More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7209 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7209  short chain dehydrogenase  100 
 
 
257 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0421  short chain dehydrogenase  94.94 
 
 
257 aa  470  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4056  short chain dehydrogenase  84.82 
 
 
257 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1628  short chain dehydrogenase  64.06 
 
 
255 aa  319  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1058  short chain dehydrogenase  64.06 
 
 
255 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0215  short chain dehydrogenase  64.06 
 
 
255 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.713684  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0047  short chain dehydrogenase  64.06 
 
 
257 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0370  short chain dehydrogenase  64.06 
 
 
257 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1715  short chain dehydrogenase  64.06 
 
 
255 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1215  short chain dehydrogenase  64.06 
 
 
257 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1790  short chain dehydrogenase  63.04 
 
 
254 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1195  short chain dehydrogenase  62.35 
 
 
255 aa  305  7e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0507386  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6250  short chain dehydrogenase  47.81 
 
 
258 aa  222  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4652  short chain dehydrogenase  46.22 
 
 
264 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109281  normal  0.0540489 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 
259 aa  179  5.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5678  short chain dehydrogenase  49.44 
 
 
258 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6621  short chain dehydrogenase  48.88 
 
 
258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04660  2-hydroxycyclohexane-1-carbonyl-CoA dehydrogenase  39.17 
 
 
261 aa  152  7e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6108  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
255 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15900  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.78 
 
 
241 aa  145  6e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.166031  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 
247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3915  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
255 aa  142  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0746  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.27 
 
 
257 aa  142  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.39 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
249 aa  139  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.519285 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  36.55 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  36.55 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  36.55 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2468  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  36 
 
 
256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000411328  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  36.55 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  36.55 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2625  acetoacetyl-CoA reductase  33.74 
 
 
248 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
282 aa  137  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.451543 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05365  acetoacetyl-CoA reductase  34.15 
 
 
268 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0354  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.27 
 
 
240 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679576  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
282 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0631  acetoacetyl-CoA reductase  34.41 
 
 
246 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
282 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.89 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3615  putative dehydrogenase  34.16 
 
 
291 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.427411  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  35.34 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0641  short chain dehydrogenase  38.17 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.88 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000520  acetoacetyl-CoA reductase  33.74 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 
256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
254 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21780  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.96 
 
 
242 aa  133  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 
260 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
245 aa  133  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15322  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0877  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.795083  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
282 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458273  normal  0.643271 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3534  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) reductase  35.92 
 
 
244 aa  132  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
249 aa  132  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.120513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  34.54 
 
 
263 aa  132  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2588  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.1 
 
 
248 aa  132  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 
263 aa  132  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
254 aa  132  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4775  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
249 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
263 aa  132  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0128625 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.15 
 
 
255 aa  132  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
251 aa  132  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
254 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
249 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
250 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
263 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  34.54 
 
 
263 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  34.54 
 
 
263 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  34.54 
 
 
263 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  34.54 
 
 
263 aa  132  7.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1843  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.29 
 
 
234 aa  131  9e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136671  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.24 
 
 
255 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
249 aa  131  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0450975 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal  0.103076 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553116  normal  0.644711 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20330  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.11 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 
249 aa  129  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
246 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
252 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
262 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
244 aa  130  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
254 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1671  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.74 
 
 
246 aa  129  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
254 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
269 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.368434  normal  0.604753 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.97 
 
 
271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.77933  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2788  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.743418 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  34.43 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1151  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.5 
 
 
234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.256582 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  34.14 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4826  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 
244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.806753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>