 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6250  short chain dehydrogenase  45.67 
 
 
258 aa  199  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4652  short chain dehydrogenase  45.85 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109281  normal  0.0540489 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
257 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
259 aa  169  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6621  short chain dehydrogenase  45.54 
 
 
258 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5678  short chain dehydrogenase  45.27 
 
 
258 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0746  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.41 
 
 
257 aa  152  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2700  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.657901 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1175  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.98 
 
 
241 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.267366  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.08 
 
 
263 aa  132  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0128625 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05365  acetoacetyl-CoA reductase  34.84 
 
 
268 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.519285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
266 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000362562 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 
247 aa  128  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
282 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458273  normal  0.643271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  36.55 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1151  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.32 
 
 
234 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.256582 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000520  acetoacetyl-CoA reductase  34.84 
 
 
246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0631  acetoacetyl-CoA reductase  34.84 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1935  putative short-chain alcohol dehydrogenase  36.72 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000230306  normal  0.160662 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0751362 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.34 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
263 aa  126  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
254 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 
263 aa  126  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
249 aa  126  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.120513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
252 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.55845  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 
263 aa  126  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 
263 aa  126  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 
263 aa  126  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
255 aa  126  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15322  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
243 aa  126  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  36.55 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 
247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  36.55 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21780  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.18 
 
 
242 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15900  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.29 
 
 
241 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.166031  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1872  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.9 
 
 
241 aa  125  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.105262 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 
263 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 
263 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 
263 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 
263 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 
263 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 
249 aa  125  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0450975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
248 aa  125  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
251 aa  124  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0972  putative short-chain dehydrogenase/reductase  34.77 
 
 
268 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000126906  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 
255 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 
257 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
282 aa  123  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.451543 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2571  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.92 
 
 
239 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0716578  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
266 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  34.02 
 
 
259 aa  123  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1975  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.59 
 
 
252 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.636697  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
254 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0928  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
263 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
260 aa  122  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 
252 aa  122  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 
256 aa  122  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1843  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.89 
 
 
234 aa  122  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136671  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
249 aa  122  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 
239 aa  122  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.842348  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6108  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
255 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
258 aa  122  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.02 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470918  normal  0.546691 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5878  dehydrogenase  37.61 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.73 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.84 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2625  acetoacetyl-CoA reductase  32.39 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04660  2-hydroxycyclohexane-1-carbonyl-CoA dehydrogenase  35.8 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.77 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.97 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0732  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 
249 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0620  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.2 
 
 
250 aa  119  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.890979 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.388897 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2801  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.09 
 
 
249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>