More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0631 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0631  acetoacetyl-CoA reductase  100 
 
 
246 aa  508  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000520  acetoacetyl-CoA reductase  82.52 
 
 
246 aa  427  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05365  acetoacetyl-CoA reductase  82.11 
 
 
268 aa  424  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2625  acetoacetyl-CoA reductase  63.93 
 
 
248 aa  328  3e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3122  acetoacetyl-CoA reductase  54.92 
 
 
246 aa  267  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.868541  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2997  acetoacetyl-CoA reductase  55.28 
 
 
241 aa  259  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.685049 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  49.18 
 
 
248 aa  253  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3865  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  50.41 
 
 
277 aa  252  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1610  acetoacetyl-CoA reductase  54.1 
 
 
247 aa  251  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.710856 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3107  acetoacetyl-CoA reductase  53.66 
 
 
240 aa  248  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  48.98 
 
 
252 aa  248  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0747  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  52.03 
 
 
240 aa  248  7e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2402  acetoacetyl-CoA reductase  52.03 
 
 
240 aa  248  7e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2467  acetoacetyl-CoA reductase  52.63 
 
 
241 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2347  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.65 
 
 
244 aa  244  6.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  51.22 
 
 
246 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4545  acetoacetyl-CoA reductase  47.97 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00570408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7613  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  52.44 
 
 
241 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  50 
 
 
246 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4412  acetoacetyl-CoA reductase  47.97 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3065  acetoacetyl-CoA reductase  47.54 
 
 
247 aa  243  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000577101  normal  0.0493909 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5342  acetoacetyl-CoA reductase  49.59 
 
 
251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0354  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  51.02 
 
 
240 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679576  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3689  acetoacetyl-CoA reductase  53.47 
 
 
241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2027  acetoacetyl-CoA reductase  51.82 
 
 
241 aa  241  6e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.631295  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  50 
 
 
247 aa  241  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3061  acetoacetyl-CoA reductase  52.03 
 
 
241 aa  240  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109458  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  50 
 
 
246 aa  239  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2560  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.46 
 
 
245 aa  239  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.562191  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  51.85 
 
 
248 aa  240  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1330  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  48.98 
 
 
240 aa  239  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0533  acetoacetyl-CoA reductase  52.44 
 
 
241 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3602  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.02 
 
 
245 aa  238  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0780439  normal  0.144025 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0181  acetoacetyl-CoA reductase  50.62 
 
 
246 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0243891 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0544  acetoacetyl-CoA reductase  47.56 
 
 
247 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.46 
 
 
245 aa  238  8e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.400825 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0426  acetoacetyl-CoA reductase  49.59 
 
 
241 aa  237  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.05 
 
 
245 aa  237  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.882283  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2341  acetyacetyl-CoA reductase  49.18 
 
 
246 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5895  acetoacetyl-CoA reductase  47.15 
 
 
248 aa  237  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210588 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23650  Acetoacetl-CoA reductase in PHB biosynthesis  50.61 
 
 
247 aa  237  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0971  acetyacetyl-CoA reductase  49.6 
 
 
246 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  47.54 
 
 
248 aa  236  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2823  acetoacetyl-CoA reductase  46.75 
 
 
247 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2293  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.18 
 
 
248 aa  236  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000712528  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  46.34 
 
 
264 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  46.34 
 
 
264 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2479  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.23 
 
 
245 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200677  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2690  acetoacetyl-CoA reductase  46.34 
 
 
247 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685514  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2573  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.18 
 
 
248 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000159991  hitchhiker  0.00324451 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1716  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.18 
 
 
248 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000469264  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  49.18 
 
 
246 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1719  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.18 
 
 
248 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131365  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5090  acetyacetyl-CoA reductase  48.4 
 
 
246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682377  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1759  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.18 
 
 
248 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000535211  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1131  acetoacetyl-CoA reductase  44.9 
 
 
248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735079  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6290  acetyacetyl-CoA reductase  48.8 
 
 
246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1789  acetyacetyl-CoA reductase  48.8 
 
 
246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1813  acetyacetyl-CoA reductase  48.8 
 
 
246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.486438 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4514  acetoacetyl-CoA reductase  49.8 
 
 
241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  48.57 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1582  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.77 
 
 
248 aa  232  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000004002  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1499  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.95 
 
 
248 aa  233  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000126797  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3819  acetoacetyl-CoA reductase  45.71 
 
 
248 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  normal  0.774133 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1980  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.18 
 
 
248 aa  233  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000830224  decreased coverage  0.000580002 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1700  acetyacetyl-CoA reductase  48.4 
 
 
246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5566  acetoacetyl-CoA reductase  44.9 
 
 
248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431609  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1333  acetoacetyl-CoA reductase  47.97 
 
 
248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1727  acetyacetyl-CoA reductase  48.4 
 
 
246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337687  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4345  acetoacetyl CoA reductase; poly-beta-hydroxybutyrate biosynthesis  49.39 
 
 
241 aa  232  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4287  acetoacetyl-CoA reductase  45.71 
 
 
248 aa  231  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250358  normal  0.289691 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2305  hypothetical protein  48.98 
 
 
246 aa  231  6e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2031  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.8 
 
 
245 aa  231  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3821  acetoacetyl-CoA reductase  49.8 
 
 
241 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6018  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  45.12 
 
 
247 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4149  acetoacetyl-CoA reductase  49.39 
 
 
241 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.738636 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1574  acetoacetyl-CoA reductase  50 
 
 
241 aa  231  9e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50991  normal  0.311491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5281  acetoacetyl-CoA reductase  50 
 
 
242 aa  230  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  47.95 
 
 
246 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5756  acetoacetyl-CoA reductase  47.13 
 
 
249 aa  230  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.788384  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2803  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.79 
 
 
245 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000483642 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  47.95 
 
 
246 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0924  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.38 
 
 
246 aa  230  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  47.95 
 
 
246 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  47.15 
 
 
247 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  47.95 
 
 
248 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  47.95 
 
 
246 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  47.95 
 
 
246 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  47.95 
 
 
246 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  47.95 
 
 
246 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4092  acetoacetyl-CoA reductase  47.97 
 
 
240 aa  229  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  47.95 
 
 
260 aa  229  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1247  acetoacetyl-CoA reductase  48.37 
 
 
241 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2776  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.95 
 
 
248 aa  229  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3668  acetoacetyl-CoA reductase  48.97 
 
 
242 aa  229  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.814536  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  47.2 
 
 
246 aa  228  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2396  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  47.54 
 
 
248 aa  228  7e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000542518  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2466  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  47.54 
 
 
248 aa  228  7e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000110753  hitchhiker  0.00140528 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2558  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  47.54 
 
 
248 aa  228  7e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000120967  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2753  acetoacetyl-CoA reductase  48.16 
 
 
240 aa  228  8e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>